Innovating Works

BFU2014-52143-P

Financiado
DETERMINANTES DEL POSICIONAMIENTO NUCLEOSOMAL E INGENIERIA DE LA CROMATINA
LOS NUCLEOSOMAS ESTAN FORMADOS POR 147 BP DE DNA ENROLLADOS ALREDEDOR DE UN OCTAMERO DE HISTONAS Y REPRESENTAN LAS UNIDADES BASICAS DE LA CROMATINA, CONTRIBUYEN A COMPACTAR EL GENOMA DENTRO DEL NUCLEO Y MODULAN EL ACCESO FISICO AL... LOS NUCLEOSOMAS ESTAN FORMADOS POR 147 BP DE DNA ENROLLADOS ALREDEDOR DE UN OCTAMERO DE HISTONAS Y REPRESENTAN LAS UNIDADES BASICAS DE LA CROMATINA, CONTRIBUYEN A COMPACTAR EL GENOMA DENTRO DEL NUCLEO Y MODULAN EL ACCESO FISICO AL DNA DIRECTAMENTE O A TRAVES DE LAS MODIFICACIONES EPIGENETICAS DE LOS DOMINIOS AMINO DE LAS HISTONAS, EL TRABAJO DE VARIOS LABORATORIOS, INCLUIDO EL NUESTRO, DURANTE LOS ULTIMOS AÑOS HA REVELADO QUE LA MAYOR PARTE DE LOS NUCLEOSOMAS OCUPAN POSICIONES ESTABLES EN EL GENOMA QUE NO VARIAN DENTRO DE UN AMPLIO RANGO DE SITUACIONES FISIOLOGICAS Y PROCESOS GENOMICOS, ESTE PROYECTO TOMA ESOS RESULTADOS COMO PUNTO DE PARTIDA E INTENTARA DEFINIR LOS MECANISMOS DE LOS CUALES DEPENDE ESA ORGANIZACION TAN ESTRICTA DEL GENOMA, PUESTO QUE ESTE ES UN PROYECTO SOBRE GENOMICA, INTEGRA APROXIMACIONES BIOLOGICAS Y COMPUTACIONALES PARA GENERAR DATOS CUANTITATIVOS Y PARA HACER PREDICCIONES (VERIFICABLES EXPERIMENTALMENTE) SOBRE COMO LA SECUENCIA CONTRIBUYE A LA ORGANIZACION NUCLEOSOMAL Y COMO ESTA INFORMACION PODRIA INCORPORARSE AL DISEÑO DE MOLECULAS DE DNA, EN CONCRETO, REALIZAREMOS ANALISIS MUTACIONALES EN REGIONES ESPECIFICAS DE DNA MONONUCLEOSOMAL PARA IDENTIFICAR ELEMENTOS DE SECUENCIA RELEVANTES EN EL POSICIONAMIENTO NUCLEOSOMAL IN VIVO (OBJETIVO 1), ADEMAS, ANALIZAREMOS LA CONTRIBUCION DE LOS REMODELADORES DE CROMATINA, MODIFICADORES EPIGENETICOS Y DE LA PROPIA ESTRUCTURA DE LAS HISTONAS (OBJETIVOS 2 Y 3), ESTOS ANALISIS TENDRAN UNA RESOLUCION SUFICIENTE PARA DETECTAR ALTERACIONES FUNCIONALES EN ZONAS DISCRETAS DEL GENOMA E INCLUSO EN NUCLEOSOMAS INDIVIDUALES (OBJETIVO 4), UTILIZAREMOS LA INFORMACION DERIVADA DE ESOS EXPERIMENTOS Y DEL ANALISIS DE LAS SECUENCIAS ASOCIADAS A NUCLEOSOMAS BIEN POSICIONADOS PARA DISEÑAR MOLECULAS DE DNA QUE PODRIAN CODIFICAR CONFORMACIONES ESPECIFICAS DE CROMATINA EN SECUENCIAS ENDOGENAS O ARTIFICIALES, ESTA POSIBILIDAD PODRIA TENER APLICACIONES BIOLOGICAS O BIOTECNOLOGICAS IMPORTANTES (OBJETIVO 5), TAMBIEN EXPLOTAREMOS LA INFORMACION CODIFICADA EN LAS REGIONES LIBRES DE NUCLEOSOMAS (NDRS) EN POSICION 5’ DE LOS GENES PARA ANALIZAR LA HIPOTESIS DE QUE LOS PROMOTORES PODRIAN ESTAR PRECISAMENTE LOCALIZADOS EN ESAS REGIONES (OBJETIVO 6), SI LOS ANALISIS FUNCIONALES QUE LLEVAREMOS A CABO VALIDAN ESTA PREDICCION, PODRIAMOS IDENTIFICAR ELEMENTOS REGULADORES COMPARTIDOS POR GRUPOS DE GENES PARA COMENZAR A DEFINIR LA RED REGULADORA DE LA TRANSCRIPCION A NIVEL DE TODO EL GENOMA, ESTE OBJETIVO, COMBINADO CON EL OBJETIVO 5, ABRIRIA LA POSIBILIDAD DE DISEÑAR PROMOTORES DE ESPECIFICIDAD DEFINIDA A PARTIR DE COMBINACIONES DE MODULOS DE SECUENCIAS ENDOGENAS, FINALMENTE, EL OBJETIVO 7 INTENTARA DESARROLLAR HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES PARA EL ANALISIS Y LA VISUALIZACION DE DATOS GENOMICOS DE UNA MANERA MAS INTEGRADA Y DINAMICA QUE LA DE LOS NAVEGADORES ACTUALES, CROMATINA\NUCLEOSOMAS\REGULACIÓN GENÓMICA\TRANSCRIPCIÓN\EPIGENÉTICA ver más
01/01/2014
CSIC
351K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2014-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 351K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M