Descripción del proyecto
SE HA PROPUESTO QUE EN EL GENOMA HUMANO EXISTEN VARIOS CENTENARES DE MILES DE ELEMENTOS REGULADORES DISTALES, O COMO SE LES CONOCE EN INGLES ENHANCERS, DEBIDO A LA DIFICULTAD EN IDENTIFICAR ENHANCERS EN EL PASADO POCO SE CONOCE DE LOS MECANISMOS QUE REGULAN LA ACTIVACION O DESACTIVACION DE LOS MISMOS Y DE COMO PROVOCAN LA POTENCIACION DE LA TRANSCRIPCION DE GENES CONCRETOS, SITUADOS A VECES A CENTENARES DE KILOBASES DE DISTANCIA, LA CAPACIDAD DE IDENTIFICAR ESTOS ELEMENTOS A TRAVES DE LAS MARCAS EPIGENETICAS DE LAS HISTONAS PRESENTES EN EL ENHANCER Y EL DESCUBRIMIENTO DE RNAS NO CODIFICANTES SINTETIZADOS EN POR ENHANCERS (ERNAS) HA PROVOCADO UNA REVOLUCION EN LA INVESTIGACION SOBRE ENHANCER, ADEMAS, CADA VEZ SE IDENTIFICAN MAS ENFERMEDADES QUE TIENEN SUS BASES MOLECULARES EN EL MAL FUNCIONAMIENTO O LA MUTACION DE ENHANCERS, EN LOS ULTIMOS AÑOS MI GRUPO HA ESTUDIADO CUATRO PROTEINAS O COMPLEJOS MULTIPROTEICOS QUE BIEN NOSOTROS U OTROS INVESTIGADORES HAN ASOCIADO A ENHANCERS, LAS PROTEINAS CHD7 Y CHD8 Y EL COMPLEJO SWI/SNF SON REMODELADORES DE NUCLEOSOMAS, MIENTRAS QUE EL COMPLEJO LSD1/COREST ES UN COMPLEJO DEMETILADOR DE LA HISTONA H3 EN LA LISINA 4, MUTACIONES EN LOS GENES QUE CODIFICAN ESTAS PROTEINAS PRODUCEN ENFERMEDADES NEUROLOGICAS COMO EL SINDROME DE CHARGE Y EL AUTISMO O CANCER EN HUMANOS, SE DESCONOCE EL MECANISMO POR EL CUAL ESTOS FACTORES CONTROLAN LOS ENHANCERS, TAMPOCO SE CONOCE EN MUCHOS CASOS COMO LOS DISTINTOS FACTORES SON RECLUTADOS A LA CROMATINA Y COMO COOPERAN PARA REGULAR EL ENHANCER, DATOS DE NUESTRO LABORATORIO Y DE OTROS GRUPOS INDICAN QUE ESTOS FACTORES CROMATINICOS ESTAN IMPLICADOS EN LA DIFERENCIACION DE PROGENITORES NEURONALES Y EN LA TRANSICION DE EPITELIO A MESENQUIMA (EMT), DOS PROCESOS MUY IMPORTANTES DURANTE EL DESARROLLO, EL OBJETIVO GENERAL DEL PROYECTO ES ESTUDIAR LA DINAMICA DE ACTIVACION Y DESACTIVACION DE ENHANCERS DURANTE LA DIFERENCIACION NEURONAL Y DURANTE EL PROCESO DE EMT, ASI COMO INVESTIGAR EL PAPEL DE LAS PROTEINAS CHD7, CHD8 Y DE LOS COMPLEJOS SWI/SNF Y LSD1/COREST Y SU COOPERACION EN LA REGULACION DE ESTOS ENHANCERS, LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS PRINCIPALES SON:1,- ESTUDIO DE LA DINAMICA DE ACTIVACION DE ENHANCERS DURANTE LA TRANSICION DE EPITELIO A MESENQUIMA MEDIADA POR TFGß,2,- CARACTERIZACION DE LA FUNCION DE LAS PROTEINAS CHD7, CHD8 Y DE LOS COMPLEJOS SWI/SNF Y LSD1/COREST EN LA ACTIVACION Y LA REPRESION DE ENHANCERS DURANTE LA TRANSICION DE EPITELIO A MESENQUIMA MEDIADA POR TFGß, ESTUDIAREMOS TAMBIEN LA COOPERACION ENTRE ESTOS FACTORES Y LOS MECANISMOS POR LOS CUALES SE RECLUTAN A LOS ENHANCERS, ASIMISMO, MEDIANTE NUEVOS ABORDAJES PROTEOMICOS IDENTIFICAREMOS PROTEINAS ASOCIADAS A CHD7 Y CHD8, 3,- IDENTIFICACION DE NUEVOS FACTORES CROMATINICOS IMPLICADOS EN LA REGULACION DE ENHANCERS DURANTE LA TRANSICION DE EPITELIO A MESENQUIMA MEDIANTE UN ESCRUTINIO DE SIRNA,4,- ESTUDIO DE LA DINAMICA DE ACTIVACION DE ENHANCERS DURANTE LA DIFERENCIACION DE PROGENITORES NEURONALES,5,- PAPEL DE LAS PROTEINAS CHD7 Y CHD8 EN DIFERENCIACION NEURONAL, ESTUDIAREMOS LA RELACION DE ESTOS FACTORES CON LA RUTA WNT/ß-CATENINA EN CELULAS PROGENITORAS NEURONALES, EPIGENETICA\ENHANCER\CROMATINA\DIFERENCIACIÓN CELULAR\EMT