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PID2021-128976NB-I00

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ESTIMACION PRECISA DE LOS PARAMETROS PARA LA INFERENCIA DE LA SELECCION EN LOS G...

ESTIMACION PRECISA DE LOS PARAMETROS PARA LA INFERENCIA DE LA SELECCION EN LOS GENOMAS DEL CANCER HUMANO EL CANCER ES UNA ENFERMEDAD GENETICA QUE EVOLUCIONA BAJO ALTAS TASAS DE MUTACION Y PRESIONES DE SELECCION. ANTERIORMENTE HEMOS DEDUCIDO LA FUERZA DE LA SELECCION QUE ACTUA SOBRE LOS GENES IMPULSORES DEL CANCER. SIN EMBARGO, NO TOD... ver más

01/01/2021

FUNDACIO PRIVADA C...

254K€

Presupuesto del proyecto: 254K€

Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

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Líder del proyecto

FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 254K€

Descripción del proyecto EL CANCER ES UNA ENFERMEDAD GENETICA QUE EVOLUCIONA BAJO ALTAS TASAS DE MUTACION Y PRESIONES DE SELECCION. ANTERIORMENTE HEMOS DEDUCIDO LA FUERZA DE LA SELECCION QUE ACTUA SOBRE LOS GENES IMPULSORES DEL CANCER. SIN EMBARGO, NO TODOS LOS SITIOS DENTRO DE UN GEN SON IGUALMENTE BENEFICIOSOS DE ALTERAR POR EL TUMOR. AQUI PROPONEMOS DESARROLLAR UN NUEVO METODO BASADO EN NUESTRO ENFOQUE ACTUAL PARA ESTIMAR LA SELECCION QUE ACTUA SOBRE SITIOS INDIVIDUALES DE NUCLEOTIDOS DENTRO DE LOS GENES. NUESTRO OBJETIVO ES CLASIFICAR LOS SITIOS SEGUN ESTA SELECCION Y TAMBIEN ESTIMAR LOS PARAMETROS DE LA DISTRIBUCION DE LOS VALORES DE SELECCION DE SITIOS INDIVIDUALES EN TODO EL GENOMA. LOS DATOS DE MUTACION UTILIZADOS PARA ESTA INFERENCIA DE SELECCION PROVIENEN DE EXPERIMENTOS DE SECUENCIACION DE ADN, QUE SON INTRINSECAMENTE RUIDOSOS Y DIFUMINAN LAS LINEAS ENTRE LAS MUTACIONES CLONALES Y SUBCLONALES DEL TUMOR. POR LO TANTO, NUESTRO OBJETIVO ES DESARROLLAR UNA NUEVA HERRAMIENTA ESTADISTICA QUE NOS PERMITA MODELAR EL RUIDO EXPLICITAMENTE Y ASI ESTIMAR LOS PARAMETROS CLAVE DE LA GENETICA DE LA POBLACION A PARTIR DE LOS DATOS CON ALTA PRECISION, INCLUYENDO LAS IDENTIDADES DE LAS MUTACIONES SUBCLONALES Y CLONALES Y EL MODO DE CRECIMIENTO DEL TUMOR. ESTO REFINARA NUESTRAS MEDIDAS DE SELECCION Y DILUCIDARA LAS DIFERENCIAS EN LAS ESTRATEGIAS EVOLUTIVAS ENTRE LOS TUMORES. POR ULTIMO, AMPLIAREMOS NUESTRA ANTERIOR INFERENCIA DE SELECCION SOBRE MUTACIONES SILENCIOSAS (ES DECIR, SINONIMAS E INTRONICAS) PARA ABORDAR LA CUESTION DE SI TAMBIEN LAS TASAS DE TRANSCRIPCION O LA ESTABILIDAD DEL ARNM ESTAN EVOLUCIONANDO BAJO SELECCION. VOLUCION\MODELIZACION MATEMATICA\PROCESOS MUTACIONALES\INFERENCIA DE SELECCION\GENOMICA CANCER

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