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AGL2010-22358-C02-01

Financiado

CARACTERIZACION FUNCIONAL DE MICRORNAS EN PRODUCCION Y SANIDAD PORCINA

LOS MICRORNAS (MIRNAS) SON UNA CLASE DE RNAS PEQUEÑOS DE CADENA SENCILLA (~18¿25 NUCLEOTIDE LONG) NO CODIFICANTES Y REGULADORES QUE ACTUAN SILENCIANDO LA EXPRESION GENICA A NIVEL POST-TRANSCRIPCIONAL, LOS MIRNAS REGULAN UN AMPLIO... ver más

01/01/2010

UAB

145K€

Presupuesto del proyecto: 145K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1266

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2010-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT AUTÒNOMA DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 1266

Presupuesto del proyecto 145K€

Descripción del proyecto LOS MICRORNAS (MIRNAS) SON UNA CLASE DE RNAS PEQUEÑOS DE CADENA SENCILLA (~18¿25 NUCLEOTIDE LONG) NO CODIFICANTES Y REGULADORES QUE ACTUAN SILENCIANDO LA EXPRESION GENICA A NIVEL POST-TRANSCRIPCIONAL, LOS MIRNAS REGULAN UN AMPLIO ESPECTRO DE PROCESOS BIOLOGICOS A TRAVES DEL RECONOCIMIENTO DE SECUENCIAS COMPLEMENTARIAS EN LOS GENES DIANA, ESTOS RNAS NO CODIFICANTES PUEDEN CONTRIBUIR TAMBIEN AL REPERTORIO DE INTERACCIONES HUESPED-PATOGENO DURANTE LA INFECCION VIRICA, ESTUDIOS RECIENTES DE PERFILES DE EXPRESION EN MIRNAS VIRALES Y EN ESPECIES DOMESTICAS HAN REVELADO QUE MUCHOS MIRNAS SON ESPECIE- Y TEJIDO-ESPECIFICOS, LO QUE INDICARIA QUE LOS MIRNAS JUEGAN UN PAPEL IMPORTANTE EN PROCESOS BIOLOGICOS ESENCIALES, LOS OBJETIVOS DE ESTE PROYECTO COORDINADO, CONTINUACION DEL PROYECTO AGL2007-66371-C02, SON LA CARACTERIZACION MOLECULAR DE NUEVOS MIRNA CODIFICADOS POR EL GENOMA PORCINO Y POR ALGUNOS DE SUS PATOGENOS VIRALES PREVIAMENTE IDENTIFICADOS POR NUESTROS GRUPOS EN DICHO PROYECTO, EN MAMIFEROS LA MAYORIA DE MIRNAS ESTAN CONSERVADOS EN ESPECIES RELACIONADAS, Y MUCHOS TIENEN HOMOLOGOS EN ESPECIES MAS DISTANTES, MAS DE 720 MIRNAS HAN SIDO DESCRITOS EN HUMANOS, DONDE EL NUMERO ESTIMADO DE MIRNAS PUEDE SER DE 1000, TAMBIEN SE HAN DESCRITO MAS DE 180 MIRNAS CODIFICADOS POR VIRUS, LA MAYORIA DE ELLOS EN LA FAMILIA HERPESVIRIDAE, SIN EMBARGO, LOS MIRNAS CARACTERIZADOS EN ANIMALES DOMESTICOS O LOS VIRUS QUE LOS INFECTAN SON AUN ESCASOS: 77 MIRNAS DESCRITOS EN LA BASE DE DATOS MIRBASE Y NINGUNO VIRICO, SIN EMBARGO, EN LA ULTIMA VERSION DE LA BASE DE DATOS DEL GENOMA PORCINO DE ENSEMBL (SSCROFA9) HAY UNA PREDICCION POR ALINEAMIENTO DE SECUENCIAS DE 400 MIRNAS PORCINOS,EN RESULTADOS PREVIOS DEL PROYECTO AGL2007-66371-C02 NUESTROS GRUPOS HAN CLONADO E IDENTIFICADO VARIOS CENTENARES DE MIRNAS PORCINOS Y VIRICOS QUE PODRIAN ESTAR RELACIONADOS EN INTERACCIONES HUESPED-PATOGENO Y EN RENDIMIENTO REPRODUCTIVO EN EL CERDO, ADEMAS HEMOS OBTENIDO EVIDENCIAS PRELIMINARES DE LA EXISTENCIA DE POLIMORFISMO GENETICO ENTRE DIFERENTES RAZAS PARA ESTOS MIRNAS, EL OBJETIVO ULTIMO DE ESTE PROYECTO COORDINADO ES LA CARACTERIZACION FUNCIONAL Y EL ESTUDIO DE POLIMORFISMOS EN LOS MIRNAS PORCINOS Y VIRICOS RELACIONADOS CON EL ESTADO DE SALUD Y EL RENDIMIENTO REPRODUCTIVO EN EL CERDO,LAS APROXIMACIONES PARA CONSEGUIR ESTOS OBJETIVOS COMBINARAN: 1) INVENTARIO DE LA PRESENCIA DE MIRNAS IN VIVO POR SECUENCIACION MASIVADE LIBRERIAS DE RNAS PEQUEÑOS Y VALIDACION DE LOS MIRNAS SELECCIONADOS POR PCR CUANTITATIVA Y MICROARRAYS COMERCIALES 2) ANALISIS IN SILICO DE SECUENCIAS VIRICAS, DE PORCINO Y DE MAMIFERO PARA PREDICCION DE SECUENCIAS DIANA DE MIRNAS SELECCIONADOS E INTEGRACION DE LAS PREDICCIONES DE DIANAS CON DATOS DE EXPRESION GENICA OBTENIDOS CON MICROARRAYS 3) ANALISIS FUNCIONAL DE MIRNAS SELECCIONADOS EN TEJIDOS PORCINOS Y EN ANIMALES INFECTADOS EXPERIMENTALMENTE UTILIZANDO OLIGONUCLEOTIDOS ANTI-MIRNA Y POR EXPRESION DE MIRNAS ARTIFICIALES 4) BUSQUEDA DE POLIMORFISMO GENETICO EN MIRNAS Y GENES DIANA EN DIFERENTES RAZAS PORCINAS POR SECUENCIACION Y UTILIZACION DE ARRAYS DE GENOTIPADO DE SNPS PORCINOS PARA LA DETECCION DE VARIACION EN NUMERO DE COPIAS (CNVS),LA INTEGRACION DE LA INFORMACION OBTENIDA POR ESTE PROYECTO PERMITIRA UNA MEJOR COMPRENSION DEL MICRORNAOMA PORCINO, SU POLIMORFISMO Y LA INFLUENCIA EN LA INTERACCION ENTRE EL VIRUS Y EL HUESPED, MIRNA\PORCINO\EXPRESION GENICA\GENOMICA ANIMAL\INTERACCION HUESPED-PATOGENO\POLIMORFISMO

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