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RTI2018-102134-A-I00

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DESARROLLO DE UN MARCO BIOINFORMATICO PARA LA MEDICINA DE PRECISION EN NSCLC BAS...

DESARROLLO DE UN MARCO BIOINFORMATICO PARA LA MEDICINA DE PRECISION EN NSCLC BASADO EN LA INTEGRACION DE FIRMAS TRANSCRIPCIONALES Y DATOS FARMACOGENOMICOS A GRAN ESCALA EL CANCER DE PULMON DE CELULA NO PEQUEÑA (NSCLC) ES UN PROBLEMA DE SALUD PUBLICA DE PRIMER ORDEN, LAS OPCIONES TERAPEUTICAS ACTUALES COMBINAN QUIMIOTERAPIA, RADIOTERAPIA, TERAPIAS DIRIGIDAS Y, MAS RECIENTEMENTE, IMMUNOTERAPIA, LAS... ver más

01/01/2018

FUNDACIO INSTITUT...

109K€

Presupuesto del proyecto: 109K€

Líder del proyecto

FUNDACIO INSTITUT D?INVESTIGACIO BIOMEDICA DE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 16M€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

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FUNDACIO INSTITUT D?INVESTIGACIO BIOMEDICA DE... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 4-5 | 16M€

Presupuesto del proyecto 109K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto EL CANCER DE PULMON DE CELULA NO PEQUEÑA (NSCLC) ES UN PROBLEMA DE SALUD PUBLICA DE PRIMER ORDEN, LAS OPCIONES TERAPEUTICAS ACTUALES COMBINAN QUIMIOTERAPIA, RADIOTERAPIA, TERAPIAS DIRIGIDAS Y, MAS RECIENTEMENTE, IMMUNOTERAPIA, LAS TERAPIAS DIRIGIDAS EN NSCLC USUALMENTE SE PRESCRIBEN EN FUNCION DE DETERMINADAS ALTERACIONES GENOMICAS DETECTADAS EN EL TUMOR DEL PACIENTE, SIN EMBARGO, LAS ALTERACIONES GENETICAS SOLO PUEDEN RECAPITULAR PARCIALMENTE LA EVOLUCION DEL TUMOR Y SU RESPUESTA AL TRATAMIENTO, Y MUCHOS PACIENTES QUE RECIBEN ESTOS TRATAMIENTOS TIENEN RESPUESTAS MUY POBRES O RECAEN AL CABO DE RELATIVAMENTE POCO TIEMPO POR RAZONES QUE AUN NO ESTAN DEL TODO CLARAS, EN ESTE SENTIDO, UNA MAYORIA DE PACIENTES DE NSCLC SE PODRIAN BENEFICIAR DE NUEVAS TERAPIAS DIRIGIDAS QUE TUVIERAN UN EFECTO POSITIVO EN EL PRONOSTICO DE LOS PACIENTES, EN ESTE PROYECTO, QUEREMOS IDENTIFICAR NUEVAS ESTRATEGIAS TERAPEUTICAS PARA PACIENTES DE NSCLC BASADAS EN LA INTEGRACION DE: 1) PERFILES TRANSCRIPCIONALES DE TUMORES Y LINEAS CELULARES HUMANAS; 2) UNA COLECCION EXTENSA DE FIRMAS GENICAS QUE SERAN EVALUADAS COMO MODULOS TRANSCRIPCIONALES; Y 3) DATOS FARMACOGENOMICOS A GRAN ESCALA DE LINEAS CELULARES DE CANCER, PRIMERO IDENTIFICAREMOS GRUPOS COHERENTES