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SAF2016-74891-R

Financiado

CARACTERIZACION DE ANKRD55, LOCUS DE RIESGO COMPARTIDO EN ENFERMEDAD AUTOINMUNE...

CARACTERIZACION DE ANKRD55, LOCUS DE RIESGO COMPARTIDO EN ENFERMEDAD AUTOINMUNE CON FUNCION DESCONOCIDA EL GEN ANKRD55 CONTIENE UNA VARIANTE INTRONICA POLIMORFICA QUE ESTA ASOCIADA CON VARIAS ENFERMEDADES AUTOINMUNES (ESCLEROSIS MULTIPLE, ENFERMEDAD DE CROHN, CELIAQUIA, ARTRITIS REUMATOIDE, DIABETES TIPO 2) CON SIGNIFICANCIA GENOME-... ver más

01/01/2016

UPV

109K€

Presupuesto del proyecto: 109K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DEL PAIS VASCO/EUSKAL HERRIKO UNI... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 45

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2016-01-01

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Participantes

UPV

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DEL PAIS VASCO/EUSKAL HERRIKO UNI...

Total investigadores 45

Presupuesto del proyecto 109K€

Descripción del proyecto EL GEN ANKRD55 CONTIENE UNA VARIANTE INTRONICA POLIMORFICA QUE ESTA ASOCIADA CON VARIAS ENFERMEDADES AUTOINMUNES (ESCLEROSIS MULTIPLE, ENFERMEDAD DE CROHN, CELIAQUIA, ARTRITIS REUMATOIDE, DIABETES TIPO 2) CON SIGNIFICANCIA GENOME-WIDE, Y QUE COINCIDE CON UN EQTL QUE REGULA FUERTEMENTE LA EXPRESION DE ANDRD55 EN PBMCS Y CELULAS T CD4+. LA(S) FUNCION(ES) DE LA(S) PROTEINA(S) ANKRD55 SON DESCONOCIDAS. EL LOCUS ANKRD55 ES COMPLEJO, Y NOSOTROS HEMOS RECIENTEMENTE INFORMADO QUE PRODUCE DOS PROTEINAS CODIFICANTES, Y UN RNA-NO CODIFICANTE LARGO (ISOFORMA DE LA PROTEINA COMPLETA 001, ISOFORMA DE PROTEINA MAS CORTA 005 & LNCRNA 007, RESPECTIVAMENTE). PROTEINAS CODIFICADAS POR LA ISOFORMA 001 Y 005 ESTAN EXPRESADAS UBICUAMENTE, Y MUESTRAN UN PATRON PREDOMINANTE DE LOCALIZACION NUCLEAR. ESTO SUGIERE QUE LAS PROTEINAS ANKRD55 PUEDEN SER CONSTITUYENTES DE UN COMPLEJO DE TRANSCRIPCION, ESTAR INVOLUCRADAS EN REESTRUCTURACION DE CROMATINA, EN ASPECTOS RELACIONADOS CON LA GESTION Y ARQUITECTURA NUCLEAR, O PUEDEN ACTUAR COMO PROTEINAS TRANSPORTADORAS PARA IMPORTE DE FACTORES NUCLEARES O DE TRANSCRIPCION EN EL NUCLEO. POR TANTO, ANKRD55 SEGURAMENTE CONTROLA O MODULA TANTO DIRECTAMENTE O INDIRECTAMENTE EL PATRON ESPECIFICO DE EXPRESION GENICA. ESTE PROYECTO SE ENFOCA EN DOS ESTRATEGIAS COMPLEMENTARIAS PARA CLARIFICAR LA FUNCION Y LA BIOLOGIA DE LOS PRODUCTOS DE EXPRESION DEL GEN DE RIESGO AUTOINMUNE ANKRD55: I.E. (I) IDENTIFICACION Y VALIDACION DE CAMBIOS GENOME-WIDE EN LA EXPRESION UTILIZANDO ANALISIS DE TRANSCRIPTOMA BASADOS EN RNA-SEQ EN CELULAS PRIMARIAS T CD4+ SALVAJES Y KNOCK-OUT Y LINEAS CELULARES RELEVANTES; (II) IDENTIFICACION DEL INTERACTOMA DE LA PROTEINA ANKRD55 A TRAVES DE CAPTURA DE AFINIDAD DE LAS ISOFORMAS 001 Y 005 CON ETIQUETAS (TAGGED) Y MASS SPEC DE PROTEINAS CO-PURIFICADAS. EL INTERACTOMA DE LNCRNA 007 SERA DETERMINADO MEDIANTE LA PURIFICACION DE RNA ANTISENSE (RAP). ESTAS TACTICAS COMBINADAS PROVEERAN INFORMACION COMPLEMENTARIA DE LAS VIAS BIOLOGICAS EN LAS CUALES PARTICIPA ANKRD55. ESTE PROYECTO CONLLEVARA TAMBIEN AL ENTENDIMIENTO DE ELEMENTOS ESPECIFICOS CELULARES O ELEMENTOS COMPARTIDOS DE LAS VIAS DE ANKRD55, Y DEBERIA REVELAR LAS BASES MOLECULARES DE COMO ANKRD55 CONTRIBUYE A LOS MECANISMOS DE AUTOINMUNIDAD EN CELULAS T CD4+, UNA CATEGORIA DE LINFOCITOS CRUCIAL CON VINCULACION DOCUMENTADA EN AUTOINMUNIDAD. NKYRIN\AUTOINMUNIDAD\ESCLEROSIS MÚLTIPLE\TRANSCIPTOMICS\ANKRD55

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