Descripción del proyecto
DURANTE MUCHOS AÑOS, LOS CIENTIFICOS SE HAN ESFORZADO EN COMPRENDER Y CURAR EL CANCER, EL CUAL SE HA CONVERTIDO EN UN PROBLEMA DE SALUD EN MUCHAS PARTES DEL MUNDO DEBIDO AL ENVEJECIMIENTO DE LA POBLACION, EL ESTUDIO DEL GENOMA DE MULTIPLES TUMORES HA SIDO FUNDAMENTAL PARA IDENTIFICAR ALTERACIONES RECURRENTES EN VARIOS TIPOS DE CANCER, LO QUE HA FACILITADO SU CLASIFICACION Y EL DESARROLLO DE NUEVAS ESTRATEGIAS TERAPEUTICAS, ESTOS ESTUDIOS HAN PUESTO DE MANIFIESTO LA HETEROGENEIDAD DE LAS ALTERACIONES GENETICAS EN PACIENTES CON CANCER, MOTIVANDO Y HACIENDO POSIBLE EL DESARROLLO DE TRATAMIENTOS INDIVIDUALIZADOS, DICHAS ESTRATEGIAS SE BASAN MAYORMENTE EN MUTACIONES GENOMICAS Y ALTERACIONES EN LA EXPRESION DE LOS GENES, SIN EMBARGO, ESTAS ALTERACIONES ACCIONABLES FRECUENTEMENTE ESTAN AUSENTES EN LAS MUESTRAS DE PACIENTES, LO QUE CONSTITUYE UN IMPORTANTE PROBLEMA MEDICO, YA QUE LAS TERAPIAS ESTANDAR SON INEFICACES EN ESTOS CASOS, ASI PUES, ES CRUCIAL AMPLIAR EL CATALOGO DE ALTERACIONES QUE PROPORCIONEN INFORMACION DE PRONOSTICO O QUE PUEDAN GUIAR DECISIONES TERAPEUTICAS, ALTERACIONES EN EL PROCESAMIENTO DEL RNA ESTAN APARECIENDO COMO NUEVOS IMPORTANTES MARCADORES PARA COMPRENDER LA FORMACION DE TUMORES Y DESARROLLAR NUEVAS TERAPIAS, ADEMAS, LOS RECIENTES AVANCES EN LAS TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION HACEN POSIBLE OBTENER DE FORMA RUTINARIA INFORMACION SOBRE EL CONTENIDO DE RNA EN MUESTRAS TUMORALES FRESCAS O ALMACENADAS, ESTO REPRESENTA LA OPORTUNIDAD DE HACER ESTUDIOS SISTEMATICOS DE LAS ALTERACIONES DEL PROCESAMIENTO DEL RNA CON EL FIN DE DESCUBRIR NUEVAS DIANAS MOLECULARES DE CANCER, SIN EMBARGO, TAMBIEN PLANTEA IMPORTANTES RETOS SOBRE COMO PROCESAR, INTEGRAR E INTERPRETAR LOS DATOS DE MANERA EFICIENTE CON EL FIN DE OBTENER INFORMACION CLINICA RELEVANTE, EN ESTE PROYECTO, PROPONEMOS HACER FRENTE A ESTOS DESAFIOS MEDIANTE EL DESARROLLO DE UNA PLATAFORMA COMPUTACIONAL PARA EL ANALISIS Y LA INTERPRETACION CLINICA DE LAS ALTERACIONES EN EL PROCESAMIENTO DEL RNA A PARTIR DE UNA MUESTRA INDIVIDUAL DE TUMOR, EL DESARROLLO DE ESTA TECNOLOGIA IMPLICA EL ANALISIS Y LA INTEGRACION DE UNA GRAN CANTIDAD DE DATOS DE RNA-SEQ DE MUESTRAS DE TUMORES Y DE CONTROLES NORMALES, ASI COMO DE SU CARACTERIZACION FUNCIONAL Y CLINICA, Y LA IDENTIFICACION DE NUEVAS DIANAS TERAPEUTICAS, NUESTRO PROYECTO PROPORCIONARA UN METODO RAPIDO Y EFICAZ PARA INFORMAR SOBRE DIANAS PRONOSTICAS Y TERAPEUTICAS A PARTIR DE UNA MUESTRA INDIVIDUAL DE RNA-SEQ; Y ADEMAS AYUDARA A ALIVIAR EL CUELLO DE BOTELLA EXISTENTE EN EL PROCESAMIENTO E INTERPRETACION DE DATOS DE RNA-SEQ POR CIENTIFICOS NO EXPERTOS, CON ESTO SE PRETENDE FACILITAR LA INTERPRETACION CLINICA DEL CONTENIDO DE RNA EN LOS TUMORES, ASI COMO COMPLEMENTAR Y MEJORAR LAS ESTRATEGIAS ACTUALES DE LA MEDICINA PERSONALIZADA DEL CANCER, NUESTRO PROYECTO ES UN PRIMER PASO CRITICO HACIA LA APLICACION SISTEMATICA DEL ANALISIS COMPLETO DE SECUENCIACION DE RNA A ESTRATEGIAS INDIVIDUALIZADAS DE GENOMICA DE CANCER, RNA\CÁNCER\PROCESAMIENTO DEL RNA\MEDICINA PERSONALIZADA\GENÓMICA\TRANSCRIPTÓMICA\BIOINFORMÁTICA