DE TUMORES Y LINEAS CELULARES DE NSCLC MEDIANTE EL ANALISIS DE UN AMPLIO CONJUNTO DE DATOS DE PERFILES DE EXPRESION (N=~8,000 TUMORES Y ~250 LINEAS CELULARES), EN CADA MUESTRA, EVALUAREMOS LA ACTIVIDAD TRANSCRIPCIONAL GLOBAL DE MILES DE FIRMAS GENICAS QUE REPRESENTAN VIAS DE SEÑALIZACION, PROCESOS BIOLOGICOS, FUNCIONES MOLECULARES, Y MODULOS TRANSCRIPCIONALES ESPECIFICOS DE NSCLC, EVALUANDO LOS NIVELES DE ACTIVIDAD DE ESTAS FIRMAS EN EL CONJUNTO ENTERO DE TUMORES Y LINEAS, APLICAREMOS TECNICAS DE "MACHINE LEARNING" NO SUPERVISADAS PARA DEFINIR GRUPOS COHERENTES DE MUESTRAS QUE MUESTREN PATRONES SIMILARES A NIVEL DE ACTIVACION DE LAS DIFERENTES FIRMAS TRANSCRIPCIONALES, PARA IDENTIFICAR POTENCIALES FARMACOS CANDIDATOS PARA CADA UNO DE LOS GRUPOS TRANSCRIPCIONALES DEFINIDOS, RECOPILAREMOS E INTEGRAREMOS DATOS DISPONIBLES DE ESTUDIOS FARMACOLOGICOS A GRAN ESCALA EN LINEAS CELULARES DE CANCER: PRISM, CCLE, GDSC, Y CTRP, ESTOS ESTUDIOS HAN EVALUADO LA EFECTIVIDAD DE HASTA MILES DE COMPUESTOS EN CENTENARES DE LINEAS CELULARES DE NSCLC (ENTRE OTRAS), ASI, PARA CADA GRUPO TRANSCRIPCIONAL DE MUESTRAS Y LINEAS CELULARES, IDENTIFICAREMOS LOS COMPUESTOS FARMACOLOGICOS QUE ATACAN MAS SELECTIVAMENTE A LAS LINEAS CELULARES DE ESE GRUPO, ASI FINALMENTE OBTENDREMOS UNA LISTA DE FARMACOS CANDIDATOS PARA CADA GRUPO TRANSCRIPCIONAL, PARA PODER VALIDAR LA EFECTIVIDAD DEL MODELO DESARROLLADO, OBTENDREMOS PERFILES TRANSCRIPCIONALES (RNA-SEQ) DE 50 MUESTRAS DE TUMORES NSCLC (YA RECOLECTADOS), UNA VEZ TENGAMOS EL PERFIL TRANSCRIPCIONAL, ESTAS MUESTRAS SE ASIGNARAN A UNO DE LOS GRUPOS TRANSCRIPCIONALES PREVIAMENTE DEFINIDOS EN FUNCION DE LA SIMILITUD DE SU PERFIL TRANSCRIPCIONAL, DE ESTOS 50 TUMORES OBTENDREMOS MODELOS ORTOTOPICOS DE RATON DERIVADOS DE PACIENTE (LA MAYORIA YA ESTAN GENERADOS), Y LES TRATAREMOS CON EL COMPUESTO CANDIDATO PARA ESE GRUPO OBTENIDO DEL ANALISIS DE LOS DATOS FARMACOLOGICOS, EL TRATAMIENTO SE HARA POR TRIPLICADO, Y EL VOLUMEN FINAL DEL TUMOR SE COMPARARA CON EL DE TRES RATONES CONTROL DEL MISMO INDIVIDUO, EN RESUMEN, ESTE PROYECTO PRETENDE APLICAR LA BIOINFORMATICA INTEGRATIVA PARA IDENTIFICAR NUEVAS TERAPIAS DIRIGIDAS EN NSCLC QUE PUEDAN CONTRIBUIR A MEJORAR EL PRONOSTICO DE LOS PACIENTES, MEDICINA DE PRECISIÓN\NSCLC\BIOINFORMÁTICA\FIRMAS TRANSCRIPCIONALES\FARMACOGENÓMICA

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