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RTI2018-096735-B-I00

Financiado
IDENTIFICACION DE MECANISMOS QUE OPERAN EN LA EVOLUCION DE PROTEINAS USANDO DESC...
IDENTIFICACION DE MECANISMOS QUE OPERAN EN LA EVOLUCION DE PROTEINAS USANDO DESCRIPTORES: IMPACTO EN APLICABILIDAD LAS PROTEINAS EVOLUCIONAN ADQUIRIENDO NUEVAS FUNCIONES O ADAPTANDOSE A NUEVOS ENTORNOS, HAY NUMEROSOS MECANISMOS POR LOS QUE LAS PROTEINAS ADQUIEREN FUNCIONES CONCRETAS Y DEPENDIENDO ESTOS MUCHO DE CONTEXTO, POR OTRO LADO, “FUNCIO... LAS PROTEINAS EVOLUCIONAN ADQUIRIENDO NUEVAS FUNCIONES O ADAPTANDOSE A NUEVOS ENTORNOS, HAY NUMEROSOS MECANISMOS POR LOS QUE LAS PROTEINAS ADQUIEREN FUNCIONES CONCRETAS Y DEPENDIENDO ESTOS MUCHO DE CONTEXTO, POR OTRO LADO, “FUNCION” ES UN TERMINO MUY GENERAL Y AMBIGUO QUE PUEDE ESTAR RELACIONADO CON ATRIBUTOS DIFERENTES EN UNA MISMA SECUENCIA, LOS NUMEROSOS ESFUERZOS QUE HA HABIDO PARA ORGANIZAR ESTA INFORMACION HAN DADO LUGAR A VOCABULARIOS CONTROLADOS ESTRUCTURADOS EN ONTOLOGIAS, A LA HORA DE EXPLICAR COMO LAS PROTEINAS ADQUIEREN NUEVOS PAPELES, LOS CONCEPTOS DE EVOLUCION MOLECULAR Y FENOTIPICA SIGUEN SIENDO CENTRALES EN EL DEBATE EVOLUTIVO, UN PROBLEMA QUE PERMANECE SIN RESOLVER Y QUE BAJO EL MODELO DE EVOLUCION NEUTRAL ESTA RELACIONADO CON EVENTOS DE NEO Y SUB-FUNCIONALIZACION, PSEUDOGENIZACION, ETC,, ENTRE OTROS PROCESOS GLOBALES, A NIVEL DE RESIDUO, LA MAYORIA DE LOS INTENTOS DE ESTABLECER REGLAS UNIVERSALES QUE EXPLIQUEN LAS SUBSTITUCIONES OBSERVADAS ENTRE AMINO ACIDOS HAN SIDO REFUTADOS, PRINCIPALMENTE DEBIDO A LIMITADA DIVERSIDAD TAXONOMICA UTILIZADA, ASI PUES, AUNQUE SE HA PROGRESADO, AUN DESCONOCEMOS COMO LA EVOLUCION OPERA A NIVEL DE GEN Y A NIVEL DE RESIDUO,ESTOS ASPECTOS HAN RECUPERADO PROTAGONISMO GRACIAS A QUE LAS TECNICAS DE SECUENCIACION MASIVA ESTAN AMPLIFICANDO ESTOS PROBLEMAS, PARTICULARMENTE IMPORTANTE HA SIDO EL AUMENTO DE SECUENCIAS PROVENIENTES DE REGIONES TAXONOMICA PREVIAMENTE INEXPLORADAS, PARA PODER ASIGNAR LA ACTIVIDAD POTENCIAL DE ESTOS NUEVOS GENES, Y PARA GUIAR SU CARACTERIZACION EXPERIMENTAL, NECESITAMOS DESARROLLAR NUEVOS METODOS COMPUTACIONALES,DE IGUAL MANERA, LOS PROBLEMAS RECURRENTES ASOCIADOS A LA ANOTACION AUTOMATICA DE SECUENCIAS, LA PREDICCION DE ESTRUCTURA DE PROTEINAS Y EL ESTABLECIMIENTO DE FILOGENIA SE ESTAN CONVIRTIENDO EN UN CUELLO DE BOTELLA CUANDO SE TRATA DE ESTABLECER HIPOTESIS ACERCA DE LA FUNCION, O APLICACIONES DERIVADAS, UN EJEMPLO DE ESTAS, ES ENTENDER EL EFECTO FUNCIONAL OBSERVADO EN LAS VARIANTES QUE OBSERVAMOS EN LA SECUENCIACION DE EXONES, DONDE TODAVIA HAY MUCHO MARGEN DE MEJORA,ASI PUES, BAJO EL MODELO ESTRUCTURA/SECUENCIA/FUNCION, Y ASUMIENDO EVOLUCION NEUTRAL, PROPONEMOS UNA REVISION DE LOS MECANISMOS SUBYACENTES EN LA EVOLUCION DE PROTEINAS EN EL CONTEXTO DE SET DE DATOS PROCEDENTES DE ENTORNOS MENOS CONOCIDOS, INCLUYENDO A UNA MEJOR INCLUSION DE LA DIVERSIDAD ESTRUCTURAL Y CONFORMACIONAL DE LAS PROTEINAS, PARA ENTENDER COMO LA EVOLUCION NEUTRAL OPERA EN DETERMINADAS REGIONES DE LAS PROTEINAS, ESTE CONOCIMIENTO SERVIRA PARA MEJORAR LA ANOTACION FUNCIONAL DE PROTEINAS, Y PARA INTERPRETAR EL EFECTO FUNCIONAL DE LAS VARIACIONES EN EL MODELO ESTRUCTURA/ SECUENCIA, CON GRAN POTENCIAL PARA LA INVESTIGACION BIOMEDICA, EN UN PRIMER ABORDAJE NOS CENTRAREMOS EN TRES SUPER FAMILIAS DE PROTEINAS, QUINASAS, GTPASAS, Y FOSFATASAS PRESTANDO PARTICULAR ATENCION A AQUELLAS QUE VIOLEN EL MODELO ESTRUCTURA/FUNCION, LA INFORMACION OBTENIDA SE EMPLEARA PARA ANALIZAR LA SUPERFAMILIA DE RECEPTORES NUCLEARES, EVOLUCIÓN DE PROTEÍNAS\BIOINFORMÁTICA ESTRUCTURAL\ESTRUCTURA/FUNCIÓN\FAMILIAS DE PROTEINAS ver más
01/01/2018
CSIC
109K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2018-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 109K€
Líder del proyecto
AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 2-3 552M