Descripción del proyecto
EN LOS ULTIMOS AÑOS, SE HA CONSTATADO UN INTERES CRECIENTE EN LA APLICACION DE ESTRATEGIAS PROTEOMICAS, METABOLOMICAS Y MAS RECIENTEMENTE MIROMICAS, PARA LA BUSQUEDA DE NUEVOS BIOMARCADORES RELACIONADOS CON PATOLOGIAS DIVERSAS, UNA PARTE IMPORTANTE DE ESTAS ESTRATEGIAS ANALITICAS ESTA ENFOCADA AL ESTABLECIMIENTO Y APLICACION DE METODOLOGIAS INNOVADORAS PARA LA PURIFICACION, PRECONCENTRACION, SEPARACION, IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DE PROTEINAS, GLICOPROTEINAS, MIRNAS, PEPTIDOS, GLICOPEPTIDOS, GLICANOS Y METABOLITOS CAPACES DE ACTUAR COMO BIOMARCADORES EN MUESTRAS BIOLOGICAS, A FIN DE FACILITAR LA PREVENCION, EL DIAGNOSTICO, PRONOSTICO Y SEGUIMIENTO DE DIVERSAS PATOLOGIAS, COMO LAS ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS Y EL CANCER, EN ESTE PROYECTO, EL ANALISIS DE LOS POTENCIALES BIOMARCADORES SE LLEVARA A CABO MEDIANTE ESTRATEGIAS DE ANALISIS DIRIGIDO HACIA COMPUESTOS SELECCIONADOS PREVIAMENTE, CARACTERIZANDOLOS Y DETECTANDO POSIBLES DIFERENCIAS Y ALTERACIONES EN SU ESTRUCTURA, COMPOSICION O CONCENTRACION, ENTRE MUESTRAS CONTROL Y PATOLOGICAS, TAMBIEN SE UTILIZARAN ESTRATEGIAS DE ANALISIS NO DIRIGIDO, COMPARANDO LOS PERFILES O IMPRONTAS GLOBALES DE ESTAS MUESTRAS BIOLOGICAS, ASIMISMO, SE UTILIZARAN APROXIMACIONES BOTTOM-UP Y MIDDLE-DOWN, SEPARANDO Y CARACTERIZANDO LOS PEPTIDOS, GLICOPEPTIDOS Y GLICANOS RESULTADO DE DIGESTIONES ENZIMATICAS DE LAS CORRESPONDIENTES PROTEINAS BIOMARCADORAS, O APROXIMACIONES TOP-DOWN, A PARTIR DEL ANALISIS DE PROTEINA INTACTA, PARA TODO ELLO, SE UTILIZARAN FUNDAMENTALMENTE TECNICAS DE ESPECTROMETRIA DE MASAS (MS) Y MASAS EN TANDEM (MS/MS) CON IONIZACION POR ELECTROSPRAY ACOPLADAS A LAS TECNICAS DE SEPARACION DE ALTA RESOLUCION, COMO CROMATOGRAFIA DE LIQUIDOS NANO O CAPILAR Y ELECTROFORESIS CAPILAR (NANO-LC-MS, CAPLC-MS Y CE-MS), ESTOS ESTUDIOS SE COMPLEMENTARAN CON ANALISIS POR ESPECTROMETRIA DE MASAS DE MOVILIDAD IONICA (IM-MS), TODAS ESTAS TECNICAS SON LAS QUE MEJORES PRESTACIONES OFRECEN EN LA ACTUALIDAD Y POR ELLO SON MUY ACEPTADAS POR LA COMUNIDAD CIENTIFICA PARA LLEVAR A CABO ESTUDIOS OMICOS, DADAS LAS INHERENTES VENTAJAS QUE PRESENTAN PARA LA SEPARACION Y CARACTERIZACION DE LOS ANALITOS DE INTERES EN MUESTRAS BIOLOGICAS COMPLEJAS, SE PRESTARA ESPECIAL ATENCION A LOS PROCEDIMIENTOS DE PURIFICACION Y PRECONCENTRACION DE LOS BIOMARCADORES ESTUDIADOS A PARTIR DE MUESTRAS BIOLOGICAS UTILIZANDO METODOS CONVENCIONALES OFF-LINE Y ON-LINE, CON SORBENTES DE AFINIDAD DE ELEVADA CAPACIDAD DE EXTRACCION Y MINIMA RETENCION NO ESPECIFICA, FINALMENTE, LA APLICACION DE HERRAMIENTAS QUIMIOMETRICAS AVANZADAS PROPORCIONARA UNA INTERPRETACION DE LA INFORMACION DEL NIVEL OMICO INVESTIGADO MAS COMPLETA, QUE POSTERIORMENTE PUEDE INTEGRARSE CON LA DE OTROS NIVELES PARA OBTENER UNA VISION GLOBAL DE LOS PROCESOS BIOLOGICOS ESTUDIADOS, PROTEÓMICA\METABOLÓMICA\MIRÓMICA\BIOMARCADORES\TÉCNICAS DE SEPARACIÓN DE ALTA RESOLUCIÓ\ESPECTROMETRÍA DE MASAS\INTEGRACIÓN DE DATOS