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BIO2008-04500-C02-01

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REDIRECCION DE FLUJOS METABOLICOS DEL METABOLISMO CENTRAL DE E. COLI PARA LA PRO...

REDIRECCION DE FLUJOS METABOLICOS DEL METABOLISMO CENTRAL DE E. COLI PARA LA PRODUCCION DE SUCCINATO Y L-CARNITINA EL OBJETIVO GENERAL DEL PRESENTE PROYECTO ES EL DISEÑO Y OPTIMIZACION DE BIOPROCESOS RELACIONADOS CON EL METABOLISMO CENTRAL EN CELULAS ENTERAS DE E, COLI, ESTE OBJETIVO GENERAL SE CONCRETA EN UNO ESPECIFICO, A SABER: LA IDENTIFIC... ver más

01/01/2008

175K€

Presupuesto del proyecto: 175K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE MURCIA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 910

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2008-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Este proyecto no cuenta con búsquedas de partenariado abiertas en este momento.

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE MURCIA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 910

Presupuesto del proyecto 175K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto EL OBJETIVO GENERAL DEL PRESENTE PROYECTO ES EL DISEÑO Y OPTIMIZACION DE BIOPROCESOS RELACIONADOS CON EL METABOLISMO CENTRAL EN CELULAS ENTERAS DE E, COLI, ESTE OBJETIVO GENERAL SE CONCRETA EN UNO ESPECIFICO, A SABER: LA IDENTIFICACION Y REDIRECCION DE LOS FLUJOS DE PRODUCCION DE SUCCINATO A PARTIR DE FUENTE CARBONADA (METABOLISMO CENTRAL) Y DE L-CARNITINA (METABOLISMO SECUNDARIO) A PARTIR DE COMPUESTOS DE TRIMETILAMONIO EN CEPAS DE E, COLI (SILVESTRES Y TRANSFORMADAS) COMO PROCESOS MODELO, LA APROXIMACION METODOLOGICA SE BASA EN LA BIOLOGIA DE SISTEMAS, ASI, LAS ACTIVIDADES EXPERIMENTALES Y DE ANALISIS TEORICO DEL PROCESO GIRAN EN TORNO A LA ELABORACION DE UN MODELO INTEGRADO DEL CONJUNTO DE PROCESOS OBJETO DE ESTUDIO, PARA ELLO SE DESARROLLARAN UNA SERIE DE ACTIVIDADES EN UN PROCESO CICLICO QUE COMPRENDE LAS FASES DE OBTENCION DE DATOS EXPERIMENTALES; DE INTEGRACION DE ESTOS EN EL MODELO; DE ANALISIS DE LA CALDIDAD DEL MISMOS; DE OPTIMIZACION DEL MODELO Y VERIFICACION DE LAS PREDICIONES DEL MISMO Y DE OPTIMIZACION, SE ESTUDIARAN EXPERIMENTALMENTE LOS FLUJOS DE INTERMEDIARIOS CLAVE Y SUS NIVELES BASALES ASI COMO LOS NIVELES ENZIMATICOS ASOCIADOS AL METABOLISMO CENTRAL EN E,COLI O44 K74 Y E, COLI K12, SE PRESTARA ESPECIAL ATENCION A LA REALIZACION DE EXPERIMENTOS DE PERTURBACION (METABOLICAS Y GENETICAS) DE LOS QUE SE PUEDAN OBTENER SERIES TEMPORALES DE DATOS QUE PERMITIRAN DETERMINAR TANTO LA ESTRUCTURA REGULADORA DEL SISTEMA METABOLICO COMO EL VALOR DE SUS CONSTANTES Y PARAMETROS, LOS FLUJOS Y NIVELES ENZIMATICOS DEL METABOLISMO CENTRAL, SE RELACIONARAN CON LOS FLUJOS Y NIVELES ENZIMATICOS DEL METABOLISMO SECUNDARIO PRODUCTOR DE L-CARNITINA A PARTIR DE COMPUESTOS DE TRIMETILAMONIO EN REACTORES DE ALTA DENSIDAD, POR OTRA PARTE, SE DETERMINARA EL TRANSCRIPTOMA (MICROARRAYS Y QRT-PCR) EN LAS DISTINTAS POBLACIONES CELULARES PRESENTES EN LOS REACTORES, LAS INFORMACIONES ASI OBTENIDAS RELATIVAS A ACTIVIDADES ENZIMATICAS; EXPRESION GENICA Y FLUJOS A TRAVES DE LOS METABOLISMOS CENTRAL Y SECUNDARIO SE INTEGRARAN EN UN MODELO GENERAL CON EL OBJETIVO DE IDENTIFICAR LOS PUNTOS DE CONTROL DE LA EXPRESION DEL METABOLISMO CELULAR DURANTE EL BIOPROCESO, ESTOS MODELOS SE ELABORARAN PREFERENTEMENTE EN LOS FORMALISMOS S-SYSTEM Y GMA Y SE COMPARARAN CON EL FORMALISMO DE ANALISIS DE FLUJOS METABOLICOS, LOS NUEVOS MODELOS ASI OBTENIDOS, UNA VEZ VALIDADOS EXPERIMENTALMENTE, PERMITIRAN DEFINIR, MEDIANTE LA APLICACION A LOS MISMOS DE UNA SERIE DE HERRAMIENTAS DE OPTIMICACION RACIONAL, LA SERIE DE CAMBIOS A REALIZAR EN LA ARQUITECTURA METABOLICA O EN LAS CONDICIONES DEL MEDIO QUE CONDUZCA A LA MEJORA DE LAS PRODUCTIVIDADES,LOS RESULTADOS INDICARAN LA SOBREEXPRESION DE CIERTOS GENES Y/O LA DELECION DE OTROS, ESTUDIOS PREVIOS REALIZADOS EN LOS ULTIMOS AÑOS EN EL MARCO DE ANTERIORES PROYECTOS SUGIEREN COMO CANDIDATOS PARA LA SOBREEXPRESION A LOS GENES CAIT, CAIB Y CAIC DEL OPERON CAITABCDE RESPONSABLES, RESPECTIVAMENTE, DE LA SINTESIS DE PROTEINAS DE TRANSPORTE DE COMPUESTOS DE TRIMETILAMONIO, DE SU ACTIVACION Y DE SU UNION A HS-COA PARA LA SINTESIS DE L-CARNITINA, ASI COMO DEL METABOLISMO CENTRAL TALES COMO ACEA, ACEK, ACS Y PTA ASOCIADOS A LA EXPRESION DE LA ISOCITRATO LIASA, ISOCITRATO DESHIDROGENASA, ACETIL-COA SINTETASA Y FOSFOTRANSACETILASA, RESPECTIVAMENTE, TAMBIEN SE CONTEMPLA EL ESTUDIO DEL EFECTO DE DELECIONES DE LOS GENES ANTES MENCIONADOS, ASI COMO DE GENES ASOCIADOS A FACTORES DE TRANSCRIPCION (CAIF, FNR, FRUR, ARCA, ETC) SOBRE LOS FLUJOS, Biorreactores\E. coli\transformación\estabilidad\succinato\L-carnitina\Ingeniería Metabólica\Biología de Sistemas\Análisis de Flufos Metabólicos\Transcriptoma\Metaboloma\Señaloma\Teoría de Sistemas Bioquímicos

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