Descripción del proyecto
EL CANCER ES UN PROCESO EVOLUTIVO QUE SE DESARROLLA DENTRO DE CADA PACIENTE, IMPULSADO POR MUTACIONES SOMATICAS, LOS RECIENTES PROYECTOS DE SECUENCIACION DE GENOMAS TUMORALES HAN CATALOGADO EXHAUSTIVAMENTE FIRMAS DE SELECCION QUE HAN PERMITIENDO DESCUBRIR NUEVOS ONCOGENES Y GENES SUPRESORES DE TUMORES, ASI COMO NUEVAS CLASES DE MUTACIONES CARCINOGENICAS NO CODIFICANTES, ADEMAS, LOS GENOMAS DEL CANCER HAN PERMITIDO EXAMINAR COMO SE ACUMULAN LAS MUTACIONES, PROPORCIONANDO UNA NUEVA VISION SOBRE LOS PROCESOS MUTAGENICOS Y DE REPARACION DEL ADN EN EL SOMA HUMANO Y A SU VEZ NUEVAS INCOGNITAS A RESPONDER, EL OBJETIVO GENERAL DE ESTE PROYECTO, ES EL DE ABORDAR CUESTIONES FUNDAMENTALES RELATIVAS A LOS MECANISMOS DE MUTACION SOMATICA, EMPLEANDO ANALISIS ESTADISTICOS SISTEMATICOS Y RIGUROSOS QUE SE BASEN EN LOS ABUNDANTES RECURSOS PROPORCIONADOS POR LA GENOMICA DEL CANCER, EL PRESENTE PROYECTO SE ORGANIZA EN TRES OBJETIVOS PRINCIPALES, EN PRIMER LUGAR, INVESTIGAREMOS LOS DETERMINANTES GENETICOS Y EPIGENETICOS DE LAS TASAS DE MUTACION SOMATICA REGIONAL A TRAVES DE CROMOSOMAS A DIFERENTES ESCALAS, PARTICULARMENTE, EXAMINAREMOS COMO ESTO CAMBIA ENTRE INDIVIDUOS CON LA FINALIDAD DE OBTENER UNA VISION MECANICISTA DE LOS FACTORES QUE DETERMINAN LA MUTABILIDAD, EN SEGUNDO LUGAR, VAMOS A CARACTERIZAR AMPLIAMENTE LOS CAMBIOS EN LOS PROCESOS MUTACIONALES DURANTE EL CURSO DE LA CARCINOGENESIS, HACIENDO ENFASIS EN LA MUTACION DE CELULAS SANAS ASI COMO TAMBIEN EN EL IMPACTO DE LOS MUTADORES TRANSITORIOS Y ULTRAMUTADORES DE LOS TUMORES INDIVIDUALES, FINALMENTE Y EN TERCER LUGAR, ABORDAREMOS LA POSIBILIDAD DE EXPLORAR PROCESOS MUTACIONALES EN CURSO ASI COMO VULNERABILIDADES DEL CANCER, ESTOS SE BUSCARAN A TRAVES DE PATRONES DE EXCLUSIVIDAD MUTUA EN GENOMAS DE CANCER O MEDIANTE LETALIDAD SINTETICA EN BASES DE DATOS DE LINEAS CELULARES UTILIZANDO PEQUEÑAS MOLECULAS Y SHRNAS, ADEMAS, VALIDAREMOS EXTENSAMENTE LAS MENCIONADAS PREDICCIONES DE LETALIDAD SINTETICA USANDO CONJUNTOS DE DATOS PUBLICOS ORTOGONALES DE PACIENTES CON CANCER CON CIERTOS TIPOS DE ERRORES DE REPARACION DEL ADN EN EL TUMOR Y EN SU RESPUESTA AL TRATAMIENTO, A MODO DE RESUMEN, ACTUALMENTE NOS ENCONTRAMOS EN UN MOMENTO EN QUE LOS "GRANDES DATOS" GENOMICOS ESTAN REVOLUCIONANDO NUESTRA COMPRENSION DE LA BIOLOGIA DEL CANCER, POR ESTE MOTIVO, EL PRESENTE PROYECTO PRETENDE FOMENTAR Y AVANZAR EN NUESTRO CONOCIMIENTO DE LA BIOLOGIA DEL CANCER ASI COMO TAMBIEN EN SUS IMPLICACIONES EN LA TERAPIA DE LAS ENFERMEDADES NEOPLASICAS, GENÉTICA HUMANA\GENOMAS DEL CÁNCER\MUTACIONES SOMÁTICAS\REPARACIÓN DEL ADN\EPIGENÓMICA