UN ABORDAJE COMPUTACIONAL VERIFICADO CON EXPERIMENTOS PARA ESTUDIAR LA PLASTICID...
UN ABORDAJE COMPUTACIONAL VERIFICADO CON EXPERIMENTOS PARA ESTUDIAR LA PLASTICIDAD CONFORMACIONAL DE LAS PROTEINAS Y SU MODULACION POR FARMACOS Y MUTACIONES.
LA PLASTICIDAD CONFORMACIONAL DE LAS PROTEINAS ES ESENCIAL EN LA MAYORIA DE LOS MECANISMOS DE CONTROL CELULAR, LA CARACTERIZACION DE LOS MECANISMOS MICROSCOPICOS DE DICHA PLASTICIDAD Y SU MODULACION POR FARMACOS Y MUTACIONES CONST...
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Descripción del proyecto
LA PLASTICIDAD CONFORMACIONAL DE LAS PROTEINAS ES ESENCIAL EN LA MAYORIA DE LOS MECANISMOS DE CONTROL CELULAR, LA CARACTERIZACION DE LOS MECANISMOS MICROSCOPICOS DE DICHA PLASTICIDAD Y SU MODULACION POR FARMACOS Y MUTACIONES CONSTITUYE UN GRAN RETO CON IMPLICACIONES OBVIAS EN DISTINTOS CAMPOS QUE ABRACAN DESDE LA BIOFISICA Y LA QUIMICA COMPUTACIONAL HASTA LA BIOLOGIA CELULAR, LA BIOLOGIA ESTRUCTURAL Y COMPUTACIONAL, Y EL DESCUBRIMIENTO DE FARMACOS,PARA LOGRAR UN ENTENDIMIENTO PROFUNDO DE LOS DETALLES ATOMICOS DE LA PLASTICIDAD CONFORMACIONAL, PROPONEMOS UN ABORDAJE COMPUTACIONAL MULTIPLE, GUIADO Y VERIFICADO CON EXPERIMENTOS DE RESONANCIA MAGNETICA NUCLEAR (RMN), EN PRIMER LUGAR UTILIZAREMOS NUESTROS NUEVOS ALGORITMOS BASADOS EN ENERGIA LIBRE PARA ENTENDER CUANTITATIVAMENTE LA PLASTICIDAD CONFORMACIONAL Y SU ALTERACION POR MUTACIONES EN UN CONJUNTO PEQUEÑO DE PROTEINAS SELECCIONADAS CON UN PAPEL BIEN CARACTERIZADO EN CONTROL CELULAR Y EN CANCER, ESTE CONJUNTO INCLUIRA LAS TIROSINA-QUINASAS C-SRC Y ABL, LAS QUINASAS DEPENDIENTES DE CICLINAS CDK-2, -4, Y -8, Y RECEPTORES DEL FACTOR DE CRECIMIENTO DE FIBROBLASTOS, A CONTINUACION VALIDAREMOS LOS RESULTADOS COMPUTACIONALES FRENTE A LOS EXPERIMENTOS DE RMN, LA DESCRIPCION CUANTITATIVA DETALLADA DE LA PLASTICIDAD EN LOS CASOS SELECCIONADOS SE UTILIZARA PARA DESARROLLAR UN MODELO RAPIDO Y PREDICTIVO DE LA PLASTICIDAD DE PROTEINAS BASADO EN SU ESTRUCTURA, EL USO EXPLICITO DE OBSERVABLES EXPERIMENTALES MARCARA UNA DIFERENCIA CRITICA CON OTROS MODELOS SIMPLIFICADOS COARSE-GRAIN DIRIGIDOS A LA DINAMICA BIO-MOLECULAR, ESTE NUEVO MODELO NOS PERMITIRA ESCALAR LA INVESTIGACION Y ESTUDIAR SISTEMATICAMENTE LA PLASTICIDAD CONFORMACIONAL Y SU ALTERACION EN DISTINTAS PROTEINAS DE INTERES BIOMEDICO,
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