BUSQUEDA DE POSIBLES MARCADORES GENETICOS DE ATRIBUCION DE FUENTE EN CAMPYLOBACT...
BUSQUEDA DE POSIBLES MARCADORES GENETICOS DE ATRIBUCION DE FUENTE EN CAMPYLOBACTER JEJUNI UTILIZANDO ARRAYS DE ADN
LA FINALIDAD DEL TRABAJO ES DETERMINAR EL GRADO DE VARIABILIDAD (PLASTICIDAD Y/O DIVERSIDAD) GENOMICA ENTRE CEPAS DE CAMPYLOBACTER JEJUNI PROCEDENTES DE DIVERSAS AREAS GEOGRAFICAS (NORUEGA, ISLANDIA Y ESPAÑA) Y DIFERENTES FUENTES...
LA FINALIDAD DEL TRABAJO ES DETERMINAR EL GRADO DE VARIABILIDAD (PLASTICIDAD Y/O DIVERSIDAD) GENOMICA ENTRE CEPAS DE CAMPYLOBACTER JEJUNI PROCEDENTES DE DIVERSAS AREAS GEOGRAFICAS (NORUEGA, ISLANDIA Y ESPAÑA) Y DIFERENTES FUENTES DE AISLAMIENTO (CLINICAS, AMBIENTALES, ALIMENTOS, AVES Y OTROS ANIMALES), CON EL OBJETIVO DE DETECTAR POSIBLES GENES QUE PUEDA EMPLEARSE COMO MARCADORES GENETICOS ATRIBUIBLES A UNA FUENTE DE INFECCION CONCRETA,UNA VEZ IDENTIFICADOS, ESTOS POTENCIALES MARCADORES CONSTITUIRIAN LA DIANA DE PCRS ESPECIFICAS QUE PERMITIRIAN SU DETECCION DE UNA FORMA RAPIDA, SENCILLA Y ACCESIBLE A LA GRAN MAYORIA DE LOS LABORATORIOS POR LO QUE FACILITARIAN NOTABLEMENTE LA ASIGNACION DE FUENTE DE INFECCION EN EL ANALISIS DE RIESGOS Y SEGURIDAD ALIMENTARIA,PARA ELLO NUESTROS OBJETIVOS SE RESUMEN EN:1, CONFECCIONAR UNA COLECCION MULTIGEOGRAFICA (DIVERSOS PAISES Y/O REGIONES EUROPEAS) DE CEPAS DE C, JEJUNI QUE INCLUYA AISLAMIENTOS NO CLONALES, SEGUN ALELOS DE LA REGION SVR (SHORT VARIABLE REGION) DEL GEN FLAA DETERMINADOS POR SECUENCIACION, PROCEDENTES DE HUMANOS, ANIMALES, ALIMENTOS Y AGUAS,2, DETERMINAR LAS CONDICIONES EXPERIMENTALES MAS ADECUADAS PARA LA HIBRIDACION EN EL MICROARRAY DE ADN, ASEGURANDO LA REPRODUCIBILIDAD ENTRE ENSAYOS, MINIMIZANDO LA PRESENCIA DE HIBRIDACIONES CRUZADAS Y ASEGURANDO LA DISCRIMINACION ENTRE LAS SEÑALES DE FLUORESCENCIA PARA LOS GENES PRESENTES Y LOS AUSENTES O DIVERGENTES,3, ANALIZAR MEDIANTE LA TECNICA DE MICROARRAY DE ADN FRENTE A LA CEPA NCTC 11168 LA COLECCION DE CEPAS SELECCIONADAS,4, DETERMINAR EL GRADO DE VARIABILIDAD Y ESTRUCTURA GENETICA QUE PRESENTAN LAS CEPAS SELECCIONADAS MEDIANTE METODOS BAYESIANOS DE INFERENCIA FILOGENETICA, C. jejuni\ADN array\marcadores\fuente infecciónver más
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