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BFU2017-89622-P

Financiado

REGULACION GENOMICA MEDIANTE POSICIONAMIENTO NUCLEOSOMAL

LOS NUCLEOSOMAS SON LAS UNIDADES ESTRUCTURALES BASICAS DEL LA CROMATINA, ESTAN FORMADOS POR 147 PB DE DNA DE DOBLE CADENA QUE RODEA UN OCTAMERO DE PROTEINAS COMPUESTO POR DOS MOLECULAS DE CADA UNA DE LAS HISTONAS H2A, H2B, H3 Y H4... ver más

01/01/2017

CSIC

270K€

Presupuesto del proyecto: 270K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2017-01-01

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Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 270K€

Descripción del proyecto LOS NUCLEOSOMAS SON LAS UNIDADES ESTRUCTURALES BASICAS DEL LA CROMATINA, ESTAN FORMADOS POR 147 PB DE DNA DE DOBLE CADENA QUE RODEA UN OCTAMERO DE PROTEINAS COMPUESTO POR DOS MOLECULAS DE CADA UNA DE LAS HISTONAS H2A, H2B, H3 Y H4, EL ANALISIS DE ALTA RESOLUCION EN VARIAS ESPECIES DE LEVADURAS HA PUESTO DE MANIFIESTO QUE LA MAYOR PARTE DE LOS NUCLEOSOMAS OCUPA POSICIONES ESTABLES Y BIEN DEFINIDAS A LO LARGO DE LOS CROMOSOMAS, EN GENERAL, ESTA ORGANIZACION DEPENDE DE LA CONTRIBUCION CONJUNTA DE LOS REMODELADORES DE CROMATINA, DE LA UNION DE FACTORES DE TRANSCRIPCION Y OTRAS PROTEINAS Y DE LA PROPIA SECUENCIA DEL DNA, A LO LARGO DEL PROYECTO ANTERIOR, HEMOS ESTABLECIDO QUE LA SECUENCIA DEL DNA TIENE UN PAPEL DETERMINANTE EN LA ESPECIFICACION DE LA ORGANIZACION NUCLEOSOMAL DADO QUE INCLUSO MODIFICACIONES PEQUEÑAS DE LA SECUENCIA ALTERAN LOCALMENTE LA POSICION DE LOS NUCLEOSOMAS IN VIVO, INCLUSO A NIVEL INDIVIDUAL, TAMBIEN HEMOS ENCONTRADO QUE LAS SECUENCIAS DEL DNA MONONUCLEOSOMAL SIGUEN UN PATRON MUY ESTRUCTURADO EN SU COMPOSICION DE BASES QUE, ADEMAS, ES DIFERENTE ENTRE ESPECIES, ESTAS HUELLAS NUCLEOSOMALES (NUCLEOSOMAL SIGNATURES) REPRESENTAN UN NIVEL DE INFORMACION PREVIAMENTE DESCONOCIDO QUE ES CAPAZ DE IMPONER EL POSICIONAMIENTO NUCLEOSOMAL EN EL GENOMA INDEPENDIENTEMENTE DE LA TRANSCRIPCION, ESTE PROYECTO COMBINA APROXIMACIONES BIOQUIMICAS, GENETICAS, GENOMICAS Y BIOINFORMATICAS Y UTILIZARA PRINCIPALMENTE COMO SISTEMAS MODELO LAS LEVADURAS SCHIZOSACCHAROMYCES POMBE Y SACCHAROMYCES CEREVISIAE, LA IDEA BASICA DEL PROYECTO ES APROVECHAR LA POSIBILIDAD SIN PRECEDENTE DE INCORPORAR EN MOLECULAS DE DNA NATURALES O SINTETICAS LA INFORMACION DERIVADA DE LAS NUCLEOSOMAL SIGNATURES PARA DIRIGIR EL POSICIONAMIENTO DE NUCLEOSOMAS EN POSICIONES ESPECIFICAS DEL GENOMA, UTILIZAREMOS ESTA ESTRATEGIA PARA MODULAR LA LOCALIZACION Y AFINIDAD POR EL DNA DE NUCLEOSOMAS EN REGIONES REGULADORAS PARA ANALIZAR SU IMPACTO FUNCIONAL EN LA TRANSCRIPCION, LA REPLICACION Y LA REPARACION DEL DNA, CONCRETAMENTE, EN EL OBJETIVO 1 ANALIZAREMOS COMO LA SIGNATURA POLARIZADA DE LOS NUCLEOSOMAS QUE SOLAPAN LOS SITIOS DE INICIO Y DE TERMINACION DE LA TRANSCRIPCION REGULA LA TASA Y DIRECCIONALIDAD DE LA TRANSCRIPCION, EN EL OBJETIVO 2 ESTABLECEREMOS EL PAPEL DE LA ORGANIZACION NUCLEOSOMAL EN REGIONES QUE SUFRAN ROTURAS INDUCIDAS DE DNA DE DOBLE CADENA Y LA DINAMICA NUCLEOSOMAL DE LA REGION DONADORA DURANTE LA REPARACION, TAMBIEN DETERMINAREMOS LA ESTABILIDAD DIFERENCIAL Y EL SESGO EN LA REPARACION DEL DNA MONONUCLEOSOMAL COMO UN POSIBLE MECANISMO PARA EXPLICAR EL ORIGEN EVOLUTIVO DE LAS NUCLEOSOMAL SIGNATURES, EN EL OBJETIVO 3 CONSTRUIREMOS ORIGENES DE REPLICACION SINTETICOS QUE INCORPOREN DISPOSICIONES ESPECIFICAS DE NUCLEOSOMAS CON DIFERENTES AFINIDADES POR DNA PARA ANALIZAR LA RELACION FUNCIONAL ENTRE EL COMPLEJO DE RECONOCIMIENTO DEL ORIGEN (ORC) Y LOS NUCLEOSOMAS EN LA INICIACION DE LA REPLICACION DEL DNA EN S, POMBE, FINALMENTE, EL OBJETIVO 4 ES EL MAS APLICADO Y EN EL INCORPORAREMOS LA INFORMACION PARA POSICIONAR NUCLEOSOMAS EN LA CONSTRUCCION DE VECTORES DE EXPRESION DE S, POMBE Y S, CEREVISIAE PARA IMITAR LA ORGANIZACION NUCLEOSOMAL DE LA CELULA HUESPED, ANALIZAREMOS SI LOS VECTORES RESULTANTES TIENEN FUNCIONALIDADES MEJORADAS EN TERMINOS DE SU EXPRESION Y ESTABILIDAD, EN ESTE OBJETIVO TAMBIEN ESTUDIAREMOS LA ORGANIZACION NUCLEOSOMAL EN CEPAS DE S, CEREVISIAE PORTADORAS DE CROMOSOMAS SINTETICOS, CUYA SECUENCIA ESTA MUY EDITADA, GENERADOS EN EL PROYECTO SC2, CROMATINA\NUCLEOSOMAS\REGULACIÓN GENÓMICA\TRANSCRIPCIÓN\REPLICACIÓN\REPARACION DE DNA

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