DESARROLLO DE METODOS CRISTALOGRAFICOS (IV) Y SU APLICACION AL METABOLISMO DEL A...
DESARROLLO DE METODOS CRISTALOGRAFICOS (IV) Y SU APLICACION AL METABOLISMO DEL AZUFRE
EL PRESENTE PROYECTO DE INVESTIGACION, CONTINUACION DE TRES PREVIOS, PERSIGUE DOS CLASES DE OBJETIVOS CIENTIFICOS DIFERENCIADOS Y NO OBSTANTE COMPLEMENTARIOS: POR UNA PARTE EL DESARROLLO DE METODOS CRISTALOGRAFICOS PARA LA RESOLUC...
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Financiación
concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto
el día 2012-01-01
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Descripción del proyecto
EL PRESENTE PROYECTO DE INVESTIGACION, CONTINUACION DE TRES PREVIOS, PERSIGUE DOS CLASES DE OBJETIVOS CIENTIFICOS DIFERENCIADOS Y NO OBSTANTE COMPLEMENTARIOS: POR UNA PARTE EL DESARROLLO DE METODOS CRISTALOGRAFICOS PARA LA RESOLUCION DE ESTRUCTURAS CRISTALINAS DE MACROMOLECULAS Y POR OTRA SU APLICACION PRACTICA EN PROYECTOS DE INTERES BIOLOGICO O BIOTECNOLOGICO TALES COMO EL ESCLARECIMIENTO DE LA BASE MOLECULAR DEL PROCESO DE DEGRADACION DE SULFONATOS -CONTAMINANTES ESTOS MUY EXTENDIDOS EN MEDIOS ACUATICOS Y SUELOS- POR PARTE DEL COMPLEJO CATALITICO DE LA BACTERIA P. PUTIDA O EL ESCLARECIMIENTO DEL MODELO ESTRUCTURAL DE SLIDING-DIMER PARA LOS REGULADORES TIPO LTTR.UNA NOVEDAD RELATIVA AL DESARROLLO DE METODOS DE FASEADO, QUE CONTINUARA LA LINEA DE LOS DOS PROYECTOS ANTERIORES, LA CONSTITUYE EL HECHO DE QUE SE HA CENTRADO EL ENFOQUE EN EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS COMPUTACIONALES QUE EXPLOTEN EL CALCULO MASIVO, A TRAVES DE LA PARALELIZACION DE PROCESOS BASADOS EN LA MULTISOLUCION Y SU DISTRIBUCION A NUESTRO GRID DE COMPUTADORAS. EN EFECTO, NUESTRO PROGRAMA ARCIMBOLDO (HTTP://CHANGO.IBMB.CSIC/ARCIMBOLDO), LANZADO EN 2009 Y DISTRIBUIDO A MAS DE 300 LABORATORIOS EN TODO EL MUNDO, SERA DESARROLLADO Y COMPLEMENTADO CON UNA SERIE DE PROGRAMAS ANCILARES CON EL OBJETIVO DE EXTENDER SUS CAPACIDADES PARA RESOLVER ESTRUCTURAS DE MAYOR TAMAÑO A RESOLUCIONES DE HASTA 3 A. CON ESTE FIN, NUESTRO GRUPO COMPUESTO POR DIEZ INVESTIGADORES Y TECNICOS DESARROLLARA E IMPLEMENTARA ALGORITMOS QUE ENGLOBEN LA COMBINACION DE VARIAS FUENTES DE INFORMACION SOBRE LAS FASES (EXPERIMENTAL Y ESTEREOQUIMICA), CLUSTERIZACION EN EL ESPACIO REAL Y EN EL ESPACIO RECIPROCO, SOBRE GPUS DE TARJETAS GRAFICAS, CONSTRUCCION A LA CARTA DE LIBRERIAS DE FRAGMENTOS DE ESTRUCTURA SECUNDARIA Y DERIVADOS DE ESTRUCTURAS HOMOLOGAS, MODELADO Y TRATAMIENTO DE DATOS PATOLOGICOS. ESTAS HERRAMIENTAS SERAN DESARROLLADAS PARA SU USO EN SUPERCOMPUTADORES. ADEMAS, ABRIREMOS UN SERVIDOR-WEB PUBLICO PARA LOS PROGRAMAS SHELX EN BARCELONA. ES INTERESANTE RESEÑAR QUE A PESAR DE QUE EL DESARROLLO DE METODOS HABITUALMENTE NO DA LUGAR A PUBLICACIONES EN REVISTAS DE ELEVADO INDICE DE IMPACTO, SIN EMBARGO UNO DE LOS TRES ARTICULOS MAS CITADOS EN TODAS LAS DISCIPLINAS A LO LARGO DE LOS ULTIMOS DIEZ AÑOS ES PRECISAMENTE UNO PUBLICADO EN 2007 EN ACTA CRYSTALLOGRAPHICA, QUE DESCRIBE EL PAQUETE DE SOFTWARE SHELX (VEASE HTTP://WWW.SCIENCEWATCH.COM/DR/COU/2011/11JANALLPAPERS