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BIO2008-04500-C02-02

Financiado

MODELIZACION Y OPTIMIZACION DEL METABOLISMO CENTRAL DE E. COLI. APLICACION AL RE...

MODELIZACION Y OPTIMIZACION DEL METABOLISMO CENTRAL DE E. COLI. APLICACION AL REDIRECCIONAMIENTO DE FLUJOS METABOLICOS PARA LA PRODUCCION DE SUCCINATO Y L-CARNITINA. LA EXPERIENCIA ACUMULADA POR LOS DOS GRUPOS PARTICIPANTES (ULL Y UMU) EN LOS ULTIMOS 9 AÑOS TANTO EN EL DESARROLLO DE METODOLOGIAS ESPECIFICAS COMO EN LA APLICACION DE LAS MISMAS AL METABOLISMO DE E, COLI NOS SITUA A AMBOS EN COND... ver más

01/01/2008

ULL

67K€

Presupuesto del proyecto: 67K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE LA LAGUNA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 678

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2008-01-01

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Participantes

ULL

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE LA LAGUNA

Total investigadores 678

Presupuesto del proyecto 67K€

Descripción del proyecto LA EXPERIENCIA ACUMULADA POR LOS DOS GRUPOS PARTICIPANTES (ULL Y UMU) EN LOS ULTIMOS 9 AÑOS TANTO EN EL DESARROLLO DE METODOLOGIAS ESPECIFICAS COMO EN LA APLICACION DE LAS MISMAS AL METABOLISMO DE E, COLI NOS SITUA A AMBOS EN CONDICIONES DE DAR UN SALTO CUALITATIVO EN LA ENVERGADURA DE LOS PROBLEMAS QUE PODEMOS ABORDAR Y PLANTEARNOS LA MODELIZACION COMPLETA DEL METABOLISMO CENTRAL DE E, COLI Y SU RELACION CON EL METABOLISMO SECUNDARIO DE LA L-CARNITINA, ESTE MODELO SE CONSTRUIRA EN LOS FORMALISMOS S-SYSTEM Y GMA, PERO NO EXCLUSIVAMENTE EN ESTOS, LOS DATOS Y EVIDENCIAS EXPERIMENTALES QUE SE INTEGRARAN EN EL MODELO SERAN EL RESULTADO DE EXPERIMENTOS AD HOC REALIZADOS POR EL GRUPO UMU, ESTOS CONSISTIRAN EN SERIES TEMPORALES DE EXPERIMENTOS DE PERTURBACION QUE PERMITIRAN LA ESTIMACION DE LOS PARAMETROS CLAVES DE LOS MODELOS, A PARTIR DE LA PRIMERA VERSION SUFICIENTEMENTE ROBUSTA DEL SISTEMA, LA APLICACION DEL MOI EN CUALQUIERA DE SUS VERSIONES DETERMINARA QUE PASOS, CATALIZADOS O NO ENZIMATICAMENTE, SERA PRECISO MODIFICAR, Y EN QUE EXTENSION, PARA CONSEGUIR DEL SISTEMA BIOQUIMICO QUE ESTE ALCAZE UN ESTADO ESTACIONARIO EN EL QUE LAS RESPUESTAS DEL MISMO QUE NOS INTERESAN SEAN OPTIMAS, ESTOS CAMBIOS PERMITIRAN LA REDIRECCION DE LOS LOS FLUJOS DEL ESTADO ESTACIONARIO AL TIEMPO QUE SE MANTIENE INALTERADA LA MAQUINARIA METABOLICA REQUERIDA PARA EL CRECIMIENTO Y OTRAS FUNCIONES CELULARES VITALES, LAS TAREAS A DESARROLLAR EN EL MARCO DE ESTE SUBPROYECTO SON LA ELABORACION DE LAS DISTINTAS VERSIONES DE LOS MODELOS MATEMATICOS QUE PERMITAN LA DESCRIPCION CUANTITATIVA DEL METABOLISMO CENTRAL COMO PRECURSOR/PRODUCTOR DE SUCCINATO, ATP Y NADH/NAD ASI COMO DE LOS PROCESOS IMPLICADOS EN LA PRODUCCION DE L-CARNITINA, TANTO A NIVEL CELULAR COMO DE BIOREACTOR, EN BASE A ESTOS MODELOS SE ACOMETERA EL DISEÑO DE ESTRATEGIAS DE MANIPULACION GENICA QUE SERAN SUBSEQUENTEMENTE IMPLEMENTADAS EN LOS SISTEMAS CELULARES, LAS CEPAS MODIFICADAS SE ENSAYARAN EN BIOREACTORES EN CONTINUO CON RECICLAJE CELULAR, QUE A SU VEZ SERAN MODELIZADOS Y OPTIMIZADOS, SIMULTANEAMENTE EN UNOS CASOS Y SECUENCIALMENTE EN OTROS SE ACOMENTERAN OBJETIVOS DE INDOLE METODOLOGICA DIRIGIDOS A PROVEERNOS DE LOS RECURSOS NECESARIOS PARA ACOMETER CON EXITO LAS TAREAS DE MODELIZACION Y OPTIMIZACION, ASI SE DESARROLLARAN METODOS DE ESTIMACION DE PARAMETROS Y DE OPTIMIZACION (APLICABLES A MODELOS EN FORMALISMOS GMA), DE SELECCION Y DISCRIMINACION DE LAS SOLUCIONES EQUIVALENTES QUE SURGEN DE LAS OPTIMIZACIONES MULTIOBJETIVO Y DE UN PROGRAMA QUE PERMITE LA REALIZACION SEMIAUTOMATICA DEL CONJUNTO DE OPERACIONES QUE VAN DESDE LA FORMULACION DEL MODELO A SU OPTIMIZACION, Modelización y optimización matemáticas\E. coli\succinato\L-carnitina\Biología de Sistemas\Ingeniería Metabólica

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