Descripción del proyecto
EN LA ACTUALIDAD, GRAN PARTE DEL DIAGNOSTICO Y DE LAS DECISIONES TERAPEUTICAS EN CANCER Y EN OTRAS MUCHAS ENFERMEDADES SE REALIZA EN FUNCION DE UNO O UNOS POCOS BIOMARCADORES, SIN EMBARGO, CADA VEZ ES MAS EVIDENTE QUE LAS APROXIMACIONES BASADAS EN UN UNICO GEN EN ENFERMEDADES COMPLEJAS COMO EL CANCER SON CLARAMENTE INSUFICIENTES Y HAN DE EVOLUCIONAR A APROXIMACIONES BASADAS EN VIAS CELULARES MAS COMPLEJAS QUE DEN CUENTA DEL MECANISMO DE LA ENFERMEDAD O DEL MECANISMO DE ACCION DEL FARMACO, EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO CONSISTE EN UTILIZAR LAS ENORMES CANTIDADES DE DATOS GENOMICOS (PRINCIPALMENTE MUTACIONALES, EPIGENOMICOS Y DE EXPRESION GENICA) DISPONIBLES DE CANCER JUNTO CON LA INFORMACION SOBRE VIAS COMPLEJAS CELULARES (PRINCIPALMENTE DE SEÑALIZACION, METABOLICAS Y REDES DE INTERACCION DE PROTEINAS) Y LAS NUEVAS METODOLOGIAS COMPUTACIONALES QUE PERMITEN ELABORAR MODELOS RAZONABLEMENTE EXACTOS SOBRE SU FUNCIONAMIENTO, EN CONCRETO, LA RECIENTE DISPONIBILIDAD PUBLICA DE DATOS GENOMICOS DE DECENAS DE MILES DE PACIENTES DE CANCER, Y EN MENOR MEDIDA DE OTRAS ENFERMEDADES, OFRECE POR PRIMERA VEZ LA POSIBILIDAD DE REALIZAR ESTUDIOS CON GRAN POTENCIA ESTADISTICA DE LOS PERFILES DE ALTERACIONES DE DISTINTOS ASPECTOS DE LA FUNCION GENICA ENTRE Y DENTRO DE DISTINTOS TIPOS DE CANCER, ESTOS ESTUDIOS BASADOS EN LA INTERPRETACION DE DATOS MASIVOS SOBRE LOS MODELOS DE REDES DE INTERACCIONES FISICAS Y FUNCIONALES PERMITEN DETECTAR PATRONES COMUNES QUE RELACIONEN DISTINTOS TIPOS DE CANCERES CON SUS BASES GENETICAS MEDIANTE UN MEJOR ENTENDIMIENTO DE LOS MECANISMOS MOLECULARES DE LA ENFERMEDAD, TAMBIEN PERMITE ACERCARSE A LA INDIVIDUALIZACION DE LOS PERFILES MUTACIONALES, EPIGENOMICOS Y DE EXPRESION GENICA QUE ABREN LA PUERTA A LA PERSONALIZACION DE DIAGNOSTICOS Y TERAPIAS, ESTOS MODELOS SE PUEDEN USAR PARA DISTINGUIR LOS GENES CUYA DESREGULACION ES CLAVE EN EL CANCER (DRIVER GENES) DEL FONDO DE DESREGULACION INDUCIDO POR LA ENFERMEDAD (PASSENGER GENES) MEDIANTE EL RESCATE VIRTUAL (IN SILICO) DE SU FUNCIONALIDAD ORIGINAL, DE LA MISMA MANERA ESTOS MODELOS PERMITEN LA COMPRENSION DEL MECANISMO DE ACCION DE FARMACOS O PRINCIPIOS ACTIVOS CON DIANA CONOCIDA, EN ESTE CASO SE PRETENDE INVESTIGAR LAS CAUSAS DE FRACASOS TERAPEUTICOS Y SE DESARROLLARA UNA ESTRATEGIA PARA PREDECIR EFECTOS SECUNDARIOS (GENERALES O ESPECIFICOS DE INDIVIDUOS), TAMBIEN SE REALIZARA UN ESTUDIO MASIVO SOBRE EL EFECTO DE COMBINACIONES DE FARMACOS SOBRE LOS MODELOS DE FUNCION CELULAR, LOS RESULTADOS SE CORRELACIONARAN CON LOS QUE SE SABE EN LA ACTUALIDAD SOBRE RESULTADOS DE TERAPIAS COMBINADAS, ADEMAS SE PROPONDRA EL REPOSICIONAMIENTO DE FARMACOS EN FUNCION DEL EFECTO SOBRE EL SISTEMA REPRESENTADO POR LOS MODELOS DE FUNCION CELULAR, FINALMENTE, SE EXPLOTARAN VULNERABILIDADES DEL CANCER APLICANDO ESTRATEGIAS COMO LA DE LA BUSQUEDA DE LETALIDAD SINTETICA O LA SIMULACION DE KOS VIRTUALES PARA PROPONER NUEVAS DIANAS TERAPEUTICAS,PARTE DE LAS PROPUESTAS SOBRE NUEVAS DIANAS POTENCIALES SERAN VALIDADAS CON NUESTROS COLABORADORES, EL RESTO DEL CONOCIMIENTO GENERADO EN ESTE PROYECTO SERA HECHO PUBLICO MEDIANTE DISTINTAS BASES DE DATOS, ESTE PROYECTO TAMBIEN GENERARA HERRAMIENTAS BIOINFORMATICAS QUE PERMITIRAN EXPANDIR LOS RESULTADOS OBTENIDOS A OTRAS ENFERMEDADES Y A OTROS CANCERES, BIOINFORMATICA\BIOLOGÍA DE SISTEMAS\RUTAS\REDES\MECANISMOS DE ENFERMEDAD Y ACCION DE FAR\BIOMARCADORES\TERAPIA