Hola,
¿eres nuevo aquí?

Regístrate gratis y conecta tu empresa con financiación pública, partners y proyectos.

Tengo cuenta

Regístrate

Ver video

PATHONGEN-TRACE

Financiado

Cerrado

Next Generation Genome Based High Resolution Tracing of Pathogens

"Next generation sequencing (NGS) has fundamentally altered genomic research. New developments will bring NGS costs and performance down to an everybody's technology with extreme potential for ultra fast and accurate molecular typ... ver más

30/06/2016

FZB

8M€

Presupuesto del proyecto: 8M€

Líder del proyecto

FORSCHUNGSZENTRUM BORSTEL LEIBNIZ LUNGENZENTR... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Ver 6 Participantes

Financiación concedida El organismo FP7 notifico la concesión del proyecto el día 2016-06-30 No tenemos la información de la convocatoria

0% 77% 100%

Información adicional privada

No hay información privada compartida para este proyecto. Habla con el coordinador.

6 Participantes

FZB

0.00€ | Lider

APPL MATHS NV

N.D. | Participante

EURICE EUROPEAN RESEARCH AND...

N.D. | Participante

Conecta tu I+D

¿Tienes un proyecto y buscas un partner? Gracias a nuestro motor inteligente podemos recomendarte los mejores socios y ponerte en contacto con ellos. Te lo explicamos en este video

Proyectos interesantes

CSIC10-1E-226 Pirosecuenciador para ultrasecuenciación Escala Media 157K€ Cerrado

CSIC15-CE-3190 Plataforma de Secuenciación de Nueva generación para Aplicac... 449K€ Cerrado

RYC2021-031461-I Genómica y bioinformática de patógenos 236K€ Cerrado

PLATAFORMA BIOINFORMÁTICA PARA EL MANEJO Y AN... PLATAFORMA BIOINFORMÁTICA PARA EL MANEJO Y ANÁLISIS DE DATOS... 214K€ Cerrado

SAF2016-80255-R NUEVAS APROXIMACIONES PARA IDENTIFICAR VARIANTES PATOGENICAS... 97K€ Cerrado

PTQ-14-07242 INVESTIGACIÓN DE NUEVAS APROXIMACIONES DE SECUENCIACIÓN MASI... Cerrado

Líder del proyecto

FORSCHUNGSZENTRUM BORSTEL LEIBNIZ LUNGENZENTR... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5

Presupuesto del proyecto 8M€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto "Next generation sequencing (NGS) has fundamentally altered genomic research. New developments will bring NGS costs and performance down to an everybody's technology with extreme potential for ultra fast and accurate molecular typing and diagnostic as it provides the ultimate whole genome information. However, technical and bioinformatics constraints, restrict the application of NGS to few highly experienced laboratories. The goal of this project is the transition of NGS from a basic research tool to a highly efficient technology for pathogen typing and diagnostics on the EU level. This objective will be achieved by establishing a unique European consortium that brings together three SMEs leading in the fields of ""data to knowledge"" and ""NGS genome research"" with leading experts in clinical microbiology of three model pathogens of high European and worldwide importance (methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Campylobacter spp., and M. tuberculosis complex. Particularly we will i) develop bio-informatics pipelines for quality-controlled and easy interpretation of NGS data, ii) optimize sample preparation steps and evaluate newest NGS (Ion Torrent) and Optical Mapping (OM) technologies, and iii) develop new, dedicated NGS-based pathogen diagnostic kits. Ultimate goal is to generate automatically plain language reports and to implement GIS and space-time cluster detections for automatic early-warning systems based on NGS-data. Application programming interfaces and a microbial typing ontology for a linked web will be developed. Product-like prototypic software development for automatic analysis of microbial NGS-data will be guided by two leading SMEs. The development of new and improved tools/technologies in this SME-targeted project will overcome existing obstacles of NGS and open the door for a wide application of NGS for European scientists and clinical microbiologist, thus fostering competitiveness of Europe in NGS research and medical applications."

Conecta tu I+D

Entra hoy

¿Olvidé mi contraseña?

Financiación

Empresas

CTIs/Universidades

Proyectos

Investigadores