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Analysing the role of history chance and selection on the evolution of plasmid mediated antibiotic resistance Antimicrobial resistance (AMR) in bacteria is one of the main challenges faced by modern medicine and understanding its evolution is urgently required. As any other evolved trait, three fundamental evolutionary forces guide the ev... ver más

31/10/2022

FUNDACION PARA LA...

173K€

Presupuesto del proyecto: 173K€

Líder del proyecto

FUNDACION PARA LA INVESTIGACION BIOMEDICA DEL... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas asociacion

TRL 4-5 | 130K€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo H2020 notifico la concesión del proyecto el día 2022-10-31

MSCA-IF-2019: Individual Fellowships Objective:The goal of the Individual Fellowships is to enhance the creative and innovative potential...

I+D

Cerrada hace 5 años

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1 Participantes

FUNDACION PARA LA INVESTIGAC...

172.93K€ | Lider

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Duración del proyecto: 31 meses Fecha Inicio: 2020-03-24
Fecha Fin: 2022-10-31

Líder del proyecto

FUNDACION PARA LA INVESTIGACION BIOMEDICA DEL... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas asociacion

TRL 4-5 | 130K€

Presupuesto del proyecto 173K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto Antimicrobial resistance (AMR) in bacteria is one of the main challenges faced by modern medicine and understanding its evolution is urgently required. As any other evolved trait, three fundamental evolutionary forces guide the evolution of AMR: history, chance and selection. The specific role of each force determines whether, by what mechanism, and to what degree AMR evolves in a given population. Horizontal gene transfer is the main route for acquisition of AMR in bacterial pathogens and plasmids play a key role in the spread of resistant determinants. Of critical clinical importance is plasmid-mediated carbapenem-resistance in the Enterobacteriaceae family. The recurrent isolation of certain successful plasmid/bacterium associations in hospitals distributed worldwide is an example of how history and chance constrain the emergence of AMR. For example, pOXA-48 plasmid, encoding the OXA-48 carbapenemase, is frequently associated with the ST11 serotype of Klebsiella in hospitals around the world. Why is pOXA-48 restricted to a handful of clones if it can be mobilized to all K. pneumoniae serotypes? To answer this question, I am proposing a novel project that will analyze the impact of the three evolutionary forces in the evolution of plasmid-mediated AMR in clinical strains of K. pneumoniae. First, using experimental evolution and whole genome sequencing, I will quantitatively analyze the impact of each evolutionary force in AMR evolution. Also, I will study the adaptive mutational pathways leading to the compensation of plasmid-mediated costs. Then, I will use the novel high-throughput genetic screen CRISPRi, which allows silencing the expression of all chromosomal and plasmid genes one by one, to analyze the molecular basis determining the successful plasmid/bacterium associations. Altogether this cutting-edge proposal will greatly impact our ability to predict AMR evolution, paving the way for the development new intervention strategies to counteract AMR.

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