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BIO2015-64161-R

Financiado
APLICACION DE ESTRATEGIAS BASADAS EN SECUENCIACION DE GENOMAS PARA LA ACTIVACION...
APLICACION DE ESTRATEGIAS BASADAS EN SECUENCIACION DE GENOMAS PARA LA ACTIVACION DE LA PRODUCCION DE NUEVOS COMPUESTOS BIOACTIVOS EN ACTINOMICETOS LOS ACTINOMICETOS SON BACTERIAS GRAM-POSITIVAS PRODUCTORAS DE UN GRAN NUMERO DE METABOLITOS SECUNDARIOS BIOACTIVOS CON APLICACION EN MEDICINA, VETERINARIA Y AGRICULTURA, A PESAR DEL GRAN NUMERO DE COMPUESTOS COMERCIALIZADOS, EN LA... LOS ACTINOMICETOS SON BACTERIAS GRAM-POSITIVAS PRODUCTORAS DE UN GRAN NUMERO DE METABOLITOS SECUNDARIOS BIOACTIVOS CON APLICACION EN MEDICINA, VETERINARIA Y AGRICULTURA, A PESAR DEL GRAN NUMERO DE COMPUESTOS COMERCIALIZADOS, EN LA ACTUALIDAD HAY UNA CRECIENTE NECESIDAD DE NUEVOS COMPUESTOS, EN PARTICULAR ANTITUMORALES Y ANTIBIOTICOS, PARA HACER FRENTE A LA APARICION DE CEPAS BACTERIANAS O LINEAS CELULARES TUMORALES MULTIRRESISTENTES, NUEVAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS Y DISMINUIR LOS EFECTOS SECUNDARIOS DE LOS TRATAMIENTOS ACTUALES, LA SECUENCIACION DE GENOMAS DE ACTINOMICETOS ACOMPAÑADA DE SU ANALISIS (“MINERIA GENOMICA”) CONSTITUYE UNA ESTRATEGIA EN AUGE PARA LA IDENTIFICACION DE NUEVOS COMPUESTOS BIOACTIVOS, LA SECUENCIACION DE GENOMAS DE ACTINOMICETOS HA PUESTO DE MANIFIESTO QUE ESTOS MICROORGANISMOS PRESENTAN MULTIPLES AGRUPACIONES DE GENES (CLUSTERS) CON EL POTENCIAL DE SINTETIZAR 20-40 METABOLITOS SECUNDARIOS, ESTOS CLUSTERS SE DEFINEN EN LA MAYORIA DE LOS CASOS COMO CRIPTICOS (SE DESCONOCE A PRIORI EL METABOLITO QUE DETERMINAN Y ESTE NO HA SIDO DEFINIDO ANTERIORMENTE) O BIEN ADEMAS SE ENCUENTRAN SILENCIADOS EN CONDICIONES DE LABORATORIO, EL PRESENTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO GENERAL LA IDENTIFICACION DE CLUSTERS DE BIOSINTESIS DE METABOLITOS SECUNDARIOS SILENCIOSOS Y/O CRIPTICOS A PARTIR DE UNA COLECCION DE 100 ACTINOMICETOS AISLADOS DE HORMIGAS CORTADORAS DE HOJAS DE LA TRIBU ATTINI, PARA ALCANZAR ESTE OBJETIVO, EL PROYECTO SE SUBDIVIDE EN CUATRO APARTADOS: (A) AISLAMIENTO Y CARACTERIZACION DE NUEVOS COMPUESTOS BIOACTIVOS MEDIANTE LA ACTIVACION DE RUTAS SILENCIOSAS DE BIOSINTESIS; (B) BUSQUEDA DE NUEVAS RUTAS DE BIOSINTESIS SIGUIENDO CRITERIOS ESTRUCTURALES; (C) CARACTERIZACION DE LOS CLUSTERS SELECCIONADOS Y OBTENCION DE DERIVADOS; (D) PURIFICACION, CARACTERIZACION ESTRUCTURAL Y ACTIVIDAD BIOLOGICA DE LOS COMPUESTOS GENERADOS, LA REALIZACION DEL PRIMER APARTADO IMPLICARA (I) CARACTERIZAR EL PERFIL DE PRODUCCION DE COMPUESTOS BIOACTIVOS POR LOS ACTINOMICETOS UTILIZADOS; (II) DETERMINAR LA PRESENCIA DE COMPUESTOS CONOCIDOS EN LOS EXTRACTOS ANTERIORES (DESREPLICACION); (III) SELECCION DE CEPAS MANIPULABLES GENETICAMENTE Y NO PRODUCTORAS DE COMPUESTOS BIOACTIVOS PARA SECUENCIAR SUS CROMOSOMAS; (IV) MINERIA GENOMICA DE LOS CROMOSOMAS SECUENCIADOS PARA LA IDENTIFICACION DE CLUSTERS DE BIOSINTESIS NOVEDOSOS Y SUSCEPTIBLES DE SER ACTIVADOS; Y (V) ACTIVACION GENETICA DE LOS CLUSTERS SELECCIONADOS, LA REALIZACION DEL SEGUNDO APARTADO IMPLICARA (I) ANALISIS DE ACTINOMICETOS MEDIANTE PCR PARA DETECTAR LA PRESENCIA DE CLUSTERS DE BIOSINTESIS DE DESOXIAZUCARES Y/O HALOGENASAS; (II) SELECCION DE CEPAS POSITIVAS PARA LA SECUENCIACION DE SUS CROMOSOMAS; Y (III) SELECCION Y ACTIVACION DE CLUSTERS, LA REALIZACION DEL TERCER APARTADO IMPLICARA LA CARACTERIZACION DE ALGUNO DE LOS CLUSTERS SELECCIONADOS EN LOS APARTADOS A Y/O B, EL CUARTO APARTADO CONSTITUYE UNA METODOLOGIA HORIZONTAL QUE SE APLICARA A LOS TRES APARTADOS ANTERIORES E IMPLICARA LA IDENTIFICACION, PURIFICACION, CARACTERIZACION ESTRUCTURAL Y ACTIVIDAD BIOLOGICA DE LOS NUEVOS COMPUESTOS GENERADOS, DURANTE LA REALIZACION DE ESTE PROYECTO ESPERAMOS SECUENCIAR EL CROMOSOMA DE 4-6 ACTINOMICETOS E IDENTIFICAR AL MENOS 10-15 NUEVOS COMPUESTOS BIOACTIVOS, ACTINOMICETOS\STREPTOMYCES\ANTIBIÓTICOS\ANTITUMORALES\COMPUESTOS BIOACTIVOS\GLICOSILACIÓN\HALOGENACIÓN\MINERÍA GENÓMIC ver más
01/01/2015
UNIOVI
321K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 321K€
Líder del proyecto
Universidad de Oviedo No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Total investigadores 787