Descripción del proyecto
EL PAPEL EN LA GENERACION DE LAS MUTACIONES DE LA INTERACCION ENTRE LOS AGENTES QUE DAÑAN EL ADN, LOS SISTEMAS DE REPARACION DEL ADN Y LOS PROCESOS CELULARES COMO LA TRANSCRIPCION Y LA REPLICACION HA COMENZADO A ACLARARSE EN AÑOS RECIENTES, HEMOS APRENDIDO, POR EJEMPLO, QUE ALGUNAS CARACTERISTICAS ESTRUCTURALES DE LA CROMATINA A GRAN Y PEQUEÑA ESCALA INFLUYEN EN EL PATRON DE LA DISTRIBUCION DE LAS MUTACIONES A LO LARGO DEL GENOMA, SIN EMBARGO, CON RESPECTO A LA MAYORIA DE LOS PROCESOS MUTACIONALES TODAVIA CARECEMOS DE UN PANORAMA COMPLETO DE LA INFLUENCIA DE LAS CARACTERISTICAS DE LA CROMATINA EN LA DISTRIBUCION DE DAÑOS ESPECIFICOS AL ADN Y SU REPARACION A LO LARGO DEL GENOMA, ESTO NOS IMPIDE DESARROLLAR MODELOS FINOS Y EXACTOS DE LAS PROBABILIDADES BASALES DE MUTACION DE DIFERENTES REGIONES DEL GENOMA, QUE SERVIRIAN PARA MEJORAR LOS METODOS DE IDENTIFICACION DE ELEMENTOS GENOMICOS BAJO SELECCION POSITIVA EN LA APARICION Y EVOLUCION DE LOS TUMORES,EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS CONSTRUIR UN MAPA A RESOLUCION DE NUCLEOTIDO A LO LARGO DE TODO EL GENOMA DE DOS TIPOS DE DAÑO AL ADN GENERADO POR TRES AGENTES MUTAGENICOS (LUZ UV, DIETILNITROSAMINA Y TEMOZOLOMIDA) EN TRES MODELOS EXPERIMENTALES RADICALMENTE DIFERENTES, PARA ESTO, DESARROLLAREMOS UN NUEVO PROTOCOLO EXPERIMENTAL, LLAMADO DNA-DAMAGE-MAP CON EL OBJETIVO DE MAPEAR DE MANERA GENERAL EL DAÑO CONSISTENTE EN LA ALQUILACION DE BASES NITROGENADAS EN EL ADN A LO LARGO DE TODO EL GENOMA, ESTANDARIZAREMOS ESTE PROTOCOLO EXPERIMENTAL PARA SU UTILIZACION EN DOS DE LOS MODELOS EXPERIMENTALES: HEPATOCITOS DE RATON IN VIVO Y LINEAS CELULARES DE ORIGEN HUMANO, UTILIZANDO LOS MAPAS DE DAÑO GENERADOS, ESTUDIAREMOS EL PAPEL DE LOS DIFERENTES SISTEMAS DE REPARACION DEL ADN EN LA CORRECCION DEL DAÑO CREADO POR ESTOS AGENTES, E INFERIREMOS LOS MAPAS DE INTENSIDAD DE REPARACION DEL ADN A LO LARGO DE TODO EL GENOMA PARA CADA UNO DE ELLOS, POR MEDIO DEL ANALISIS DE LA INFLUENCIA DE VARIAS CARACTERISTICAS DE LA CROMATINA MEDIDAS A LO LARGO DE TODO EL GENOMA EN LOS TRES MODELOS EN LA CREACION DEL DAÑO Y EN SU REPARACION, CONSTRUIREMOS MODELOS PREDICTIVOS DE LA PROBABILIDAD DE APARICION DE MUTACIONES EN DIFERENTES REGIONES DEL GENOMA, ENSAYAREMOS ESTOS MODELOS EN LA PREDICCION DE LOS PATRONES DE MUTACIONES OBSERVADOS EN DISTINTOS TIPOS DE CANCER HUMANOS, DADO QUE LA TEMOZOLOMIDA Y OTROS AGENTES ALQUILANTES SE UTILIZAN DE MANERA RUTINARIA EN LA QUIMIOTERAPIA, PREVEMOS QUE LOS RESULTADOS DEL PROYECTO ARROJARAN CLARIDAD SOBRE LOS MECANISMOS GENETICOS DE RESISTENCIA A ESTAS TERAPIAS EN LOS TUMORES Y ACERCA DE LOS EFECTOS EN LOS PACIENTES DEL TRATAMIENTO SISTEMICO DE QUIMIOTERAPIA, DAÑO DEL ADN\REPARACIÓN DEL ADN\PRECESOS DE MUTACIÓN\CARACTERÍSTICAS DE LA CROMATINA\QUIMIOTERAPIA