Descripción del proyecto
LA PRESENTE PROPUESTA PERSIGUE DOS TIPOS DE OBJETIVOS CLARAMENTE DIFERENCIADOS Y A LA PAR COMPLEMENTARIOS, POR UNA PARTE, EL DESARROLLO DE METODOS CRISTALOGRAFICOS PARA LA RESOLUCION DE ESTRUCTURAS MACROMOLECULARES Y POR OTRA SU APLICACION A PROYECTOS DE INTERES BIOMEDICO O BIOTECNOLOGICO, TALES COMO LA ELUCIDACION DE LA BASE MOLECULAR DE ENFERMEDADES O EL DESARROLLO DE BIOCATALIZADORES PARA REACCIONES DE FORMACION DE ENLACES CARBONO-CARBONO ORIENTADAS A TRANSFORMACIONES ESTRATEGICAS DE INTERES INDUSTRIAL,LA INVESTIGACION EN NUEVOS METODOS CRISTALOGRAFICOS, EXTENDIENDO LA LINEA DE LOS CINCO PROYECTOS PREVIOS, CIFRARA PARTICULAR ENFASIS EN EL DESARROLLO DE NUESTROS METODOS BASADOS EN FRAGMENTOS PARA LA RESOLUCION DE ESTRUCTURAS MACROMOLECULARES, CONSTRUCCION DE MODELOS EN MAPAS, E INTERPRETACION DE ESTRUCTURA EXPLOTANDO CALCULO MASIVO, ADEMAS DE ABORDAR LA COMBINACION DE METODOS LOS EXTENDEREMOS AL CAMPO EMERGENTE DE LA DIFRACCION DE ELECTRONES Y MICROSCOPIA,NUESTROS ALGORITMOS SON UNICOS EN SU PARALELIZACION DE METODOS DE MULTISOLUCION DISTRIBUIDOS EN UN GRID DE COMPUTADORES O SUPERCOMPUTADOR, YA QUE EL MOTOR CONCEPTUAL ESTA SIEMPRE DIRIGIDO POR LOS DATOS EXPERIMENTALES, DONDE OTROS ENFOQUES CONFIAN EN PREDICCIONES BIOINFORMATICAS, ASI, NUESTRO SOFTWARE ARCIMBOLDO (HTTP://CHANGO,IBMB,CSIC,ES/ARCIMBOLDO), LANZADO EN 2009 Y DISTRIBUIDO A LABORATORIOS EN TODO EL MUNDO SERA DESARROLLADO Y COMPLEMENTADO CON UNA SERIE DE PROGRAMAS ANCILARES CON EL OBJETIVO DE CONVERTIR LA RESOLUCION DE ESTRUCTURAS AB INITIO EN UN METODO UNIVERSAL, NOS PROPONEMOS DESARROLLAR UNA SERIE DE VIAS PARA EXPANDIR SU ALCANCE, EXTENDIENDOLO A LA RESOLUCION DE ESTRUCTURAS MAS COMPLEJAS Y HASTA RESOLUCIONES DE 3 A, BAJO LA PRESENTE PROPUESTA, NUESTRO GRUPO COMPUESTO POR 9 INVESTIGADORES Y TECNICOS SE PROPONE INTEGRAR EN LA INTERFAZ GRAFICA DEL PROCESADO DE DATOS MAS EXTENDIDO, ACCESO A NUESTRO SOFTWARE PARTIENDO DEL EXPERIMENTO OPTIMO DE GENERACION DE DATOS DE DIFRACCION PARA EL CASO DE LA RESOLUCION AB INITIO,UN FORMALISMO ESTADISTICO BAYESIANO SERA UTILIZADO Y EXTENDIDO PARA GUIAR CON CRITERIOS A PRIORI ACERCA DE LA PROBABILIDAD DE RESOLVER UNA ESTRUCTURA, LAS HIPOTESIS MINIMAS REQUERIDAS A TAL FIN, HIPOTESIS MULTIPLES, MODIFICACION Y EXTENSION DE LOS FRAGMENTOS POR MODELADO Y REFINO, METODOS COMPLEMENTARIOS DE INFORMACION O CONDICIONES DE CONTORNO PARA LAS FASES SERAN COMBINADOS EN EL ESPACIO RECIPROCO,ADEMAS, EXTENDEREMOS NUESTRA VISION ESTRUCTURAL, BASADA EN EL USO DE FRAGMENTOS PARA FASEADO, CONSTRUCCION DE MODELOS Y ANALISIS DE ESTRUCTURA AL CAMPO EMERGENTE DE LA MICROSCOPIA ELECTRONICA DE ALTA RESOLUCION, PASANDO POR LA MICRO-DIFFRACCION DE ELECTRONES,NOS PROPONEMOS DESARROLLAR UNA NUEVA IMPLEMENTACION PARA ESTACIONES DE TRABAJO TIPICAS, ARCIMBOLDO_EXPRESS, TRANSFORMANDO EL PROTOTIPO DE SUPERCOMPUTACION UTILIZADO COMO BANCO DE PRUEBAS DE TODOS LOS ALGORITMOS DESCRITOS HASTA HACER DE EL UN POTENTE METODO DE RESOLUCION DE NUEVAS ESTRUCTURAS COMPLEJAS QUE INCORPORE TODOS LOS AVANCE ALCANZADOS EN EL PROYECTO,ES INTERESANTE RESEÑAR QUE NUESTRO ARTICULO QUE DESCRIBE EL ALGORITMO DE ARCIMBOLDO_BORGES, PUBLICADO EN NATURE METHODS EN 2013 FUE DESTACADO POR EL GRUPO EDITORIAL NATURE EN 2014, AÑO INTERNACIONAL DE LA CRISTALOGRAFIA COMO UNO DE 50 HITOS ENTRE TODAS LAS PUBLICACIONES DE ESTE GRUPO EDITORIAL EN CRISTALOGRAFIA MACROMOLECULAR DE TODOS LOS TIEMPOS, (HTTP://WWW,NATURE,COM/MILESTONES/MILECRYSTAL/LIBRARY/STRUCTURAL-BIOLOGY/INDEX,HTML) BIOLOGÍA ESTRUCTURAL\CRISTALOGRAFÍA MACROMOLECULAR\FASEADO\MÉTODOS COMPUTACIONALES\SUPERCOMPUTACIÓN\CATÁLISIS