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AGL2014-55081-R

Financiado

DETECCION SENSIBLE DE VIRUS TRANSMITIDOS POR ALIMENTOS UTILIZANDO AMPLIFICACION...

DETECCION SENSIBLE DE VIRUS TRANSMITIDOS POR ALIMENTOS UTILIZANDO AMPLIFICACION DIRIGIDA Y NGS Y EVALUACION DE LA TRANSMISION Y PATOLOGIA DE LOS VIRUS DNA EXCRETADOS LAS ENFERMEDADES TRANSMITIDAS POR LOS ALIMENTOS SON UN IMPORTANTE PROBLEMA DE SALUD PUBLICA EN TODO EL MUNDO, LAS PRACTICAS DE PRODUCCION A GRAN ESCALA, LA GLOBALIZACION DEL SUMINISTRO DE ALIMENTOS Y LA DISTRIBUCION A DISTANCIAS G... ver más

01/01/2014

230K€

Presupuesto del proyecto: 230K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 328

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2014-01-01

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Participantes

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE BARCELONA

Total investigadores 328

Presupuesto del proyecto 230K€

Descripción del proyecto LAS ENFERMEDADES TRANSMITIDAS POR LOS ALIMENTOS SON UN IMPORTANTE PROBLEMA DE SALUD PUBLICA EN TODO EL MUNDO, LAS PRACTICAS DE PRODUCCION A GRAN ESCALA, LA GLOBALIZACION DEL SUMINISTRO DE ALIMENTOS Y LA DISTRIBUCION A DISTANCIAS GEOGRAFICAS MAS GRANDES HAN SIDO FACTORES CATALIZADORES DE BROTES DE ENFERMEDADES TRANSMITIDAS POR ALIMENTOS, LOS PROTOCOLOS ACTUALES UTILIZADOS PARA LA DETECCION DE VIRUS EN ALIMENTOS DAN INFORMACION DEL PATOGENO ESPECIFICO ANALIZADO, PERO NO PROPORCIONAN INFORMACION SOBRE OTROS AGENTES PATOGENOS O LOS VARIANTES PRESENTES, EN EL PROYECTO AGL2011-30461-C02-01 / ALI, EL GRUPO SOLICITANTE HA APLICADO TECNICAS DE METAGENOMICA, Y HA CONSEGUIDO LA IDENTIFICACION DE UNA AMPLIA DIVERSIDAD DE VIRUS EN AGUAS RESIDUALES; TAMBIEN SE HA TRABAJADO EN LA MEJORA DE LAS HERRAMIENTAS DE BIOINFORMATICA Y EL ANALISIS DE LOS DATOS DE METAGENOMICA, DESARROLLANDO FILTROS PARA LA ELIMINACION DE SECUENCIAS DE BAJA COMPLEJIDAD Y PROTOCOLOS COMPUTACIONALES MEJORADOS PARA EL ENSAMBLAJE DE SECUENCIAS Y LA ANOTACION TAXONOMICA, LOS RESULTADOS DE ESTE ESTUDIO HAN MOSTRADO QUE ENSAYOS DE PCR ANIDADA O Q(RT)PCR ESPECIFICOS PARA UN VIRUS , DETECTABAN ALGUNOS PATOGENOS QUE NO ERAN DETECTADOS CON LOS PROTOCOLOS DE METAGENOMICA ACTUALES, PARA SUPERAR ESAS IMPORTANTES LIMITACIONES DE LA APLICACION DE TECNICAS DE METAGENOMICA EN SEGURIDAD ALIMENTARIA, SE DESARROLLARAN NUEVOS PROTOCOLOS USANDO NGS TARGET ENRICHMENT PARA LA DETECCION DE LAS DIVERSAS CEPAS DE GRUPOS VIRALES SELECCIONADOS: NOROVIRUS (NOV), EL PATOGENO VIRAL MAS FRECUENTE DE ORIGEN ALIMENTARIO, Y TAMBIEN PARA PATOGENOS VIRALES UTILIZADOS COMO INDICADORES DE CONTAMINACION FECAL, ADENOVIRUS HUMANOS (HADV), OTROS GRUPOS VIRALES ANALIZADOS CON LOS NUEVOS PROTOCOLOS SERAN FAMILIAS DE VIRUS ADN CON UNA AMPLIA DIVERSIDAD DE CEPAS VIRALES DETECTADOS EN ESTUDIOS ANTERIORES DE METAGENOMICA DE AGUAS RESIDUALES URBANAS: CIRCOVIRUS-LIKE Y DOS FAMILIAS CON VIRUS ONCOGENICOS, POLIOMAVIRUS Y PAPILOMAVIRUS, EL ESTUDIO DESCRITO EN ESTA PROPUESTA DE INVESTIGACION TIENE COMO PRIMER OBJETIVO DESARROLLAR PROTOCOLOS SENSIBLES PARA LA IDENTIFICACION DE LAS DIVERSAS CEPAS DE GRUPOS VIRALES DE PATOGENOS SELECCIONADOS EN AGUA Y ALIMENTOS DESARROLLANDO PROTOCOLOS DE SNG CON ENRIQUECIMIENTO DE DIANAS SELECCIONADAS EN UN ENSAYO MULTIPLEX DE METAGENOMICA, EL SEGUNDO OBJETIVO ES EL ESTUDIO DE LA DIVERSIDAD, LA PREVALENCIA Y LA ESTACIONALIDAD DE VIRUS ADN EXCRETADOS EN LA POBLACION (ADENOVIRUS, POLIOMAVIRUS, PAPILOMAVIRUS Y CIRCOVIRUS-LIKE ) MEDIANTE EL ANALISIS DE AGUAS RESIDUALES, LOS NUEVOS PROTOCOLOS SE UTILIZARAN TAMBIEN PARA UN TERCER OBJETIVO, ANALIZAR ALIMENTOS DE ALTO RIESGO (MARISCOS Y VERDURAS FRESCAS) Y MUESTRAS DE MANOS DE MANIPULADORES DE ALIMENTOS, ANALIZANDO LOS VIRUS ADN Y LOS NOROVIRUS, LOS PATOGENOS MAS IMPORTANTES DE ORIGEN ALIMENTARIO, FINALMENTE, EL CUARTO OBJETIVO ES ANALIZAR LA INFECTIVIDAD Y PATOGENICIDAD DEL VIRUS ADN MEDIANTE EL ANALISIS DE BIOPSIAS DE POLIPOS COLORRECTALES Y MUESTRAS DE SANGRE, CON LA COLABORACION DE UN EQUIPO MEDICO ESPECIALIZADO, EL ANALISIS DE LOS VIRUS ADN EN BIOPSIAS DE POLIPOS COLORRECTALES CONSTITUIRA UN ESTUDIO PRELIMINAR DE SU POTENCIAL PAPEL EN EL DESARROLLO DE POLIPOS Y DE ALGUNOS TIPOS DE CANCERES COLORRECTALES, LAS TECNICAS DE SECUENCIACION DE ALTO RENDIMIENTO ESTAN EVOLUCIONANDO RAPIDAMENTE, SU SENSIBILIDAD Y APLICABILIDAD MEJORARAN Y SERAN HERRAMIENTAS ANALITICAS MUY VALIOSAS PARA EL CONTROL DE LA SEGURIDAD DE AGUA Y ALIMENTOS, VIRUS\SEGURIDAD ALIMENTARIA\SNG\NOROVIRUS\POLYOMAVIRUS\PAPILLOMAVIRUS\ADENOVIRUS\CIRCOVIRUS

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