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PID2021-128976NB-I00

Financiado
ESTIMACION PRECISA DE LOS PARAMETROS PARA LA INFERENCIA DE LA SELECCION EN LOS G...
ESTIMACION PRECISA DE LOS PARAMETROS PARA LA INFERENCIA DE LA SELECCION EN LOS GENOMAS DEL CANCER HUMANO EL CANCER ES UNA ENFERMEDAD GENETICA QUE EVOLUCIONA BAJO ALTAS TASAS DE MUTACION Y PRESIONES DE SELECCION. ANTERIORMENTE HEMOS DEDUCIDO LA FUERZA DE LA SELECCION QUE ACTUA SOBRE LOS GENES IMPULSORES DEL CANCER. SIN EMBARGO, NO TOD... EL CANCER ES UNA ENFERMEDAD GENETICA QUE EVOLUCIONA BAJO ALTAS TASAS DE MUTACION Y PRESIONES DE SELECCION. ANTERIORMENTE HEMOS DEDUCIDO LA FUERZA DE LA SELECCION QUE ACTUA SOBRE LOS GENES IMPULSORES DEL CANCER. SIN EMBARGO, NO TODOS LOS SITIOS DENTRO DE UN GEN SON IGUALMENTE BENEFICIOSOS DE ALTERAR POR EL TUMOR. AQUI PROPONEMOS DESARROLLAR UN NUEVO METODO BASADO EN NUESTRO ENFOQUE ACTUAL PARA ESTIMAR LA SELECCION QUE ACTUA SOBRE SITIOS INDIVIDUALES DE NUCLEOTIDOS DENTRO DE LOS GENES. NUESTRO OBJETIVO ES CLASIFICAR LOS SITIOS SEGUN ESTA SELECCION Y TAMBIEN ESTIMAR LOS PARAMETROS DE LA DISTRIBUCION DE LOS VALORES DE SELECCION DE SITIOS INDIVIDUALES EN TODO EL GENOMA. LOS DATOS DE MUTACION UTILIZADOS PARA ESTA INFERENCIA DE SELECCION PROVIENEN DE EXPERIMENTOS DE SECUENCIACION DE ADN, QUE SON INTRINSECAMENTE RUIDOSOS Y DIFUMINAN LAS LINEAS ENTRE LAS MUTACIONES CLONALES Y SUBCLONALES DEL TUMOR. POR LO TANTO, NUESTRO OBJETIVO ES DESARROLLAR UNA NUEVA HERRAMIENTA ESTADISTICA QUE NOS PERMITA MODELAR EL RUIDO EXPLICITAMENTE Y ASI ESTIMAR LOS PARAMETROS CLAVE DE LA GENETICA DE LA POBLACION A PARTIR DE LOS DATOS CON ALTA PRECISION, INCLUYENDO LAS IDENTIDADES DE LAS MUTACIONES SUBCLONALES Y CLONALES Y EL MODO DE CRECIMIENTO DEL TUMOR. ESTO REFINARA NUESTRAS MEDIDAS DE SELECCION Y DILUCIDARA LAS DIFERENCIAS EN LAS ESTRATEGIAS EVOLUTIVAS ENTRE LOS TUMORES. POR ULTIMO, AMPLIAREMOS NUESTRA ANTERIOR INFERENCIA DE SELECCION SOBRE MUTACIONES SILENCIOSAS (ES DECIR, SINONIMAS E INTRONICAS) PARA ABORDAR LA CUESTION DE SI TAMBIEN LAS TASAS DE TRANSCRIPCION O LA ESTABILIDAD DEL ARNM ESTAN EVOLUCIONANDO BAJO SELECCION. VOLUCION\MODELIZACION MATEMATICA\PROCESOS MUTACIONALES\INFERENCIA DE SELECCION\GENOMICA CANCER ver más
01/01/2021
FUNDACIO PRIVADA C...
254K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 254K€
Líder del proyecto
FUNDACIO PRIVADA CENTRE DE REGULACIO GENOMICA Otras actividades deportivas asociacion
Perfil tecnológico TRL 4-5 50K