Descripción del proyecto
LA COORDINACION DE PROCESOS CELULARES A NIVEL MOLECULAR REQUIERE LA FORMACION DE COMPLEJOS FUNCIONALES ENTRE BIOMOLECULAS Y DE SU REGULACION ESPACIO-TEMPORAL, NO OBSTANTE, Y A PESAR DE LAS EVIDENCIAS SOBRE LA IMPORTANCIA DE LA CINETICA EN ESTOS PROCESOS, LOS MECANISMOS FISICO-QUIMICOS QUE GOBIERNAN SU REGULACION TEMPORAL APENAS NOS SON CONOCIDOS, ESTO ES ESPECIALMENTE CIERTO PARA LOS PROCESOS DE UNION DE LIGANDOS A PROTEINAS, ASI COMO EN LOS PROCESOS EN LOS QUE INTERVIEN PROTEINAS QUE SE ENCUENTRAN DESESTRUCTURADAS EN CONDICIONES NATIVAS, ES DECIR, QUE NO TIENEN UNA ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DEFINIDA, ESTAS PROTEINAS SE CONOCEN COMO PROTEINAS INTRINSICAMENTE DESESTRUCTURADAS (IDPS),USANDO TECNICAS DE SIMULACION POR DINAMICA MOLECULAR, CALCULO MASIVO DISTRIBUIDO, PROGRAMAS DE CODIGO OPTIMIZADO Y TECNICAS AVANZADAS DE ANALISIS BASADAS EN MODELOS DE MARKOV, EN SU MAYORIA DESARROLLADOS POR MI GRUPO DE INVESTIGACION, HEMOS DEMOSTRADO EN UNA SERIE DE ESTUDIOS PILOTO LA POSIBILIDAD DE CARACTERIZAR PROCESOS CINETICOS A NIVEL MOLECULAR UNA VEZ ALCANZADO EL MILISEGUNDO DE TIEMPO DE SIMULACION, MODELOS MATEMATICOS PRELIMINARES MUESTRAN QUE A TRAVES DE LA MODULACION DE LA CINETICA DE UNION EN RUTAS COMPETITIVAS ES POSIBLE CONTROLAR EL EQUILIBRIO DE LOS COMPLEJOS, UN MECANISMO NUEVO Y POTENTE DE REGULACION, ESPECIALMENTE INTERESANTE EN PROTEINAS INTRINSECAMENTE DESESTRUCTURADAS, EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS INVESTIGAR LA RELEVANCIA Y GENERALIDAD DE LA MODULACION DE LA CINETICA EN PROCESOS MOLECULARES TANTO EN LA UNION DE COMPUESTOS QUIMICOS A SUS DIANAS COMO DE PROTEINAS INTRINSECAMENTE DESESTRUCTURADAS, SE USARAN, ADEMAS, ENSAYOS Y EXPERIMENTOS ESTANDAR A TRAVES DE NUESTROS COLABORADORES, HEMOS ESCOGIDO DIANAS DE GRAN INTERES TERAPEUTICO, TALES COMO EL SUPRESOR DE TUMOR P53 Y LAS PROTEINAS DESORDENADAS DE LA FAMILIA BCL-2, ASI COMO LIBRERIAS DE COMPUESTOS DE INTERES FARMACOLOGICO PROPORCIONADAS POR LA INDUSTRIA FARMACEUTICA, CINÉTICA MOLECULARES\SIMULACIONES MOLECULARES\MODELOS DE ESTADO DE MARKOV\MODULACIÓN DE LAS PROTEÍNAS INTRÍNSECAME