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BIO2011-29233-C02-01

Financiado

BIOTECNOLOGIA DE SISTEMAS PARA LA MEJORA DE BIOPROCESOS RELACIONADOS CON EL META...

BIOTECNOLOGIA DE SISTEMAS PARA LA MEJORA DE BIOPROCESOS RELACIONADOS CON EL METABOLISMO CENTRAL DE E. COLI: INTEGRACION DE LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL Y POST-TRANSDUCCIONAL EL OBJETIVO GENERAL DEL PRESENTE PROYECTO ES EL DISEÑO Y OPTIMIZACION DE BIOPROCESOS RELACIONADOS CON EL METABOLIMO CENTRAL DE E. COLI. EL OBJETIVO ES LA INTEGRACION DE LOS NIVELES MULTIPLES DE REGULACION (TRANSCRIPCIONAL, POST-TR... ver más

01/01/2011

194K€

Presupuesto del proyecto: 194K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE MURCIA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 912

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Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2011-01-01

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Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE MURCIA

Total investigadores 912

Presupuesto del proyecto 194K€

Descripción del proyecto EL OBJETIVO GENERAL DEL PRESENTE PROYECTO ES EL DISEÑO Y OPTIMIZACION DE BIOPROCESOS RELACIONADOS CON EL METABOLIMO CENTRAL DE E. COLI. EL OBJETIVO ES LA INTEGRACION DE LOS NIVELES MULTIPLES DE REGULACION (TRANSCRIPCIONAL, POST-TRADUCCIONAL Y EJERCIDA POR MOLECULAS PEQUEÑAS) DEL METABOLISMO BACTERIANO DESDE UNA PERSPECTIVA DE BIOLOGIA DE SISTEMAS. ESTA APROXIMACION SE APLICARA PARA DETERMINAR EL PAPEL DE ESTOS MECANISMOS EN LA REGULACION DEL EMPLEO DE LA FUENTE DE CARBONO EN E. COLI. SE PRESTARA ESPECIAL ATENCION A LAS FUENTES DE CARBONO MAS RELEVANTES: GLUCOSA (QUE ES EL ESTANDARD PARA CRECIMIENTO BACTERIANO) Y GLICEROL (CUYA IMPORTANCIA ESTA CRECIENDO COMO CONSECUENCIA DEL DESCENSO EN SUS PRECIOS). ADEMAS, TAMBIEN SE CONSIDERARA ACETATO, QUE ES UN IMPORTANTE SUBPRODUCTO QUE SE PUEDE EMPLEAR COMO FUENTE DE CARBONO EN SITUACIONES DE LIMITACION DE NUTRIENTES. COMO BIOPROCESO MODELO SE ESTUDIARA LA PRODUCCION DE TERPENOIDES, QUE SON METABOLITOS DE BAJO PESO MOLECULAR DERIVADOS DEL METABOLISMO CENTRAL Y QUE TIENEN UN GRAN NUMERO DE APLICACIONES EN LA INDUSTRIA QUIMICA Y EN BIOMEDICINA. ESTE PROYECTO COORDINADO CONSISTE EN DOS SUBPROYECTOS. EL SUBPROYECTO I ABARCA LOS SIGUIENTES OBJETIVOS: I.1.) DESARROLLAR UN MARCO CUANTITATIVO PARA LA DESCRIPCION DE LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL DE LA EXPRESION GENICA; I.2.) ENTENDER EL CONTROL METABOLICO QUE EJERCE LA ACETILACION DE PROTEINAS Y SU RELACION CON LA REPRESION POR CATABOLITO; I.3.) DESARROLLAR ESTRATEGIAS DE OPTIMIZACION PARA MODIFICAR LA PRODUCCION DE ACETATO EN CEPAS DE E. COLI Y PRODUCIR TERPENOS; I.4.) DESARROLLAR UN SISTEMA DE REACTOR PARA LA PRODUCCION DE TERPENOS EN SISTEMAS MONO Y BI-FASICOS; Y I.5.) MODELAR EL CONTROL DEL METABOLISMO CENTRAL MEDIANTE LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL Y POST-TRADUCCIONAL (ACETILACION) Y SU APLICACION PARA ANALIZAR LA BIOSINTESIS DE TERPENOS EMPLEANDO DIFERENTES FUENTES DE CARBONO. EL SUBPROYECTO II CUBRE LOS SIGUIENTES OBJETIVOS: II.1.) DESARROLLAR Y APLICAR UN METODO DE DETERMINACION DE PARAMETROS EN SISTEMAS BIOQUIMICOS MEDIANTE METODOS DE OPTIMIZACION; II.2.) DESARROLLAR HERRAMIENTAS PARA EL CALCULO EFICIENTE DE VERTICES Y SUPERFICES QUE SON SOLUCIONES DE UN PROBLEMA DE OPTIMIZACION MULTIOBJETIVO; II.3.) DESARROLLAR UN PROGRAMA INTEGRADO PARA EL MODELADO, ANALISIS Y OPTIMIZACION DE SISTEMAS BIOQUIMICOS EN EL FORMALISMO POWER-LAW; II.4.) MODELAR LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL DE LA EXPRESION GENICA IMPLICADA EN LA BIOSINTESIS DE TERPENOS; II.5.) MODELAR LA REGULACION COVALENTE DEL METABOLISMO DE BIOSINTESIS DE TERPENOS; II.6.) OPTIMIZAR LA ESTRUCTURA DE LA REGULACION DEL SISTEMA DE PRODUCCION DE TERPENOS; Y II.7.) MODELAR Y OPTIMIZAR LA OPERACION DEL BIOPROCESO CON CEPAS MODIFICADAS EN SISTEMAS BIFASICOS. FINALMENTE, EL OBJETIVO COMUN A AMBOS GRUPOS, OBJETIVO III: ESTABLECER UNA METODOLOGIA DE INVESTIGACION BASADA EN MODELOS Y APLICABLE A BIOPROCESOS PARA LA OBTENCION DE PRODUCTOS POR BIOTRANSFORMACIONES Y BIOSINTESIS DE NOVO. ESTA NUEVA APROXIMACION DEBE GARANTIZAR LA CORRECTA EXPRESION Y REGULACION GENICA, INCLUIR EL METABOLOMA Y EL PROTEOMA Y REPRESENTAR EL FLUJOMA ASOCIADO, ESTABLECIENDO UNA ESTRATEGIA Y UNA METODOLOGIA ADECUADA PARA LA OPTIMIZACION DE BIOPROCESOS. EL PROYECTO COORDINADO UNE LA EXPERIENCIA DEL DEPARTAMENTO DE BIOQUIMICA Y BIOLOGIA MOLECULAR B E INMUNOLOGIA DE LA FACULTAD DE QUIMICA DE LA UNIVERSIDAD DE MURCIA (UMU) Y EL GRUPO DE TECNOLOGIA BIOQUIMICA (GBT) DEL DEPARTAMENTO DE BIOQUIMICA Y BIOLOGIA MOLECULAR DE LA FACULTAD DE . COLI\BIOLOGIA DE SISTEMAS\INTEGRACION\METABOLISMO\BIOPROCESO\TERPENOIDES\OPTIMIZACION\POST-TRANSDUCCIONAL\TRANSCIPCIONAL\REGULACION

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