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BFU2015-67302-R

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IDENTIFICACION DE RESTRICCIONES EN EL ORDEN DE ACUMULACION DE MUTACIONES DURANTE...

IDENTIFICACION DE RESTRICCIONES EN EL ORDEN DE ACUMULACION DE MUTACIONES DURANTE LA PROGRESION TUMORAL: METODOS DE INFERENCIA Y SOFTWARE DE SIMULACION. LA PROGRESION TUMORAL ESTA CAUSADA POR LA ACUMULACION SECUENCIAL DE MUTACIONES, PERO NO TODOS LOS ORDENES DE ACUMULACION SON IGUALMENTE PROBABLES, CUANDO LA FIJACION DE ALGUNAS MUTACIONES DEPENDE DE LA PRESENCIA DE OTRAS MUTACIONE... ver más

01/01/2015

UAM

50K€

Presupuesto del proyecto: 50K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE MADRID No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 3181

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD AUTÓNOMA DE MADRID No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 3181

Presupuesto del proyecto 50K€

Descripción del proyecto LA PROGRESION TUMORAL ESTA CAUSADA POR LA ACUMULACION SECUENCIAL DE MUTACIONES, PERO NO TODOS LOS ORDENES DE ACUMULACION SON IGUALMENTE PROBABLES, CUANDO LA FIJACION DE ALGUNAS MUTACIONES DEPENDE DE LA PRESENCIA DE OTRAS MUTACIONES (UN TIPO DE INTERACCION EPISTATICA), EL IDENTIFICAR RESTRICCIONES EN EL ORDEN DE ACUMULACION DE MUTACIONES PUEDE LLEVAR AL DESCUBRIMIENTO DE DIANAS TERAPEUTICAS Y DE MARCADORES DIAGNOSTICOS,EXISTEN VARIOS METODOS PARA INTENTAR IDENTIFICAR ESTAS RESTRICCIONES EN EL ORDEN DE ACUMULACION DE MUTACIONES A PARTIR DE DATOS TRANSVERSALES, (LOS DATOS TRANSVERSALES SON LOS MAS ABUNDANTES EN CANCER, Y CONTINUAN ACUMULANDOSE DEBIDO A LOS PROYECTOS INTERNACIONALES DE SECUENCIACION,) LA CAPACIDAD REAL DE ESTOS METODOS PARA INFERIR RESTRICCIONES, SIN EMBARGO, ES DESCONOCIDA Y EN PARTICULAR ESTOS METODOS PODRIAN SER ENGAÑOSOS SI: A) NO HAY RESTRICCIONES EN EL ORDEN DE ACUMULACION DE MUTACIONES (SOLAMENTE DIFERENTES EFECTOS SOBRE EL FITNESS DE DISTINTAS MUTACIONES Y/O FENOTIPOS MUTADORES); B) LOS TIPOS DE RESTRICCIONES QUE EXISTEN NO SE AJUSTAN DE FORMA ESTRICTA A LOS QUE EL METODO DE INFERENCIA ESPERA (POR EJ,, SI UNA MUTACION REQUIERE CONJUNTAMENTE DOS MUTACIONES PREVIAS O SOLO UNA); C) LAS RELACIONES DE COOPERACION/COMPETENCIA INTER-CLON Y LA HETEROGENEIDAD INTRA-TUMORAL DAN LUGAR A DATOS OBSERVADOS A PARTIR DE LOS CUALES ESTOS METODOS PODRIAN INFERIR RESTRICCIONES CELL-AUTONOMOUS QUE EN REALIDAD NO EXISTEN,ESTE PROYECTO RESPONDERA SI Y COMO PODEMOS USAR METODOS PARA INFERIR RESTRICCIONES EN EL ORDEN DE ACUMULACION DE MUTACIONES INCLUSO CUANDO NOS ENCONTREMOS CON LAS DIFICULTADES CITADAS ANTERIORMENTE, ASI COMO SI PODEMOS RECONSTRUIR LAS TRAYECTORIAS DE EVOLUCION SOMATICA Y USAR LA FILOGENIA DE LOS CLONES PARA PREDECIR EL FUTURO DESARROLLO TUMORAL, SI LA RESPUESTA ES QUE PODEMOR INFERIR RESTRICCIONES, ESTE PROYECTO PROVEERA DE UN CONJUNTO DE PROCEDIMIENTOS RIGUROSOS Y SISTEMATICOS PARA APLICAR ESTOS METODOS A DATOS EXPERIMENTALES CON EL OBJETIVO DE DESCUBRIR DIANAS TERAPEUTICAS Y MARCADORES TEMPRANOS DE ENFERMEDAD,PARA LLEVAR ACABO ESTE TRABAJO SERA NECESARIO USAR SIMULACIONES DE EVOLUCION TUMORAL PARA GENERAR DATOS A PARTIR DE MODELOS VEROSIMILES DE DESARROLLO TUMORAL, POR TANTO, UN PARTE IMPORTANTE DE ESTE PROYECTO ES EL DESARROLLO DE SOFTWARE DE SIMULACION GENETICA, LA UTILIDAD E IMPACTO DE ESTE SOFTWARE VAN MUCHO MAS ALLA DE ESTE PROYECTO, Y SERAN TAMBIEN APLICABLES A PREGUNTAS MUCHO MAS GENERALES EN ONCOLOGIA GENOMICA Y GENETICA EVOLUTIVA, EN PARTICULAR, ESTE SOFTWARE (QUE SERA DE CODIGO ABIERTO Y DISPONIBLE DESDE REPOSITORIOS PUBLICOS) PROVEERA DE MECANISMOS GENERALES PARA ESPECIFICAR EFECTOS EPISTATICOS ARBITRARIOS, INCLUYENDO RESTRICCIONES EN EL ORDEN DE LAS MUTACIONES, EFECTOS DE ORDEN, Y VIABILIDAD Y LETALIDAD SINTETICAS, ESTE SOFTWARE PERMITIRA TAMBIEN SIMULAR EL EFECTO DE INTERVENCIONES TALES COMO TRATAMIENTOS QUE DISMINUYEN EL TAMAÑO DE POBLACION DEL TUMOR O QUE CONVIERTEN A CIERTOS GENES (O COMBINACIONES DE GENES) EN LETALES, ESTE SOFTWARE TAMBIEN INCLUIRA DISTINTOS MODELOS EVOLUTIVOS, E INCORPORARA ESTRUCTURA ESPACIAL Y RELACIONES INTER-CLON, ESTE TIPO DE SOFTWARE NO EXISTEN EN EL CAMPO, Y FACILMENTE PODRIA CONVERTIRSE EN UN ESTANDAR Y TENER UN EFECTO CUALITATIVO SOBRE LAS PRACTICAS DE TRABAJO EN ONCOLOGIA GENOMICA, CÁNCER\SIMULACIÓN\SOFTWARE\ESTADÍSTICA\MUTACIÓN\GENÉTICA EVOLUTIVA\HETEROGENEIDAD\PROGRESIÓN TUMORAL

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