Descripción del proyecto
EL ESQUELETO DE LA EXTREMIDAD DE VERTEBRADOS ES UN MODELO PARADIGMATICO PARA ESTUDIAR COMO SE ENCUENTRA CODIFICADA LA FORMA EN EL GENOMA, EL ANALISIS GENETICO Y MOLECULAR EN ORGANISMOS MODELO, ASI COMO ESTUDIOS SOBRE LA ETIOLOGIA DE MALFORMACIONES CONGENITAS DE LA EXTREMIDAD EN HUMANOS, HAN PUESTO DE MANIFIESTO LAS FUNCIONES ESENCIALES DE MULTIPLES GENES Y VIAS DE SEÑALIZACION EN EL DESARROLLO DE LAS EXTREMIDADES, SIN EMBARGO, TODAVIA ESTAMOS LEJOS DE COMPRENDER COMO ESTOS GENES EVOLUTIVAMENTE CONSERVADOS SE ORGANIZAN EN GRANDES REDES DE REGULACION GENICA (RRG) QUE CONTROLAN LA FORMACION, CRECIMIENTO, POLARIZACION Y DIFERENCIACION CELULAR EN EL PRIMORDIO DE LA EXTREMIDAD EMBRIONARIA, AL MISMO TIEMPO, ESTAS RRG CONSERVAN UNA CIERTA PLASTICIDAD, DE MODO QUE ALTERACIONES EN LA EXPRESION GENICA (NIVELES O DINAMICA ESPACIO-TEMPORAL) SUBYACEN A LA APARICION EVOLUTIVA DE NUEVAS ANATOMIAS, ESTOS CAMBIOS EN LOS PATRONES DE EXPRESION GENICA SE PRODUCEN POR MUTACIONES CIS-REGULADORAS DENTRO DE LOS GRANDES PAISAJES GENOMICOS DONDE SE LOCALIZAN ESTOS GENES PLEIOTROPICOS EN EL DESARROLLO EMBRIONARIO, NO OBSTANTE, LA IDENTIFICACION DE ALTERACIONES REGULADORAS RESPONSABLES DE LA DIVERSIFICACION ANATOMICA DE LAS EXTREMIDADES EN DIFERENTES GRUPOS DE VERTEBRADOS CONSTITUYE UN GRAN DESAFIO, EN GRAN PARTE DEBIDO A LA SOLIDEZ TRANSCRIPCIONAL QUE CARACTERIZA A ESTAS RRG,EN ESTA PROYECTO UTILIZAREMOS UN ENFOQUE ORTOGONAL Y MULTIDISCIPLINAR PARA INVESTIGAR LOS MECANISMOS REGULADORES INVOLUCRADOS EN LA MORFOGENESIS Y LA EVOLUCION DE LA EXTREMIDAD DE MAMIFEROS: I) RECURRIREMOS A LA MULTIOMICA A NIVEL DE CELULA UNICA PARA CARACTERIZAR SIMULTANEAMENTE EL TRANSCRIPTOMA Y EL EPIGENOMA DURANTE EL DESARROLLO DE LA EXTREMIDAD EN RATON Y CERDO, ADEMAS, GENERAREMOS MAPAS DE CONTACTO DE PROMOTORES A PARTIR DE EXTREMIDADES EMBRIONARIAS DE AMBAS ESPECIES, LA INTERSECCION DE ESTOS DATOS Y OTROS YA DISPONIBLES PERMITIRA IDENTIFICAR CON PRECISION ALTERACIONES DE EXPRESION Y/O REGULACION GENICA EN SUBPOBLACIONES CELULARES CONCRETAS Y QUE PUEDEN HABER PARTICIPADO EN LA DIVERSIFICACION MORFOLOGICA DE LA EXTREMIDAD DE CERDO, EL CUAL, A DIFERENCIA DEL RATON, SE HA DESVIADO DEL PATRON PENTADACTILO PROTOTIPICO DE TETRAPODOS; II) CONTINUAREMOS LA DISECCION GENETICA EN EL RATON DEL PAISAJE REGULADOR DEL GEN PTCH1, QUE CODIFICA EL RECEPTOR PRINCIPAL DEL LIGANDO SHH, ESTOS ESTUDIOS NOS PERMITIRAN DEFINIR PRINCIPIOS GENERALES SOBRE COMO LA SOLIDEZ Y LA PLASTICIDAD TRANSCRIPCIONAL SE INTEGRAN EN LA REGULACION DE UN MODULADOR ESENCIAL DE LA SEÑALIZACION MORFOGENETICA DE SHH; III) POR ULTIMO, TAMBIEN ABORDAREMOS SI EXISTE UNA INTERACCION GENETICA ENTRE LAS VIAS DEL SHH Y FA-BRCA, LO QUE PODRIA EXPLICAR LOS DEFECTOS CONGENITOS DE LAS EXTREMIDADES QUE PRESENTAN LOS PACIENTES CON ANEMIA DE FANCONI, DE SER EL CASO, ESTOS EXPERIMENTOS IDENTIFICARIAN LA VIA DE HH COMO UNA NUEVA DIANA TERAPEUTICA POTENCIAL PARA TRATAR ESTA ENFERMEDAD MORTAL, DESARROLLO DE LA EXTREMIDAD\EVOLUCION MORFOLOGICA\REGULACION TRANSCRIPCIONAL\PTCH1\SHH\ANEMIA DE FANCONI\CERDO\RATON\MULTIOMICA A NIVEL DE CELULA UNICA\CRISPR-CAS9