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CNS2023-144039

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Biología molecular y celular

LAS ISLAS CPG (CGI) REPRESENTAN UNA CLASE IMPORTANTE DE SECUENCIAS DE ADN ASOCIADAS CON PROMOTORES DE GENES DE VERTEBRADOS DONDE SUS CARACTERISTICAS DE SECUENCIA LOS ADAPTAN PARA LA ACTIVIDAD TRANSCRIPCIONAL. LOS CGI SE PUEDEN IDE... ver más

01/01/2023

CSIC

200K€

Presupuesto del proyecto: 200K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2023-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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1 Participantes

CSIC

199.94K€ | Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 200K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LAS ISLAS CPG (CGI) REPRESENTAN UNA CLASE IMPORTANTE DE SECUENCIAS DE ADN ASOCIADAS CON PROMOTORES DE GENES DE VERTEBRADOS DONDE SUS CARACTERISTICAS DE SECUENCIA LOS ADAPTAN PARA LA ACTIVIDAD TRANSCRIPCIONAL. LOS CGI SE PUEDEN IDENTIFICAR SEGUN LA SECUENCIA DE ADN Y LOS DETERMINANTES DE LA CROMATINA, QUE INCLUYEN UN CONTENIDO ELEVADO DE CPG Y GC, FALTA DE METILACION DEL ADN (5MC), PRESENCIA DE TRIMETILACION EN LA LISINA 4 DE LA HISTONA H3 (H3K4ME3) Y ENRIQUECIMIENTO EN LOS SITIOS DE UNION DE FACTORES DE TRANSCRIPCION. 50-70% DE TODOS LOS PROMOTORES DE GENES DE VERTEBRADOS ANOTADOS SE ENCUENTRAN ASOCIADOS CON UN CGI, INCLUIDA LA MAYORIA DE LOS GENES DE MANTENIMIENTO. LOS GENOMAS DE VERTEBRADOS ESTAN FUERTEMENTE METILADOS, CON UN 80 % DE TODAS LAS DIADAS CPG QUE CONTIENEN 5MC. 5MC ES SUSCEPTIBLE A LA DESAMINACION ESPONTANEA A TIMIDINA, POR LO QUE LOS GENOMAS DE VERTEBRADOS SON POBRES EN CPG. UNA CARACTERISTICA IMPORTANTE DE LOS CGI ES QUE EN SU MAYORIA SON REFRACTARIOS A METILACION, LO QUE PUEDE EXPLICAR EN PARTE LA RETENCION DE LA DENSIDAD DE CPG EN ESTAS UBICACIONES GENOMICAS. EN HUMANOS, LA HIPERMETILACION DE CGI SE OBSERVA CON FRECUENCIA EN CELULAS CANCEROSAS Y SE HA DESCRITO EN CASI TODOS LOS TIPOS DE TUMORES. POR EL CONTRARIO, LA MAYORIA DE LOS GENOMAS DE INVERTEBRADOS ESTAN ESCASAMENTE METILADOS Y SE CARACTERIZAN POR LA DENSIDAD DE CPG EN LA FRECUENCIA ESPERADA. POR LO TANTO, NO SE HA CONSIDERADO MUCHO LA POSIBILIDAD DE QUE LOS GENOMAS DE INVERTEBRADOS CONTENGAN CGI. SIN EMBARGO, ALGUNOS ESTUDIOS HAN IDENTIFICADO CARACTERISTICAS SIMILARES A CGI EN INVERTEBRADOS COMO ESPONJAS O CEFALOCORDADOS. ADEMAS, UNA FAMILIA DE PROTEINAS QUE RECONOCEN ESPECIFICAMENTE A LAS CPG NO METILADAS Y QUE CONTIENEN UN DOMINIO CXXC ESTAN PROFUNDAMENTE CONSERVADAS EN LOS METAZOOS. COMPRENDER COMO SURGIERON Y EVOLUCIONARON LOS CGI PARA TENER UN SIGNIFICADO FUNCIONAL EN LOS ELEMENTOS REGULADORES DE GENES VERTEBRADOS REQUIERE ESTUDIOS GENOMICOS Y EPIGENOMICOS QUE INVOLUCREN DIVERSAS ESPECIES. PRESUMIMOS QUE LAS SECUENCIAS RICAS EN CPG CON ACTIVIDAD REGULADORA SON UNA CARACTERISTICA PROFUNDAMENTE CONSERVADA DE LOS GENOMAS DE LOS METAZOOS Y QUE EL ADVENIMIENTO DE LA HIPERMETILACION GENOMICA, QUE OCURRIO DURANTE LA TRANSICION DE INVERTEBRADO A VERTEBRADO, MOLDEO Y ADAPTO ADICIONALMENTE ESAS REGIONES PARA NUEVAS FUNCIONES REGULADORAS. EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTA PROPUESTA ES CARACTERIZAR EXHAUSTIVAMENTE SECUENCIAS SIMILARES A CGI EN LINAJES INVERTEBRADOS UTILIZANDO BIO-CAP (SECUENCIACION DE ADN NO METILADO), DESCRIBIR SU ESTRUCTURA DE CROMATINA Y PROBAR SU FUNCION IN VIVO E IN VITRO A TRAVES DE LOS SIGUIENTES OBJETIVOS:1) IDENTIFICACION DE SECUENCIAS SIMILARES A CGI DE INVERTEBRADOS (ICGI) UTILIZANDO BIO-CAP.2) DEFINIR EL PANORAMA REGULATORIO DE LOS ICGI A TRAVES DE ENFOQUES EPIGENOMICOS.3) ENSAYOS FUNCIONALES IN VIVO E IN VITRO PARA PROBAR LA FUNCION ICGI.EN RESUMEN, LOS CGI SON ELEMENTOS REGULADORES CLAVE QUE MODULAN LA EXPRESION GENICA EN VERTEBRADOS. LA DESREGULACION DE 5MC EN CGI ESTA ASOCIADA CON MULTIPLES ESTADOS DE ENFERMEDAD, INCLUIDOS CANCER, TRASTORNOS DEL DESARROLLO, AFECCIONES NEUROLOGICAS Y ENFERMEDADES CARDIOVASCULARES. COMPRENDER COMO EVOLUCIONO ESTA IMPORTANTE CLASE DE SECUENCIAS REGULADORAS PUEDE OFRECER INFORMACION SOBRE POSIBLES ESTRATEGIAS DIAGNOSTICAS Y TERAPEUTICAS PARA DIVERSAS AFECCIONES DE SALUD Y AYUDARNOS A COMPRENDER MEJOR EL PAPEL DE LAS CGI DURANTE EL DESARROLLO EMBRIONARIO, LA DIFERENCIACION Y LA PATOGENESIS. METILACION DE ADN\ISLAS CPG\INVERTEBRADOS\EVOLUCION

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