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BIO2010-17227

Financiado

ANALISIS POST-GENOMICO FUNCIONAL DE PSEUDOMONAS PUTIDA KT2440

LAS CEPAS DE PSEUDOMONAS PUTIDA SON BACTERIAS DE CRECIMIENTO RAPIDO QUE SE AISLAN FACILMENTE DE SUELOS Y AGUAS, Y EN PARTICULAR, DE SUELOS CONTAMINADOS, SON ORGANISMOS OPORTUNISTAS DESDE EL PUNTO DE VISTA NUTRICIONAL Y DEBIDO A SU... ver más

01/01/2010

CSIC

381K€

Presupuesto del proyecto: 381K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 381K€

Descripción del proyecto LAS CEPAS DE PSEUDOMONAS PUTIDA SON BACTERIAS DE CRECIMIENTO RAPIDO QUE SE AISLAN FACILMENTE DE SUELOS Y AGUAS, Y EN PARTICULAR, DE SUELOS CONTAMINADOS, SON ORGANISMOS OPORTUNISTAS DESDE EL PUNTO DE VISTA NUTRICIONAL Y DEBIDO A SU METABOLISMO VERSATIL, PARTICIPAN EN EL RECICLAJE DE MATERIA ORGANICA EN LA NATURALEZA, PSEUDOMONAS PUTIDA KT2440 ES UN MICROORGANISMO SAPROFITICO, MUY BIEN CARACTERIZADO FISIOLOGICA, BIOQUIMICA Y GENETICAMENTE, SIENDO UTILIZADO COMO MODELO EN ESTUDIOS DE BIORREMEDIACION Y COLONIZACION DE SISTEMAS RADICULARES DE PLANTAS, LA CEPA SOBREVIVE BIEN EN UN AMPLIO ESPECTRO DE CONDICIONES AMBIENTALES, EL GENOMA DE KT2440 ESTA FORMADO POR UN SOLO CROMOSOMA CIRCULAR DE 6181863 PARES DE BASES, Y SU ANOTACION INICIAL SUGERIA LA PRESENCIA DE 5420 ORFS, AUNQUE MAS DE LA MITAD SON HUERFANOS O ESTAN ANOTADOS EN TERMINOS MUY GENERICOS, POR EJEMPLO, REGULADOR TRANSCRIPCIONAL, DESHIDROGENASA ETC, EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES EL REALIZAR ENSAYOS PARA CARACTERIZAR A NIVEL FUNCIONAL Y GLOBAL EL GENOMA DE PSEUDOMONAS PUTIDA KT2440,PARA CONSEGUIR ESTE OBJETIVO PRINCIPAL, SE PROPONEN UNA SERIE DE OBJETIVOS ESPECIFICOS QUE SE DESARROLLAN EN FORMA DE ¿PAQUETES DE TRABAJO¿ LOS CUALES AYUDARAN A DESCIFRAR LA BIOLOGIA DE ESTE MICROORGANISMO MODELO, EL PROYECTO INTENTA APORTAR LA COLECCION MAS NUMEROSA Y COMPLETA DE MUTANTES DE P, PUTIDA KT2440, LA CUAL SERA DE UN ENORME INTERES PARA LA COMUNIDAD CIENTIFICA QUE TRABAJA CON BACTERIAS DEL GENERO PSEUDOMONAS, ESTE PROYECTO TRATARA DE ESTABLECER LA PRIMERA PLATAFORMA DE ENSAYOS QUE PERMITIRA ESTABLECER EL PERFIL FENOTIPICO DE LA CEPA PARENTAL, ESTA PLATAFORMA SERVIRA PARA ASIGNAR FUNCIONES A GENES CON FUNCION DESCONOCIDA EN BASE AL ANALISIS SERIADO DE MUTANTES, NOSOTROS TAMBIEN PLANEAMOS UNA APROXIMACION AL AREA DE ¿REDES¿ EN EL METABOLISMO MICROBIANO EN LA QUE SE PRETENDE DESCIFRAR LAS BASES MOLECULARES DE RUTAS METABOLICAS COMPLEJAS PARA LA DEGRADACION DE COMPUESTOS SIMPLES COMO SON LA FENILALANINA Y EL QUINATO, ADEMAS ESTE PROYECTO ESTABLECERA LAS BASES DE COMO LOS MECANISMOS DE TOLERANCIA A DROGAS ESTAN IMPLICADOS EN LA COLONIZACION DE LAS RAICES, TODOS ESTOS RESULTADOS APORTARAN UNA NUEVA PERSPECTIVA PARA ENTENDER EL METABOLISMO BASICO DE ESTE MICROORGANISMO,TAMBIEN PRETENDEMOS SENTAR LAS BASES DE LOS ANALISIS PAN-GENOMICOS DE CEPAS PERTENECIENTES A LA ESPECIE PSEUDOMONAS PUTIDA, PARA LO CUAL PROPONEMOS SECUENCIAR Y ANOTAR EL GENOMA DE TRES CEPAS DE ESTA ESPECIE CON POTENCIAL BIOTECNOLOGICO RELEVANTE, COMO SON LA DE TOLERANCIA A DISOLVENTES, PRODUCCION DE HORMONAS QUE FAVORECEN EL CRECIMIENTO DE PLANTAS Y DEGRADACION DE COMPUESTOS NITROORGANICOS, TAMBIEN SECUENCIAREMOS EL GENOMA DE UNA CEPA DE P, PUTIDA AISLADA DE UN ENFERMO CON FIBROSIS QUISTICA,POR TANTO, UNO DE LOS VALORES EXTRA DE ESTE PROYECTO ES QUE SE PODRA EXPLORAR EL POTENCIAL DE LA GENOMICA PARA DEFINIR LA CAPACIDAD EVOLUTIVA DE LAS BACTERIAS DE LA ESPECIE P, PUTIDA Y, COMO LA TRANSFERENCIA HORIZONTAL DE GENES INFLUYE EN EL CATABOLISMO Y POTENCIAL BIOTECNOLOGICO DE ESTE GRUPO DE BACTERIAS SAPROFITICAS,

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