Descripción del proyecto
LA MEDICINA PERSONALIZADA DEL CANCER CONSISTE EN DETERMINAR LAS OPCIONES DE TRATAMIENTO MAS EFECTIVAS PARA CADA PACIENTES A PARTIR DE LAS BASES MOLECULARES DEL TUMOR, LA DISPONIBILIDAD DE DATOS DE MILES DE GENOMAS DE TUMORES ESTA PERMITIENDO AVANCES EN EL CONOCIMIENTO DE LA BIOLOGIA DEL CANCER, ALGUNOS CON IMPLICACION CLINICA DIRECTA, SIN EMBARGO, TODOS ESTOS AVANCES REPRESENTAN UN DESAFIO PARA LOS INVESTIGADORES DEL CANCER Y ONCOLOGOS, NOS ENCONTRAMOS ANTE UN TSUNAMI DE INFORMACION QUE, AUNQUE DE GRAN VALOR PARA LOS PACIENTES, ES MUY DIFICIL DE INTERPRETAR PARA TOMAR DECISIONES CORRECTAS, POR LO TANTO, EN LA ACTUALIDAD EXISTE UNA CLARA NECESIDAD - QUE AUMENTARA DE FORMA EXPONENCIAL EN LOS PROXIMOS AÑOS- DE ENFOQUES COMPUTACIONALES QUE INTEGREN Y PROCESEN ESTA GRAN CANTIDAD DE INFORMACION, DE MANERA QUE SEAN UTILES PARA INVESTIGADORES DEL CANCER Y ONCOLOGOS CLINICOS, POR OTRA PARTE, AVANCES EN NUESTRA CAPACIDAD DE ASIGNAR CON PRECISION LA TERAPIA DIRIGIDA MAS EFICAZ PARA CADA PACIENTE EN FUNCION DE LAS ALTERACIONES GENOMICAS DEL TUMOR SE NECESITAN CON URGENCIA, EN ESTE PROYECTO SE PROPONE EL DESARROLLO DE TECNOLOGIA COMPUTACIONAL NECESARIA PARA APLICAR LA MEDICINA PERSONALIZADA DEL CANCER EN ENTORNOS CLINICOS Y DE INVESTIGACION, POR UN LADO PROPONEMOS MEJORAR EL CONJUNTO DE ALGORITMOS ONCODRIVE, DESARROLLADOS EN NUESTRO LABORATORIO PARA LA IDENTIFICACION DE GENES CAUSANTES DE CANCER, EXTENDEREMOS ONCODRIVE PARA LA IDENTIFICACION DE LAS REGIONES NO CODIFICANTES CON MUTACIONES IMPLICADAS EN EL DESARROLLO TUMORAL (POR EJEMPLO, PROMOTORES, REGIONES NO TRADUCIDAS-UTRS, ARNS LARGOS NO CODIFICANTES, MICRORNAS), APLICAREMOS ESTOS METODOS A DATOS DISPONIBLES DE MILES DE GENOMAS DE TUMORES PARA GENERAR UNA BASE DE DATOS DE REGIONES GENOMICAS IMPLICADAS EN EL DESARROLLO DE DISTINTOS TIPOS DE TUMORES, TAMBIEN EXPLORAREMOS MILES DE GENOMAS DE LA LINEA GERMINAL PARA IDENTIFICAR REGIONES GENOMICAS ESPECIALMENTE SENSIBLES A MUTACIONES, LO QUE PODRIA AYUDAR A IDENTIFICAR MUTACIONES CAUSANTES DE ENFERMEDADES, Y EN PARTICULAR IMPLICADAS EN EL CANCER, TAMBIEN DESARROLLAREMOS UN NUEVO ALGORITMO, ONCODRIVEMUT, PARA CLASIFICAR CADA MUTACION EN UN TUMOR INDIVIDUAL COMO DRIVER O PASSENGER, Y MEJORAREMOS NUESTRO METODO IN SILICO DRUG PRESCRIPTION, QUE PROPONE OPCIONES DE TRATAMIENTO DIRIGIDO A CADA PACIENTE EN FUNCION DE LAS ALTERACIONES GENOMICAS DEL TUMOR, POR ULTIMO, TODAS LAS METODOLOGIAS Y BASES DE DATOS DESARROLLADAS SE INTEGRARAN EN LA HERRAMIENTA LLAMADA CANCER GENOME INTERPRETER, QUE A PARTIR DEL CONJUNTO DE ALTERACIONES GENOMICAS EN UN TUMOR, IDENTIFICA LAS ALTERACIONES DRIVER Y LAS OPORTUNIDADES TERAPEUTICAS PARA EL PACIENTE,EL PROYECTO TIENE EL POTENCIAL DE PRODUCIR NUEVOS AVANCES EN LA BIOLOGIA DEL CANCER, TALES COMO LA IDENTIFICACION DE NUEVOS GENES DEL CANCER O DE ELEMENTOS NO CODIFICANTES IMPLICADOS EN TUMORIGENESIS, ADEMAS EL PROYECTO GENERARA HERRAMIENTAS UTILES DIRECTAMENTE APLICABLES EN ENTORNOS CLINICOS Y DE INVESTIGACION, GENOMAS DE TUMORES\GENÓMICA COMPUTACIONAL\MEDICINA DE PRECISIÓN DEL CÁNCER\MUTACIONES CAUSANTES DEL CÁNCER\OPORTUNIDADES TERAPÉUTICAS