Descripción del proyecto
EL ESTUDIO ESTRUCTURAL DE LA ARNPOL (ARN POLIMERASA) BACTERIANA HA PERMITIDO DEFINIR UN ESPACIO ENTRE SUS SUBUNIDADES, DENOMINADO CANAL SECUNDARIO, QUE CONECTA EL MEDIO EXTERIOR CON EL CENTRO CATALITICO, ACTUANDO COMO UNA ENTRADA PARA EL PASO DE LOS NUCLEOTIDOS, EN LOS ULTIMOS AÑOS SE HA VISTO QUE EN ESTE CANAL SECUNDARIO PUEDEN INTERACCIONAR DIVERSOS FACTORES REGULADORES ENTRE LOS QUE ENCONTRAMOS PPGPP Y DKSA, FACTORES EFECTORES DE LA RESPUESTA ESTRICTA, Y LOS FACTORES ANTIPAUSA DE LA TRANSCRIPCION GREA Y GREB, ESTOS RESULTADOS SUGIEREN QUE ESTA REGION DE LA ARNPOL ACTUA COMO UN DOMINIO REGULADOR POR EL QUE COMPITEN DIFERENTES PROTEINAS REGULADORAS COMO DKSA Y GREA, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS ESTUDIAR LOS MECANISMOS QUE INTERVIENEN EN LA MODULACION DE LA EXPRESION GENICA MEDIADA POR EL CANAL SECUNDARIO DE LA ARNPOL EN ENTEROBACTERIAS, UTILIZANDO COMO MODELO BIOLOGICO CEPAS DE ESCHERICHIA COLI Y SALMONELLA,SE ESTIMARA EL IMPACTO QUE TIENE ESTE MECANISMO DE REGULACION EN LA CELULA MEDIANTE DETERMINACION DEL CONJUNTO DE GENES QUE SE ENCUENTRA AFECTADO POR EL SISTEMA DKSA/FACTORES GRE, MEDIANTE ANALISIS TRANSCRIPTOMICO, SE LLEVARA A CABO UN ESTUDIO FUNCIONAL DE LA PROTEINA GREA, UNO DE LOS PRINCIPALES FACTORES IMPLICADOS EN EL FENOMENO DE COMPETENCIA, ADEMAS, SE ESTUDIARAN LAS CONDICIONES QUE PUEDEN ALTERAR LAS CANTIDADES RELATIVAS DE ARNPOL QUE SE ENCUENTRAN INTERACTUANDO CON LAS DIFERENTES PROTEINAS ACCESORIAS, BIEN DEBIDO A CAMBIOS EN LOS NIVELES DE EXPRESION DE LAS PROTEINAS IMPLICADAS O A ALTERACIONES EN LA AFINIDAD RELATIVA POR LA ARNPOL, DE ESTA MANERA, PRETENDEMOS ESTABLECER UN POSIBLE MODELO DE REGULACION MEDIADO POR LA COMPETENCIA ENTRE PROTEINAS QUE INTERACCIONAN CON LA ARNPOL Y QUE PODRIA VERSE AFECTADO POR DIFERENTES PARAMETROS AMBIENTALES, RECIENTEMENTE SE HA DESCRITO LA EXISTENCIA DE PROTEINAS ESTRUCTURALMENTE HOMOLOGAS A GREA/DKSA CODIFICADAS EN ELEMENTOS EXTRACROMOSOMICOS, QUE TIENEN CAPACIDAD DE INTERACCIONAR CON LA ARNPOL, EN ESTE PROYECTO TAMBIEN QUISIERAMOS DETERMINAR EL PAPEL QUE PUEDEN DESEMPEÑAR EN LA FISIOLOGIA CELULAR MIEMBROS DE ESTA CRECIENTE FAMILIA DE PROTEINAS QUE INTERACCIONAN CON EL CANAL SECUNDARIO DE LA ARNPOL Y QUE SE ENCUENTRAN CODIFICADOS EN ELEMENTOS ADQUIRIDOS POR TRANSFERENCIA HORIZONTAL, LOS RESULTADOS DERIVADOS DE ESTE PROYECTO PODRIAN ESTABLECER UN NUEVO MECANISMO DE REGULACION DE LA EXPRESION GENICA Y DE TRANSDUCCION DE LAS SEÑALES AMBIENTALES EN BACTERIAS,