Descripción del proyecto
LA PRESENTE PROPUESTA PERSIGUE DOS TIPOS DE OBJETIVOS CLARAMENTE DIFERENCIADOS Y SIN EMBARGO COMPLEMENTARIOS, POR UNA PARTE, EL DESARROLLO DE METODOS CRISTALOGRAFICOS PARA LA RESOLUCION DE ESTRUCTURAS MACROMOLECULARES Y POR LA OTRA SU APLICACION A PROYECTOS DE INTERES BIOMEDICO O BIOTECNOLOGICO, TALES COMO LA ELUCIDACION DE LA BASE MOLECULAR DE ENFERMEDADES O EL DESARROLLO DE BIOCATALIZADORES QUE LLEVEN A CABO REACCIONES DE FORMACION DE ENLACES CARBONO-CARBONO ORIENTADAS A TRANSFORMACIONES ESTRATEGICAS DE INTERES INDUSTRIAL,LA INVESTIGACION EN NUEVOS METODOS CRISTALOGRAFICOS, EXTENDIENDO LA LINEA DE LOS CUATRO PROYECTOS PREVIOS, CIFRARA PARTICULAR ENFASIS EN EL DESARROLLO DE METODOS AB INITIO DE RESOLUCION DE ESTRUCTURAS MACROMOLECULARES EXPLOTANDO CALCULO MASIVO,NUESTROS ALGORITMOS SON UNICOS EN SU PARALELIZACION DE METODOS DE MULTISOLUCION DISTRIBUIDOS EN UN GRID DE COMPUTADORES O SUPERCOMPUTADOR, YA QUE EL MOTOR CONCEPTUAL ESTA SIEMPRE DIRIGIDO POR LOS DATOS EXPERIMENTALES, DONDE OTROS ENFOQUES CONFIAN EN PREDICCIONES BIOINFORMATICAS, ASI, NUESTRO SOFTWARE ARCIMBOLDO (HTTP://CHANGO,IBMB,CSIC,ES/ARCIMBOLDO), LANZADO EN 2009 Y DISTRIBUIDO A 700 LABORATORIOS EN TODO EL MUNDO SERA DESARROLLADO Y COMPLEMENTADO CON UNA SERIE DE PROGRAMAS ANCILARES CON EL OBJETIVO DE CONVERTIR LA RESOLUCION DE ESTRUCTURAS AB INITIO EN UN METODO PREFERENTE, NOS PROPONEMOS DESARROLLAR UNA SERIE DE VIAS PARA EXPANDIR SU ALCANCE, EXTENDIENDOLO A LA RESOLUCION DE ESTRUCTURAS MAS COMPLEJAS Y HASTA RESOLUCIONES DE 3 A, BAJO LA PRESENTE PROPUESTA, NUESTRO GRUPO COMPUESTO POR 8 INVESTIGADORES Y TECNICOS SE PROPONE COMENZAR POR INVESTIGAR EL EXPERIMENTO OPTIMO DE GENERACION DE DATOS DE DIFRACCION PARA EL CASO DE LA RESOLUCION AB INITIO, EXPLOTANDO LA FALTA DE ISOMORFISMO -EN LUGAR DE EVITARLA- Y DETERMINANDO LA COMBINACION OPTIMA DE DATOS DE DIFRACCION SOBRE NANOCRISTALES CON ESTE OBJETIVO,UN FORMALISMO ESTADISTICO BAYESIANO SERA UTILIZADO PARA ESTABLECER CRITERIOS A PRIORI ACERCA DE LA PROBABILIDAD DE RESOLVER UNA ESTRUCTURA, LAS SUBESTRUCTURAS MINIMAS REQUERIDAS A TAL FIN Y LA SELECCION Y OPTIMIZACION LOS FRAGMENTOS QUE CONSTITUYEN LAS HIPOTESIS, CONTRA UNA FIGURA DE MERITO BASADA EN LA FUNCION DE ROTACION EXPERIMENTAL, LOS FRAGMENTOS SERAN EXTENDIDOS A TRAVES DEL MODELADO DE CADENAS LATERALES Y GRADOS DE LIBERTAD SERAN CONFERIDOS A TRAVES DEL REFINO DENTRO DEL NUEVO ALGORITMO SEQUENCE_SLIDER, EXPLOTANDO VALIDACION EN EL ESPACIO REAL Y EN EL ESPACIO RECIPROCO, HIPOTESIS MULTIPLES Y FUENTES COMPLEMENTARIAS DE INFORMACION O CONDICIONES DE CONTORNO PARA LAS FASES SERAN COMBINADAS EN EL ESPACIO RECIPROCO,NOS PROPONEMOS DESARROLLAR UNA NUEVA IMPLEMENTACION PARA SUPERCOMPUTADOR, ARCIMBOLDO_FIRE, TRANSFORMANDO EL PROTOTIPO INICIAL UTILIZADO COMO BANCO DE PRUEBAS DE TODOS LOS ALGORITMOS DESCRITOS HASTA HACER DE EL UN POTENTE METODO DE RESOLUCION DE NUEVAS ESTRUCTURAS COMPLEJAS QUE INCORPORE TODOS LOS AVANCE ALCANZADOS EN EL PROYECTO, ES INTERESANTE RESEÑAR QUE NUESTRO RECIENTE ARTICULO QUE DESCRIBE EL ALGORITMO DE ARCIMBOLDO_BORGES, PUBLICADO EN NATURE METHODS EN 2013 FUE DESTACADO POR EL GRUPO EDITORIAL NATURE EN 2014, AÑO INTERNACIONAL DE LA CRISTALOGRAFIA COMO UNO DE 50 HITOS ENTRE TODAS LAS PUBLICACIONES DE ESTE GRUPO EDITORIAL EN CRISTALOGRAFIA MACROMOLECULAR DE TODOS LOS TIEMPOS, (HTTP://WWW,NATURE,COM/MILESTONES/MILECRYSTAL/LIBRARY/STRUCTURAL-BIOLOGY/INDEX,HTML), BIOLOGÍA ESTRUCTURAL\CRISTALOGRAFÍA MACROMOLECULAR\FASEADO\MÉTODOS COMPUTACIONALES\SUPERCOMPUTACIÓN\CATÁLISIS