Descripción del proyecto
LAS PROTEINAS DE MEMBRANA SUPONEN EL 30% DE LAS PROTEINAS DE UN SER VIVO. ESTAS PROTEINAS SON NECESARIAS PARA UNA AMPLIA VARIEDAD DE PROCESOS CELULARES, INCLUYENDO LA PRODUCCION DE ENERGIA, EL TRANSPORTE DE MACROMOLECULAS Y METABOLITOS, Y LA SEÑALIZACION INTERCELULAR. ADEMAS, REPRESENTAN ALREDEDOR DEL 60% DE LAS DIANAS DE LOS MEDICAMENTOS ACTUALMENTE EN USO.LA MAYORIA DE LAS PROTEINAS DE MEMBRANA SON DIRIGIDAS E INSERTADAS EN LA MEMBRANA COTRADUCCIONALMENTE, EN UN PROCESO QUE UTILIZA LA RUTA DE LA SRP ('SIGNAL RECOGNITION PARTICLE') PARA PROTEGER SUS SEGMENTOS TRANSMEMBRANA (TM) HIDROFOBICOS DEL CITOSOL ACUOSO. UNA VEZ EN LA MEMBRANA, LAS INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA Y PROTEINA-LIPIDO, SON DE GRAN IMPORTANCIA PARA ADOPTAR LA ESTRUCTURA NATIVA Y POR ENDE SU FUNCION BIOLOGICA. ESTA FUNCION ESTA LIGADA AL CORRECTO EMPAQUETAMIENTO Y ENSAMBLAJE DE SUS SEGMENTOS TM EN LA BICAPA LIPIDICA. ESTE PROCESO SE HA CONCEPTUALIZADO EN UN MODELO EN "DOS ETAPAS" (35), E ILUSTRADO EN MUCHOS ESTUDIOS EXPERIMENTALES UTILIZANDO DIVERSAS PROTEINAS DE MEMBRANA O PEPTIDOS MODELO (51). SIN EMBARGO, PROBABLEMENTE QUEDAN POR DESCUBRIR COMPONENTES CELULARES QUE PARTICIPEN EN EL DIRECCIONAMIENTO O LA INSERCION, ASI COMO EL PAPEL QUE DESEMPEÑAN LAS INTERACCIONES TM EN COMPLEJOS DE ORDEN SUPERIOR, DEBIDO, PRINCIPALMENTE, A LA COMPLEJIDAD DE SU ARQUITECTURA Y EN SU MANIPULACION BIOQUIMICA. PARA ENTENDER ESTE PROCESO GLOBALMENTE, ES NECESARIO EL DISEÑO DE NUEVAS ESTRATEGIAS EXPERIMENTALES. RECIENTEMENTE, SE HA COMENZADO A CARACTERIZAR EL INTERACTOMA DE PROTEINAS DE MEMBRANA CONCRETAS, PERO NO SE HAN ABORDADO ESTOS ESTUDIOS DE FORMA SISTEMATICA. POR OTRO LADO, BIOFISICOS Y BIOLOGOS ESTRUCTURALES HAN EMPEZADO A DESCIFRAR LAS INTERACCIONES ENTRE DOMINIOS TM, PERO LOS ASPECTOS MAS DINAMICOS DE ESTAS INTERACCIONES, ES DECIR, SU MODULACION, CARACTER TRANSITORIO Y REVERSIBILIDAD, HAN SIDO MUCHO MENOS EXPLORADOS.EL PRESENTE PROYECTO SE BASA EN LA EXPERIENCIA PREVIA DE LOS MIEMBROS DE NUESTRO GRUPO DE INVESTIGACION, Y EN EL APLICAREMOS DE FORMA COORDINADA DIFERENTES METODOLOGIAS AL ESTUDIO DE MECANISMOS CLAVE EN LA BIOGENESIS Y PLEGAMIENTO DE LAS PROTEINAS DE MEMBRANA. NUESTRO OBJETIVO ES PROFUNDIZAR EN LAS ETAPAS MAS RELEVANTES DE ESTE PROCESO GLOBAL, IDENTIFICANDO NUEVOS COMPONENTES QUE ASISTAN AL DIRECCIONAMIENTO, LA ORIENTACION E INTEGRACION DE LOS SEGMENTOS TM, DESVELANDO LOS PRINCIPIOS MECANISTICOS DE LA INSERCION DE LOS SEGMENTOS TM EN EL TRANSLOCON, Y DESCUBRIENDO PATRONES DE SECUENCIAS QUE NOS PERMITAN COMPRENDER LAS INTERACCIONES HELICE-HELICE. POR OTRA PARTE, APLICAREMOS LOS CONOCIMIENTOS ADQUIRIDOS EN NUESTRO LABORATORIO EN LA ULTIMA DECADA A INVESTIGAR LA RELEVANCIA DE LA ASOCIACION A MEMBRANAS DE UN PROCESO BIOLOGICO FUNDAMENTAL, LA APOPTOSIS.EN CONJUNTO, LOS RESULTADOS ESPERADOS DE LA PRESENTE PROPUESTA NOS CONDUCIRAN HACIA UN MODELO MAS INTELIGIBLE Y CUANTITATIVO DE LA BIOGENESIS Y DEL PLEGAMIENTO DE PROTEINAS DE MEMBRANA, CONFORMANDO UN PROYECTO DE INVESTIGACION COHERENTE EN LA FRONTERA DEL CONOCIMIENTO Y DE CAPITAL IMPORTANCIA PARA LA CIENCIA BASICA Y BIOMEDICA. NUESTRO OBJETIVO ULTIMO ES ENTENDER EL FUNCIONAMIENTO DE LAS MEMBRANAS BIOLOGICAS, Y ADEMAS, PROPORCIONAR UN ENTORNO VALIOSO PARA LA FORMACION DE ESTUDIANTES PREDOCTORALES Y POSTDOCTORALES CON APROXIMACIONES GENUINAS DE NUESTRO LABORATORIO EN EL ENTORNO DE LA BIOLOGIA FUNDAMENTAL ESPAÑOLA. ROTEÍNAS DE MEMBRANA\PLEGAMIENTO\MEMBRANAS BIOLÓGICAS\SÍNTESIS DE PROTEÍNAS\CHAPERONAS\TRANSLOCÓN\PROTEÓMICA