REGULACION DE LA DIRECCIONALIDAD TRANSCRIPCIONAL Y DE LA ESTABILIDAD GENOMICA ME...
REGULACION DE LA DIRECCIONALIDAD TRANSCRIPCIONAL Y DE LA ESTABILIDAD GENOMICA MEDIANTE POSICIONAMIENTO NUCLEOSOMAL
LOS NUCLEOSOMAS SON LAS UNIDADES ESTRUCTURALES BASICAS DEL GENOMA, CUBREN APROXIMADAMENTE EL 95% DEL GENOMA EUCARIOTICO Y PARTICIPAN EN PROCESOS BASICOS COMO LA TRANSCRIPCION, LA REPLICACION, LA RECOMBINACION Y LA REPARACION MEDIA...
LOS NUCLEOSOMAS SON LAS UNIDADES ESTRUCTURALES BASICAS DEL GENOMA, CUBREN APROXIMADAMENTE EL 95% DEL GENOMA EUCARIOTICO Y PARTICIPAN EN PROCESOS BASICOS COMO LA TRANSCRIPCION, LA REPLICACION, LA RECOMBINACION Y LA REPARACION MEDIANTE LA REGULACION DEL ACCESO FISICO DE LAS PROTEINAS REGULADORAS AL DNA, ADEMAS, LAS HISTONAS PUEDEN INCORPORAR MAS DE CIEN MODIFICACIONES EPIGENETICAS QUE FAVORECEN O PREVIENEN SU INTERACCION CON OTRAS PROTEINAS, PARA EJERCER ESAS FUNCIONES CON PRECISION, LOS NUCLEOSOMAS DEBEN OCUPAR POSICIONES ESPECIFICAS RESPECTO A LA SECUENCIA DEL DNA, LA POSICION DE LOS NUCLEOSOMAS IN VIVO DEPENDE DE COMPLEJOS REMODELADORES DE CROMATINA QUE DESPLAZAN, EXCLUYEN O REEMPLAZAN HISTONAS, OTRO FACTOR IMPORTANTE EN EL POSICIONAMIENTO ES LA PROPIA SECUENCIA DEL DNA, ESTE PROYECTO DE INVESTIGACION DERIVA DE TRABAJO PREVIO DE NUESTRO LABORATORIO QUE DEMUESTRA QUE LAS NUCLEOSOMAL SIGNATURES CODIFICADAS EN LA SEQUENCIA DEL DNA PUEDEN DIRIGIR NUCLEOSOMAS A POSICIONES ESPECIFICAS DEL GENOMA, MUY RECIENTEMENTE, HEMOS OBSERVADO QUE LAS NUCLEOSOMAL SIGNATURES SON ASIMETRICAS RESPECTO A LA POLARIDAD DE LA TRANSCRIPCION, EN EL OBJETIVO 1 INTENTAREMOS IDENTIFICAR LAS SECUENCIAS RESPONSABLES DE ESA ESA ASIMETRIA Y COMO REGULAN LA DIRECCIONALIDAD Y EL BALANCE ENTRE LA TRANSCRIPCION SENTIDO Y ANTISENTIDO A TRAVES DE UNA INTERACCION IGUALMENTE ASIMETRICA ENTRE EL DNA Y LOS NUCLEOSOMAS, EL OBJETIVO 2 ANALIZARA LA CAPACIDAD DE LAS HISTONAS PARA INTERPRETAR LA INFORMACION CODIFICADA EN LAS SIGNATURES, ADEMAS, UTILIZAREMOS EL SISTEMA MODELO DE LEVADURAS PARA ANALIZAR COMO LAS MUTACIONES QUE TRANSFORMAN LAS HISTONAS CANONICAS HUMANAS EN ONCOHISTONAS MODIFICAN SUS PROPIEDADES E INTERFIEREN CON LA ACTIVIDAD DEL GENOMA, EL OBJETIVO 3 ANALIZARA EL PAPEL DE LOS NUCLEOSOMAS EN LA REPARACION DEL DNA Y EN LA ESTABILIDAD GENOMICA, PARA ELLO, UTILIZAREMOS UN SISTEMA EXPERIMENTAL QUE HEMOS DESAROLLADO DURANTE EL PROYECTO ACTUAL, ESTE NOS PERMITIRA DEFINIR LA DINAMICA DE RESTAURACION DE LA CROMATINA DURANTE LA REPARACION DE UNA ROTURA DE DOBLE CADENA DEL DNA PARA REGENERAR UN CROMOSOMA FUNCIONAL, TAMBIEN ESTUDIAREMOS LAS CONDICIONES QUE PERMITEN LA RECUPERACION DE LA CROMATINA DESPUES DE LA PERDIDA REVERSIBLE DEL PATRON NATIVO DE ORGANIZACION NUCLEOSOMAL, FINALMENTE, EN EL OBJETIVO 4 UTILIZAREMOS COMO PUNTO DE PARTIDA LA IDENTIFICACION RECIENTE EN NUESTRO LABORATORIO DE MAS DE 130 SECUENCIAS SOBRERREPRESENTADAS EN LAS REGIONES LIBRES DE NUCLEOSOMAS DE LA REGION 5 DE LOS GENES EN SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE PARA DEFINIR COMO LA COMBINATORIA DE ESOS ELEMENTOS ESPECIFICA LA SINTAXIS REGULATORIA Y LA RED GENOMICA DE REGULACION TRANSCRIPCIONAL,EN LOS DISTINTOS OBJETIVOS, UTILIZAREMOS LAS LEVADURAS S, POMBE Y SACCHAROMYCES CEREVISIAE COMO SISTEMAS MODELO PARA LOS ANALISIS BIOQUIMICOS, GENETICOS, GENOMICOS Y COMPUTACIONALES PARA ESTABLECER RELACIONES DE CAUSA Y CONSECUENCIA CON UN GRADO DE RESOLUCION DIFICILMENTE ALCANZABLE EN CELULAS ANIMALES, DADA LA UNIVERSALIDAD DE LAS INTERACCIONES DNA-HISTONAS Y LA CONSERVACION DEL PAPEL REGULADOR DE LA CROMATINA EN LOS PROCESOS BASICOS DEL GENOMA, ES RAZONABLE ESPERAR QUE NUESTROS RESULTADOS PUEDAN GENERALIZARSE A EUCARIOTAS PLURICELULARES, NUCLEOSOMA\HISTONA\CROMATINA\PROMOTOR\TRANSCRIPCION\ESTABILIDAD GENOMICA\REPARACION DE DNAver más
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