Descripción del proyecto
LAS MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES DE PROTEINAS (PTMS) CONTROLAN EFICAZMENTE LAS ACTIVIDADES BIOLOGICAS, PERMITIENDO RAPIDAS RESPUESTAS ADAPTATIVAS A CAMBIOS AMBIENTALES, ESTAS MODIFICACIONES AUMENTAN LA DIVERSIDAD FUNCIONAL DEL PROTEOMA MEDIANTE LA ADICION COVALENTE DE GRUPOS FUNCIONALES A PROTEINAS, LA ESCISION PROTEOLITICA DE LAS SUBUNIDADES REGULADORAS O LA DEGRADACION DE PROTEINAS ENTERAS, EL OBJETIVO DE ESTE SUBPROYECTO I, SE CENTRA EN EL ESTUDIO DE LA PTM POR ACETILACION QUE AGREGA UN GRUPO ACETILO AL GRUPO EPSILON AMINO DE UN RESIDUO DE LISINA DE UNA PROTEINA, QUE NEUTRALIZA LA CARGA POSITIVA Y AUMENTA EL TAMAÑO DE LA CADENA LATERAL,EN EUCARIOTAS, LOS EFECTOS DE LA ACETILACION DE PROTEINAS HAN SIDO BIEN DESCRITOS, SOBRE TODO EN EL CONTEXTO DE LA ACETILACION DE HISTONAS, PERO EN LA ULTIMA DECADA, SE HA HECHO EVIDENTE QUE MUCHAS PROTEINAS, QUE NO SON HISTONAS, TAMBIEN SON N-LISINACETILADAS Y QUE ESTA MODIFICACION POSTRADUCCIONAL ES SIMILAR EN ABUNDANCIA EN ARQUEAS Y BACTERIAS, CON ESTE PROYECTO SE PRETENDE COMPRENDER COMO ESTE MECANISMO REGULADOR SE RIGE POR LAS CONDICIONES AMBIENTALES Y COMO SE COORDINAN CON OTROS MECANISMOS REGULADORES, ESPECIALMENTE POR FACTORES DE TRANSCRIPCION QUE TAMBIEN PUEDEN SER ACETILADOS, TRES PUNTOS SON CLAVE EN EL EMPLEO DE E, COLI COMO BIOFACTORIA CELULAR: I) LA PTM POR ACETILACION ESTA INTIMAMENTE RELACIONADA CON EL METABOLISMO REBOSADERO DE ACETATO, QUE ES UN INCONVENIENTE IMPORTANTE PARA LOS BIOPROCESOS INDUSTRIALES QUE EMPLEAN E, COLI, YA QUE EL ACETATO INHIBE EL CRECIMIENTO CELULAR EN CULTIVOS DE ALTA DENSIDAD Y SUPONE UNA PERDIDA DE FUENTE DE CARBONO Y DE ENERGIA METABOLICA, LO QUE LIMITA EL RENDIMIENTO DEL BIOPROCESO, II) MUCHAS DE LAS PROTEINAS METABOLICAS DE E, COLI SE ENCUENTRAN ACETILADAS, LO CUAL PUEDE INFLUIR EN LOS FLUJOS METABOLICOS Y EN LA PRODUCCION DE BIOMASA, III) LA REGULACION POR ACETILACION DE DETERMINADAS PROTEINAS INFLUYE EN LA MOTILIDAD BASADA EN FLAGELOS Y FIMBRIAS, UN FENOTIPO CRITICO PARA LA PATOGENESIS DE MUCHOS ORGANISMOS,LA ABUNDANCIA DE DATOS OBTENIDOS CON TECNICAS DE ALTO RENDIMIENTO Y LOS HITOS ALCANZADOS EN CADA UNO DE LOS PAQUETES DE TRABAJO (WPI1-5) SERAN EMPLEADOS PARA DESARROLLAR UN MODELO LOGICO MULTI-VALUADO (MVLM) (WPI6 Y WPII 1-4), EXISTIRA UN FLUJO DE INFORMACION CONSTANTE CON EL EQUIPO DEL SUBPROYECTO II, ESTO NOS PERMITIRA VALIDAR EL MODELO Y PREDECIR LA CONFIGURACION MAS ADECUADA DE LOS ESTADOS DE ACETILACION DEL PROTEOMA QUE IMPLIQUE UN MAXIMO RENDIMIENTO EN LA PRODUCCION DE PROTEINAS RECOMBINANTES, ESTA CONFIGURACION SERA TAMBIEN LA OPTIMA PARA LA PRODUCCION DE OTROS BIOFARMACOS DE INTERES O PLASTICOS BIODEGRADABLES, EN RESUMEN, EL DESARROLLO DE ESTE MODELO MVLM ES UN MARCO FUNDAMENTAL EN LA INGENIERIA METABOLICA DE SISTEMAS PARA AUMENTAR LAS CAPACIDADES METABOLICAS DE E COLI BASADAS EN LA BIOLOGIA SINTETICA, ACETILACIÓN-DESACETILACIÓN\REGULACIÓN DE FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN\MODELO LÓGICO MULTI-VALUADO\BIOLOGÍA DE SISTEMAS\E.COLI