Descripción del proyecto
LA EXPRESION GENICA CLONAL VARIANTE ES UNA ESTRATEGIA DE SUPERVIVENCIA UTILIZADA POR NUMEROSOS ORGANISMOS PATOGENOS, ACTIVANDO Y SILENCIANDO LA EXPRESION DE CIERTOS GENES, LOS PARASITOS CONSIGUEN ADAPTARSE A LAS CONDICIONES VARIABLES DEL HOSPEDADOR Y ESCAPAR DE RESPUESTAS INMUNES ADQUIRIDAS, LA EXPRESION CLONAL VARIANTE FUE DESCRITA EN EL PARASITO DE LA MALARIA PLASMODIUM FALCIPARUM HACE MUCHOS AÑOS PARA LOS GENES VAR, UNA FAMILIA MULTIGENICA INVOLUCRADA EN CITOADHERENCIA DE ERITROCITOS INFECTADOS Y VARIACION ANTIGENICA, PERO NUESTRO TRABAJO RECIENTE HA DEMOSTRADO QUE LA EXPRESION CLONAL VARIANTE OCURRE EN MUCHAS OTRAS FAMILIAS GENICAS DE P, FALCIPARUM, ESTA OBSERVACION ABRE UN NUEVO CAMPO DE INVESTIGACION DE GRAN IMPORTANCIA PARA ENTENDER LA BIOLOGIA BASICA DE LAS RELACIONES PARASITO- HOSPEDADOR EN MALARIA, EL CONOCIMIENTO ACTUAL DE LOS MECANISMOS MOLECULARES DE REGULACION DE LA EXPRESION VARIANTE ES DESCRIPTIVO Y SE LIMITA BASICAMENTE A LOS GENES VAR, LAS MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES DE LAS COLAS N-TERMINALES DE LAS HISTONAS TIENEN UN PAPEL CLAVE EN DETERMINAR EL ESTADO TRANSCRIPCIONAL PERMISIVO O REPRESIVO DE LA CROMATINA, SE HAN DESCRITO LAS MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES ASOCIADAS AL ESTADO ACTIVO O SILENCIADO DE GENES BAJO EXPRESION VARIANTE, PERO NO SE SABE COMO SE REGULAN ESTAS MODIFICACIONES O COMO SE DIRIGEN A ZONAS CONCRETAS DEL GENOMA, EN ESTE PROYECTO, PROPONEMOS AÑADIR EPITOPOS (TAGS) A PROTEINAS ENDOGENAS DEL PARASITO QUE PARTICIPAN EN LA BIOLOGIA DE LA CROMATINA, COMO PUNTO DE PARTIDA PARA PURIFICAR COMPLEJOS MULTIPROTEICOS QUE REGULAN LAS MODIFICACIONES DE LA CROMATINA RESPONSABLES DEL ESTADO ACTIVO O SILENCIADO DE LOS GENES BAJO EXPRESION VARIANTE, TAMBIEN DETERMINAREMOS LA FRECUENCIA CON QUE SE PRODUCE DE MANERA ESPONTANEA LA TRANSICION ENTRE EL ESTADO ACTIVO Y SILENCIADO DE GENES BAJO EXPRESION VARIANTE PERTENECIENTES A DIFERENTES FAMILIAS MULTIGENICAS, PARA TAL FIN, UTILIZAREMOS MICROARRAYS, Y LAS TASAS DE ¿ENCENDIDO¿ Y ¿APAGADO¿ DE LOS GENES SE RELACIONARAN CON SU FUNCION, EL TAMAÑO DE LA FAMILIA GENICA A LA CUAL PERTENECEN, Y SU MECANISMO DE REGULACION, POR ULTIMO, EN ALGUNAS FAMILIAS GENICAS CON EXPRESION VARIANTE COMO VAR O CLAG 3, LA EXPRESION ES MUTUAMENTE EXCLUSIVA, EL MECANISMO DE LA EXPRESION MUTUAMENTE EXCLUSIVA ES UN ENIGMA, NOSOTROS PROBAREMOS LA HIPOTESIS DE QUE EXISTEN SECUENCIAS ACTIVADORAS DE LA TRANSCRIPCION (ENHANCERS) LIMITANTES DE COPIA UNICA RESPONSABLES DE QUE NO SE PUEDA EXPRESAR MAS DE UN MIEMBRO DE ESTAS FAMILIAS A LA VEZ,