Descripción del proyecto
EL ESTUDIO DE PEPTIDOS Y PROTEINAS, DE SU ESTRUCTURA Y DE SUS FUNCIONAS, PROTEOMA, ASI COMO EL ESTUDIO DE LAS SUSTANCIAS PRODUCTO DEL METABOLISMO CELULAR, METABOLOMA, ES UNO DE LOS RETOS CIENTIFICOS A LOS QUE SE DEDICAN MAS ESFUERZOS EN LA ACTUALIDAD, UNA PARTE IMPORTANTE DE ESTOS ESTUDIOS ESTAN ENFOCADOS AL ESTABLECIMIENTO Y OPTIMIZACION DE METODOLOGIAS ANALITICAS INNOVADORAS PARA LA PURIFICACION, PRECONCENTRACION, SEPARACION, IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DE PROTEINAS, GLICOPROTEINAS, PEPTIDOS, GLICOPEPTIDOS, GLICANOS Y OTROS METABOLITOS CAPACES DE ACTUAR COMO BIOMARCADORES EN FLUIDOS Y MATERIALES BIOLOGICOS, CON EL OBJETIVO DE FACILITAR LA PREVENCION, EL DIAGNOSTICO, PRONOSTICO Y SEGUIMIENTO DE DIVERSAS ENFERMEDADES, ASI, EN EL PROYECTO QUE SE PRESENTA, SE ESTUDIARAN LOS POTENCIALES BIOMARCADORES DE ENFERMEDADES DE GRAN PREVALENCIA ENTRE LA POBLACION, COMO EL ALZHEIMER, EL PARKINSON O EL CANCER Y DE OTRAS MENOS FRECUENTES, DENOMINADAS ENFERMEDADES RARAS, COMO LA ESCLEROSIS LATERAL AMIOTROFICA (ELA), LAS POLINEUROPATIAS FAMILIARES AMILODES (FAP), LA ENFERMEDAD DE HUNTINGTON, LOS DESORDENES CONGENITOS DE LA GLICOSILACION (CDGS) Y LA GALACTOSEMIA, EL ESTABLECIMIENTO DE LOS CORRESPONDIENTES BIOMARCADORES SE LLEVARA A CABO MEDIANTE ESTRATEGIAS DE ANALISIS DIRIGIDO, CON LA DETECCION DE COMPUESTOS CONCRETOS, Y ANALISIS NO DIRIGIDO, COMPARANDO LOS PERFILES O IMPRONTAS DE MUESTRAS BIOLOGICAS CONTROL Y PATOLOGICAS, ASIMISMO, SE UTILIZARAN APROXIMACIONES BOTTOM-UP, ANALIZANDO Y CARACTERIZANDO LOS PEPTIDOS, GLICOPEPTIDOS Y GLICANOS RESULTADO DE DIGESTOS ENZIMATICOS DE LAS CORRESPONDIENTES PROTEINAS Y GLICOPROTEINAS BIOMARCADORAS, O APROXIMACIONES TOP-DOWN, A PARTIR DEL ANALISIS DE LAS PROTEINAS Y GLICOPROTEINAS INTACTAS, EN ESTA MISMA LINEA, TAMBIEN SE PROCEDERA A LA CARACTERIZACION DE BIOFARMACOS PROTEICOS, MUY UTILIZADOS EN LA ACTUALIDAD PARA EL TRATAMIENTO DE ALGUNAS DE LAS PATOLOGIAS QUE AQUI SE CONSIDERAN, LAS METODOLOGIAS QUE SE PREVEN ESTABLECER EN ESTE PROYECTO UTILIZARAN LAS TECNICAS QUE OFRECEN LAS MEJORES PRESTACIONES EN LA ACTUALIDAD, COMO SON LAS TECNICAS DE SEPARACION DE ALTA RESOLUCION UHPLC, NANO-LC, MICRO-LC Y CE ACOPLADAS A DIFERENTES SISTEMAS DE ESPECTROMETRIA DE MASAS (MS) O MASAS EN TANDEM (MS/MS), QUE UTILIZAN ANALIZADORES DE DISTINTOS TIPOS (IT, OATOF, Q-TOF, LIT-FT-ICR, LIT-ORBITRAP, QQQLIT), DE MOVILIDAD IONICA (IM) Y MALDI-TOF), SE PRESTARA ESPECIAL ATENCION A LOS PROCEDIMIENTOS DE PRECONCENTRACION Y CLEAN-UP, MEDIANTE SISTEMAS DE EXTRACCION EN FASE SOLIDA EN LINEA CON LAS TECNICAS DE SEPARACION UTILIZADAS, SE TRABAJARA CON SORBENTES DE INMUNOAFINIDAD, EMPLEANDO ANTICUERPOS, FRAGMENTOS DE ANTICUERPOS O ANTICUERPOS DE DOMINIO UNICO, TAMBIEN SE ENSAYARAN FASES ESTACIONARIAS CON LECTINAS, DE CROMATOGRAFIA DE AFINIDAD A METAL INMOVILIZADO (IMAC) O A OXIDOS METALICOS (MOAC) Y SE TRABAJARA EN EL DISEÑO Y CONSTRUCCION DE NUEVOS MODELOS DE PRECONCENTRADORES, FINALMENTE, SE LLEVARAN A CABO ESTUDIOS DE DISOCIACION Y AGREGACION DE PROTEINAS RELACIONADAS CON ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS CARACTERIZADAS POR LA ACUMULACION DE FIBRAS AMILOIDES, MEDIANTE ESPECTROMETRIA DE MASAS DE MOVILIDAD IONICA (IM-MS), TECNICA QUE PRESERVA LAS INTERACCIONES ENTRE LAS PROTEINAS Y AÑADE UNA DIMENSION MAS A LOS ESPECTROS DE MASAS, CONVIRTIENDOSE EN UNA HERRAMIENTA INDISPENSABLE EN EL ESTUDIO DE OLIGOMEROS PROTEICOS, COMPLEJOS PROTEINA-LIGANDO, INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA Y DE LAS DISTINTAS CONFORMACIONES QUE ADOPTA UNA PROTEINA, BIOMARCADORES\DIAGNÓSTICO\ESPECTROMETRÍA DE MASAS\METABOLOMA\SENSIBILIDAD\PROTEOMA\TÉCNICAS DE SEPARACIÓN DE ALTA RESOLUCIÓ