Descripción del proyecto
EL OBJETIVO GENERAL DE ESTE PROYECTO ES IDENTIFICAR LAS ESTRATEGIAS Y EL DESARROLLO DE HERRAMIENTAS BIOTECNOLOGICAS PARA EL CONTROL DE LA TRANSCRIPCION Y DE LOS MECANISMOS POSTERIORES A LA TRADUCCION QUE OPERAN EN E, COLI, A ESTOS EFECTOS, VAMOS A UTILIZAR LOS METODOS DE LA BIOLOGIA DE SISTEMAS Y SINTETICA, PRINCIPALMENTE A TRAVES DE LA CONSTRUCCION DE MODELOS MATEMATICOS GENERALES DE LOS PRINCIPALES PROCESOS QUE INTERVIENEN, NUESTRO OBJETIVO FINAL ES MEJORAR LAS CAPACIDADES DE CEPAS DE E, COLI PARA SER USADAS COMO PLATAFORMAS OPTIMIZADAS PARA SUSTENTAR BIO-FABRICAS DE TRABAJO,ESPECIFICAMENTE, NUESTRA PROPUESTA ESTA ORIENTADA A LOGRAR UNA MEJOR CARACTERIZACION Y LA COMPRENSION DEL PAPEL DE LOS MECANISMOS DE ACETILACION/DESACETILACION DE N-EPSILON-LYS SOBRE LA DINAMICA GLOBAL DEL PROTEOMA DE E, COLI, ADEMAS, VAMOS A ANALIZAR CONJUNTAMENTE EL FOSFO-PROTEOMA Y SUCCINIL-PROTEOMA,NUESTRA ATENCION SE CENTRA EN DOS FACTORES PRINCIPALES QUE AFECTAN EL RENDIMIENTO DE E, COLI EN PROCESOS INDUSTRIALES: I, LAS RESPUESTAS MICROBIANAS A LA DISPONIBILIDAD DE FUENTES ALTERNATIVAS DE CARBONO (ES DECIR, GLUCOSA, GLICEROL, ACETATO Y FENILACETATO) Y, II, LAS RESPUESTAS MICROBIANAS A LAS TENSIONES AMBIENTALES DURANTE BIOPROCESOS DE PRODUCCION A GRAN ESCALA (ES DECIR, LA ESCASEZ DE NUTRIENTES, ESTRES ACIDO Y OSMOTICO), POR OTRA PARTE, ALGUNAS DE LAS VARIABLES A ANALIZAR (POR EJEMPLO, RCSB) TIENEN TAMBIEN IMPORTANCIA MEDICA YA QUE LA REGULACION FINA DE LOS FACTORES DE TRANSCRIPCION POR ACETILACION-DESACETILACION INFLUYE EN PROPIEDADES TALES COMO, INVASIVIDAD, FORMACION DE LA PELICULA Y COMPORTAMIENTO TOXIGENICO EN ENTEROBACTERIAS,POR LO TANTO, NUESTRO PROYECTO COORDINADO ESTA DENTRO DE LA INTERFAZ ENTRE, LOS PROBLEMAS BASICOS DE LA FISIOLOGIA MICROBIANA Y LA BIOTECNOLOGIA APLICADA, QUE REQUIERE UN ENFOQUE INTERDISCIPLINARIO, ESTE REQUISITO SE CUMPLE A TRAVES DE LA INTERACCION ENTRE LOS ENFOQUES EXPERIMENTALES DEL GRUPO 1 (UNIVERSIDAD DE MURCIA) Y EL ENFOQUE DE LA BIOLOGIA DE SISTEMAS CON MODELOS MATEMATICOS DEL GRUPO 2 (UNIVERSIDAD DE LA LAGUNA),COMO MODELO DE BIOPROCESOS, SE CONSIDERARAN, LA PRODUCCION DE L-CARNITINA Y EL USO DE ACIDO FENILACETICO COMO FUENTE DE CARBONO, TENEMOS LA INTENCION DE UTILIZAR, COMO CASO DE ESTUDIO, LA MEJOR FUENTE PARA LA VALIDACION DE MODELOS, DEMOSTRAR LA TRANSICION ENTRE LOS PROCESOS DE DE LA GLUCOLISIS Y DE LA GLUCONEOGENESIS, LA PRODUCCION DE CARNITINA COMO METABOLITO SECUNDARIO, Y LA DEGRADACION MICROBIANA DE FENIL ACETATO, SE UTILIZARAN LOS DATOS EXPERIMENTALES RECOGIDOS, NO SOLO PARA SUSTENTAR EL MODELO, SINO TAMBIEN PARA SU OPTIMIZACION Y VALIDACION, ACETILACIÓN-DESACETILACIÓN\REGULACIÓN DEL FACTOR DE TRANSCRIPCIÓN\MODELADO LÓGICO MULTI-VARIABLE\BIOLOGÍA DE SISTEMAS\E. COLI\PROTEOMA.