Descripción del proyecto
LA REGULACION DE LA TRANSCRIPCION JUEGA UN PAPEL CLAVE EN LA BIOLOGIA DEL PARASITO PROTOZOO PLASMODIUM FALCIPARUM, QUE ES RESPONSABLE DE LAS FORMAS MAS SEVERAS DE LA MALARIA, TANTO LA PROGRESION DEL PARASITO A LO LARGO DE SU CICLO DE VIDA, COMO SU ADAPTACION A CAMBIOS EN LAS CONDICIONES DEL AMBIENTE, ESTAN REGULADOS PRINCIPALMENTE A NIVEL TRANSCRIPCIONAL, LA VARIABILIDAD TRANSCRIPCIONAL (CON BASE EPIGENETICA) DENTRO DE POBLACIONES ISOGENICAS DE PARASITOS JUEGA UN PAPEL FUNDAMENTAL EN LA ADAPTACION DE LOS PARASITOS A CAMBIOS EN SU ENTORNO Y REGULA PROCESOS TAN IMPORTANTES COMO LA EVASION DE LAS RESPUESTAS INMUNOLOGICAS, EL TRANSPORTE DE SOLUTOS, LA INVASION DE ERITROCITOS Y LA CONVERSION SEXUAL, ENTRE OTROS, MAS RECIENTEMENTE, SE HA DEMOSTRADO QUE LOS PARASITOS DE LA MALARIA SON CAPACES DE PRODUCIR RESPUESTAS TRANSCRIPCIONALES RAPIDAS PARA HACER FRENTE A CAMBIOS EN LAS CONDICIONES DE SU ENTORNO, PESE A LOS ENORMES PROGRESOS LOGRADOS EN LOS ULTIMOS AÑOS, QUEDAN MUCHAS PREGUNTAS FUNDAMENTALES SOBRE LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE REGULAN LA VARIABILIDAD EPIGENETICA Y LAS RESPUESTAS TRANSCRIPCIONALES DIRIGIDAS EN PARASITOS DE LA MALARIA, EN ESTE PROYECTO ABORDAREMOS ALGUNAS DE ESTAS PREGUNTAS, PRIMERO, CARACTERIZAREMOS EL PAPEL DE DISTINTOS ELEMENTOS GENETICOS (PROMOTORES Y SECUENCIAS CODIFICANTES) EN DETERMINAR QUE UN GEN MUESTRE EXPRESION CLONAL VARIANTE REGULADA A NIVEL EPIGENETICO, TENIENDO EN CUENTA QUE EL SILENCIAMIENTO EPIGENETICO QUE DETERMINA LA EXPRESION CLONAL VARIANTE ESTA MEDIADO POR FORMACION DE HETEROCROMATINA, ANALIZAREMOS EL PAPEL DE DISTINTOS ELEMENTOS EN LA NUCLEACION, EXPANSION Y MANTENIMIENTO DE LA HETEROCROMATINA, PARA ELLO, MANIPULAREMOS EL GENOMA DEL PARASITO UTILIZANDO TECNOLOGIA CRISPR-CAS9 Y LO ANALIZAREMOS MEDIANTE INMUNOPRECIPITACION DE CROMATINA SEGUIDA DE PCR CUANTITATIVA (CHIP-QPCR) O SECUENCIACION MASIVA (CHIP-SEQ), TAMBIEN PROBAREMOS LA HIPOTESIS DE QUE LA HETEROCROMATINA NO SE FORMA DE NUEVO CUANDO LOS GENES CON EXPRESION CLONAL VARIANTE SE SILENCIAN, NI SE DESMONTA TOTALMENTE CUANDO SE ACTIVAN, SINO QUE SE EXPANDE O CONTRAE DESDE RESERVORIOS PROXIMOS (MODELO DEL ACORDEON), PARA IDENTIFICAR LOS ENZIMAS ESPECIFICOS INVOLUCRADOS EN LA FORMACION Y DESMANTELAMIENTO DE HETEROCROMATINA, USAREMOS PROTEINAS DE FUSION BASADAS EN CAS9 CATALITICAMENTE INACTIVA (DCAS9) Y MARCAJE POR PROXIMIDAD SEGUIDO DE PROTEOMICA (BIOID), TAMBIEN ESTUDIAREMOS LOS CAMBIOS EN LA CROMATINA ASOCIADOS CON LA ACTIVACION DE GENES CON EXPRESION CLONAL VARIANTE Y DE GENES ACTIVADOS EN RESPUESTA A CAMBIOS EN LAS CONDICIONES DEL AMBIENTE, ADEMAS DE ESTUDIAR ASPECTOS GENERALES DE LA EXPRESION CLONAL VARIANTE, NOS CENTRAREMOS EN EL GEN CON EXPRESION CLONAL VARIANTE PFAP2-G Y EL PROCESO CONTROLADO POR ESTE GEN, LA CONVERSION SEXUAL, QUE DETERMINA LA FORMACION DE ESTADIOS TRANSMISIBLES, EN EL CASO DE LAS RESPUESTAS TRANSCRIPCIONALES DIRIGIDAS, NOS CENTRAREMOS PRINCIPALMENTE EN EL GEN PFAP2-HS Y LA RESPUESTA A CHOQUE TERMICO, POR ULTIMO, PARA IDENTIFICAR NUEVOS PROCESOS IMPORTANTES LIGADOS A VARIACION EPIGENETICA, PROBAREMOS LA HIPOTESIS DE QUE EL SILENCIAMIENTO DE LOS GENES CLAG3 INFLUYE EN LA FORMACION DE ESTADIOS QUIESCENTES, QUE JUEGAN UN PAPEL CLAVE EN LA RESISTENCIA DEL PARASITO A ARTEMISININA, EN CONJUNTO, ESPERAMOS QUE ESTE PROYECTO CONTRIBUIRA A AVANZAR DE MANERA IMPORTANTE LA COMPRENSION DE LOS MECANISMOS QUE REGULAN LA TRANSCRIPCION EN LOS PARASITOS DE LA MALARIA, SUS MECANISMOS DE ADAPTACION AL ENTORNO Y LA CONVERSION SEXUAL, MALARIA\PLASMODIUM FALCIPARUM\TRANSCRIPCION\EPIGENETICA\GAMETOCITOS\EXPRESION CLONAL VARIANTE\HETEROCROMATINA\HISTONAS\PFAP2-G\CHOQUE TERMICO