ANALISIS FUNCIONAL DE LAS FORMAS DE SPLICING DE GENES DEL MHC DE CLASE III.
EL SPLICING ALTERNATIVO ES UN PROCESO QUE POSIBILITA LA GENERACION DE VARIOS TRANSCRITOS DIFERENTES A PARTIR DE UN UNICO LOCUS GENICO QUE PUEDEN SER TRADUCIDOS O NO, PRODUCIENDO PROTEINAS DIFERENTES O RNAS NO CODIFICANTES (NCRNAS)...
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Descripción del proyecto
EL SPLICING ALTERNATIVO ES UN PROCESO QUE POSIBILITA LA GENERACION DE VARIOS TRANSCRITOS DIFERENTES A PARTIR DE UN UNICO LOCUS GENICO QUE PUEDEN SER TRADUCIDOS O NO, PRODUCIENDO PROTEINAS DIFERENTES O RNAS NO CODIFICANTES (NCRNAS) CON POSIBLES PAPALES REGULADORES, INCREMENTANDO ASI LA DIVERSIDAD DEL PROTEOMA Y TRANSCRIPTOMA A PARTIR DE UN MISMO GENOMA O DE GENOMAS PARECIDOS, CADA VEZ SE CONOCEN MAS ENFERMEDADES PRODUCIDAS POR ALTERACIONES EN LA EXPRESION DE ISOFORMAS DE RNA GENERADAS POR UN DETERMINADO LOCUS, EL COMPLEJO MAYOR DE HISTOCOMPATIBILIDAD (MHC) HUMANO SE HA DESCRITO COMO LA REGION MAS IMPORTANTE DEL GENOMA DE VERTEBRADOS EN CUANTO A GENES IMPLICADOS EN INFECCION, AUTO-INMUNIDAD Y EN GENES RELACIONADOS CON LA RESPUESTA INMUNE TANTO INNATA COMO ADAPTADA, EN EL LABORATORIO TRABAJAMOS DESCRIBIENDO GENES DEL MHC DE CLASE III Y HEMOS ENCONTRADO GENES QUE PRESENTAN SPLICING ALTERNATIVO PRODUCIENDO RNAS CODIFICANTES Y NO-CODIFICANTES, ASI COMO RNAS QUIMERAS ENTRE GENES ADYACENTES O CERCANOS, TODOS ELLOS PRESENTANDO EXPRESION DIFERENCIAL EN TEJIDOS Y ORGANISMOS, DATOS PRELIMINARES DEL LABORATORIO NOS HAN INDICADO EN SANGRE DE PACIENTES CON ARTRITIS REUMATOIDE UN AUMENTO DE LA EXPRESION DE LAS ISOFORMAS DEL GEN NFKBIL1 (NUCLEAR FACTOR OF KAPPA LIGHT POLYPEPTIDE GENE ENHANCER IN B-CELLS INHIBITOR-LIKE 1) Y MAS EN CONCRETO DE UNA DE SUS ISOFORMAS (NFKBIL1V3), Y UNA DISMINUCION EN LA EXPRESION DE LAS ISOFORMAS DEL GEN NCR3 (NATURAL KILLER CELL RECEPTOR 3), AUNQUE MOSTRANDO UN AUMENTO EN LA EXPRESION DE LA ISOFORMA C Y UNA DISMINUCION EN LA A, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS ESTUDIAR EN DETALLE EL PAPEL DE LAS DIFERENTES FORMAS DE SPLICING DE LOS GENES NCR3, NFKBIL1, Y DE DOS MIEMBROS DE LA FAMILIA LY-6 (LY6G6D Y LY6G5B) DEL MHC DE CLASE III EN MUESTRAS DE SANGRE Y LIQUIDO SINOVIAL DE PACIENTES CON ARTRITIS REUMATOIDE, TAMBIEN CARACTERIZAREMOS LAS DIFERENTES ISOPROTEINAS Y PROTEINAS QUIMERAS PRODUCIDAS POR SPLICING DE ESTOS GENES PARA INTENTAR AVERIGUAR SUS ESPECIFICAS FUNCIONES Y LA DE SUS POSIBLES LIGANDOS, DE LOS TRANSCRITOS NO CODIFICANTES INTENTAREMOS AVERIGUAR SUS POSIBLES PAPELES REGULADORES, ES NECESARIO LLEVAR A CABO ESTUDIOS DETALLADOS QUE ANALICEN EN PROFUNDIDAD TODOS LAS PROTEINAS CODIFICADAS POR RNAS PROCEDENTES DE ISOFORMAS DE SPLICING GENERADOS POR UN MISMO GEN EN DIFERENTES ESPECIES Y TEJIDOS, ASI COMO DE TODAS LAS ISOFORMAS DE RNAS NO-CODIFICANTES (NCRNAS), PARA AYUDAR A ENTENDER COMO INFLUYE EL SPLICING ALTERNATIVO EN LA FLEXIBILIDAD GENICA, LA COMPLEJIDAD DEL TRANSCRIPTOMA Y DEL PROTEOMA, ASI COMO LA DIVERSIDAD ENTRE ESPECIES Y EL DESARROLLO DE PATOLOGIAS, SPLICING\MHC CLASE III\FUNCION DEL SPLICING\ARTRITIS REUMATOIDE\QUIMERAS RNA
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