Descripción del proyecto
HOY EN DIA, ES AMPLIAMENTE RECONOCIDO QUE LA INVESTIGACION SOBRE BIOMARCADORES MOLECULARES RESULTA FUNDAMENTAL PARA LA MEJORA DE LA PREVENCION, EL DIAGNOSTICO, EL PRONOSTICO, EL SEGUIMIENTO Y EL TRATAMIENTO DE LAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS, NEURODEGENERATIVAS Y EL CANCER. EN ESTAS PATOLOGIAS, LAS PROTEINAS Y LOS ACIDOS MICRO-RIBONUCLEICOS (MIRNAS) CONSTITUYEN DOS TIPOS DE COMPUESTOS CUYO ANALISIS RESULTA DE GRAN INTERES, Y PLANTEAN RETOS SIGNIFICATIVOS DIFICILES DE ABORDAR CON LOS METODOS ANALITICOS ACTUALES. POR LO TANTO, LOS AVANCES Y DESCUBRIMIENTOS EN ESTAS ENFERMEDADES REQUIEREN DE METODOS ANALITICOS MAS SENSIBLES, SELECTIVOS Y REPRODUCIBLES PARA LA INVESTIGACION PRECISA Y FIABLE DE ESTOS BIOMARCADORES MOLECULARES. ASI, ESTE PROYECTO ESTA ENFOCADO AL DESARROLLO DE METODOS ANALITICOS INNOVADORES PARA LA PURIFICACION, PRECONCENTRACION, SEPARACION, IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION EN FLUIDOS BIOLOGICOS DE PROTEINAS, GLICOPROTEINAS Y MIRNAS BIOMARCADORES, ESPECIFICAMENTE RELACIONADOS CON LA COVID-19 (GLICOPROTEINA ESPICULA Y PROTEINA DE LA NUCLEOCAPSIDE), LA SEPSIS (PROTEINA PROCALCITONINA), LAS ENFERMEDADES DE PARKINSON Y ALZHEIMER (PROTEINA ALFA SINUCLEINA Y GLICOPROTEINA CLUSTERINA, RESPECTIVAMENTE), LA LEUCEMIA LINFOCITICA CRONICA (MIR21) Y EL CANCER COLORRECTAL (GLICOPROTEINA ANTIGENO CARCINOEMBRIONARIO, MIR-421, MIR130B-3P Y MIR27A-3P). SE INVESTIGARAN DIFERENTES ESTRATEGIAS, INCLUIDO EL ANALISIS DIRECTO DE LOS BIOMARCADORES A NIVEL INTACTO O MEDIANTE APROXIMACIONES BOTTOM-UP, DESPUES DE SU DIGESTION ENZIMATICA PARA OBTENER FRAGMENTOS CARACTERISTICOS QUE SE PUEDAN USAR COMO SUSTITUTOS (P.EJ. PEPTIDOS, FOSFOPEPTIDOS, GLICOPEPTIDOS O GLICANOS). ASIMISMO, SE EVALUARAN POSIBLES DIFERENCIAS Y ALTERACIONES EN LA ESTRUCTURA, COMPOSICION O CONCENTRACION DE LOS POTENCIALES BIOMARCADORES A PARTIR DE LA COMPARACION DE MUESTRAS CONTROL Y PATOLOGICAS. PARA TODO ELLO, SE UTILIZARAN PRINCIPALMENTE TECNICAS DE SEPARACION DE ALTA RESOLUCION A MICROESCALA ACOPLADAS A LA ESPECTROMETRIA DE MASAS (CROMATOGRAFIA DE LIQUIDOS CAPILAR Y ELECTROFORESIS CAPILAR ACOPLADAS A LA ESPECTROMETRIA DE MASAS, CAPLC-MS Y CE-MS) EN MODOS DE MS DE BARRIDO COMPLETO Y DE MS/MS EN TANDEM, Y TECNICAS DE PURIFICACION Y PRECONCENTRACION EN LINEA, COMO LA EXTRACCION EN FASE SOLIDA ACOPLADA EN LINEA A LA ELECTROFORESIS CAPILAR CON DETECCION POR ESPECTROMETRIA DE MASAS (ON-LINE SPE-CE-MS). SIN EMBARGO, TAMBIEN SE EXPLORARAN OTROS ENFOQUES COMPLEMENTARIOS Y/O MAS SIMPLES, BASADOS EN LA PURIFICACION FUERA DE LINEA CON DISPOSITIVOS MINIATURIZADOS DE SPE, LA ESPECTROMETRIA DE MASAS DE IONIZACION POR DESORCION LASER ASISTIDA POR MATRIZ (MALDI-MS), LA ESPECTROMETRIA DE MASAS DE MOVILIDAD IONICA (IM-MS) Y LA SPE ACOPLADA EN LINEA A LA ESPECTROMETRIA DE MASAS O A LA ESPECTROMETRIA DE MASAS DE MOVILIDAD IONICA (ON-LINE SPE-MS U ON-LINE SPE-IM-MS). FINALMENTE, LA APLICACION DE HERRAMIENTAS AVANZADAS DE ANALISIS DE DATOS PROPORCIONARA UNA INTERPRETACION MAS SISTEMATICA Y COMPLETA DE LA ENORME CANTIDAD DE DATOS MULTIDIMENSIONALES COMPLEJOS GENERADOS EN LOS DIFERENTES ESTUDIOS COMPARATIVOS BASADOS EN MS. IOMARCADORES\ELECTROFORESIS CAPILAR\CROMATOGRAFIA DE LIQUIDOS\ESPECTROMETRIA DE MASAS\MICRORNAS\GLICOPROTEINAS\PROTEINAS\CANCER\ENFERMEDADES NEURODEGENERATIVAS\ENFERMEDADES INFECCIOSAS