Descripción del proyecto
LA INFORMACION GENETICA EUCARIOTA ESTA ORGANIZADA EN UN COMPLEJO AMBIENTE NUCLEOPROTEICO QUE LLAMAMOS CROMATINA, LOS ELEMENTOS CONSTITUTIVOS FUNDAMENTALES DE LA CROMATINA EUCARIOTA SON LOS NUCLEOSOMAS, FORMADOS POR PROTEINAS HISTONAS Y DNA ENVUELTO A SU ALREDEDOR, ADEMAS DE UN ROL ESTRUCTURAL, LAS HISTONAS TAMBIEN SON CLAVES EN LA REGULACION DE LA ACCESIBILIDAD A LA INFORMACION GENETICA, MEDIANTE PROCESOS QUE INVOLUCRAN CAMBIOS FISICOS EN LOS NUCLEOSOMAS ASI COMO UNA GRAN DIVERSIDAD DE MODIFICACIONES QUIMICAS POST-TRADUCCIONALES DE LAS HISTONAS (HPTMS), EN EFECTO, SE HAN DESCRITO DOCENAS DE HPTMS Y MODIFICADORES EPIGENETICOS (ENZIMAS QUE ESCRIBEN, BORRAN Y/O SE UNEN ESPECIFICAMENTE A HPTMS), EN CONJUNTO, ESTOS COMPONENTES DE LA CROMATINA CONSTITUYEN UNA COMPLEJO NIVEL DE REGULACION GENOMICA A MENUDO LLAMADO CODIGO DE HISTONAS, LA REGULACION DE LA CROMATINA Y EL CODIGO DE HISTONAS SON IMPORTANTES INNOVACIONES EVOLUTIVAS ASOCIADAS AL ORIGEN DE LOS EUCARIOTAS, SIN EMBARGO, NUESTRO CONOCIMIENTO DE LA BIOLOGIA DE LA CROMATINA PERMANECE RESTRINGIDO A UNAS POCAS ESPECIES MODELO, QUE REPRESENTAN UNA INFIMA FRACCION DE LA DIVERSIDAD EUCARIOTA, GRACIAS AL INCREMENTO MASIVO DE DATOS GENOMICOS EN DIVERSOS EUCARIOTAS ASI COMO A LOS AVANCES EN LA SENSIBILIDAD DE LAS TECNICAS DE PROTEOMICA, ESTAMOS EN UNA POSICION UNICA PARA EMPEZAR UNA EXPANSION FILOGENETICA Y SISTEMATICA DE NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE LA BIOLOGIA Y EVOLUCION DE LA CROMATINA,EN ESTE PROYECTO, DESARROLLAREMOS UN MARCO DE REFERENCIA COMPARATIVO PARA ESTUDIAR EL ORIGEN Y EVOLUCION DE LA CROMATINA DES DE UNA PERSPECTIVA MULTI-NIVEL: COMPONENTES, MODIFICACIONES QUIMICAS E INTERACCIONES, ESPECIFICAMENTE, (1) REALIZAREMOS SISTEMATICAMENTE UN ANALISIS GENOMICO COMPARADO DE COMPONENTES Y MODIFICADORES DE LA CROMATINA (HISTONAS, ENZIMAS MODIFICADORAS DE HISTONAS, REMODELADORES DE NUCLEOSOMAS, Y CHAPERONAS DE HISTONAS), INCLUYENDO PARA ESTE ESTUDIO DOCENES DE GENOMAS COMPLETOS DE EUCARIOTAS Y ARQUEAS; (2) USAREMOS ANALISIS PROTEOMICOS PARA IDENTIFICAR HPTMS EN MULTIPLES ESPECIES EN POSICIONES FILOGENETICAS CLAVES PARA REPRESENTAR LOS PRINCIPALES LINAJES EUCARIOTAS I TAMBIEN EN ESPECIES DE ARQUEAS FILOGENETICAMENTE CERCANAS A EUCARIOTAS; Y, POR ULTIMO, (3) MAPEAREMOS EXPERIMENTALMENTE EL INTERACTOMA DE HPTMS CONSERVADAS Y EVOLUTIVAMENTE NUEVAS EN ESPECIES EUCARIOTAS SELECCIONADAS,ESTA APROXIMACION MULTIDISCIPLINAR GENERARA UNA CLASIFICACION UNIFICADA DE LOS COMPONENTES DE LA CROMATINA Y UN ANALISIS COMPRENSIVO DE LA DIVERSIDAD DE HPTMS EN TODOS LOS PRINCIPALES LINAJES EUCARIOTAS, ESTE ESTUDIO DESCUBRIRA LOS COMPONENTES DEL CODIGO DE HISTONAS COMPARTIDO POR TODOS LOS EUCARIOTAS, ASI COMO LAS NOVEDADES EVOLUTIVAS EN LINAJES EUCARIOTAS ESPECIFICOS, MAS AUN, NUESTRA APROXIMACION FILOGENETICA COMPARATIVA NOS PERMITIRA RECONSTRUIR LA CO-EVOLUCION DE LOS COMPONENTES DE LA CROMATINA, LAS HPTMS Y SU RED DE INTERACCIONES, ASI COMO INVESTIGAR EL POTENCIAL ORIGEN PRE-EUCARIOTA (EN ARQUEAS) DE ESTOS ELEMENTOS DE LA CROMATINA, EN RESUMEN, LOS RESULTADOS DE ESTE PROYECTO PROPORCIONARAN NUEVO CONOCIMIENTO SOBRE EL ORIGEN Y LA EVOLUCION DE LA CROMATINA, ASI PUES, EL PROYECTO TENDRA UN GRAN IMPACTO EN NUESTRO ENTENDIMIENTO DE LA BIOLOGICA DE LOS GENOMAS Y SU EVOLUCION, ORIGEN DE EUCARIOTAS\ARCHAEA\MODIFICACIONES DE HISTONAS\EPIGENETICA\REGULACION GENOMICA\REDES DE INTERACCION DE LA CROMATINA\FILOGENIA\RECONSTRUCCION ESTADOS ANCESTRALES