Descripción del proyecto
TODOS LOS VERTEBRADOS COMPARTEN EL MISMO PLAN CORPORAL QUE SE CONSTRUYE DURANTE EL DESARROLLO EMBRIONARIO COMO RESULTADO DE DOMINIOS DE EXPRESIONES SIMILARES ENTRE ESPECIES DE LOS DENOMINADOS GENES DEL DESARROLLO, LOS CUALES CODIFICAN FACTORES DE TRANSCRIPCION Y MOLECULAS SEÑALIZADORAS, UNA VEZ DEFINIDO EL PLAN CORPORAL, VARIACIONES ENTRE LOS PATRONES DE LOS MISMOS GENES GENERA LAS DIFERENCIAS MORFOLOGICAS OBSERVADAS ENTRE LAS DIFERENTES ESPECIES, EN ESTADIOS EMBRIONARIOS EN LOS CUALES SE GENERA EL PLAN CORPORAL DE OTROS DEUTEROSTOMOS NO VERTEBRADOS, SE PUEDE OBSERVAR QUE MUCHOS DE ESTOS GENES DEL DESARROLLO PRESENTAN TAMBIEN DOMINIOS DE EXPRESION EQUIVALENTES A LOS OBSERVADOS EN VERTEBRADOS, ESTO INDICA LA EXISTENCIA DE ELEMENTOS ESTRUCTURALES COMUNES ENTRE ESTOS PLANES CORPORALES DE DEUTEROSTOMOS DERIVADOS DE DOMINIOS DE EXPRESION SIMILARES DE GENES HOMOLOGOS, LA EXPRESION GENICA DEPENDE DE REGIONES CIS-REGULADORAS QUE CONTROLAN DONDE, CUANDO Y CUANTO UN GEN DEBE TRANSCRIBIRSE, POR LO TANTO, PATRONES DE EXPRESION DE GENES DEL DESARROLLO SIMILARES A LO LARGO DE LA EVOLUCION DE DEUTEROSTOMOS DEPENDERA POSIBLEMENTE DE LA EXISTENCIA DE ELEMENTOS REGULADORES CONSERVADOS, EN LOS ULTIMOS AÑOS SE HA IDENTIFICADO UN GRAN NUMERO DE ELEMENTOS CIS-REGULADORES CONSERVADOS ENTRE VERTEBRADOS Y RESPONSABLES DE ACTIVAR A GENES DEL DESARROLLO EN DOMINIOS HOMOLOGOS, POR EL CONTRARIO, MUY POCAS DE ESTAS REGIONES SE HAN IDENTIFICADO CONSERVADAS CON OTROS DEUTOROSTOMOS, ESTO POSIBLEMENTE SE DEBE A QUE LOS CRITERIOS ALTAMENTE RESTRICTIVOS QUE SE UTILIZAN EN LAS BUSQUEDAS DE SECUENCIAS CONSERVADAS ENTRE ESPECIES QUIZAS NO DETECTEN SECUENCIAS FUNCIONALMENTE EQUIVALENTES PERO CON BAJOS NIVELES DE CONSERVACION, RECIENTEMENTE SE HA DEMOSTRADO QUE LA TECNOLOGIA DE CHIP-SEQ ES EXTREMADAMENTE POTENTE PARA IDENTIFICAR REGIONES CIS-REGULADORAS A ESCALA GENOMICA, ESTUDIOS REALIZADOS CON ESTA TECNOLOGIA HAN DEMOSTRADO QUE EXISTEN UNA SERIE DE MODIFICACIONES EPIGENOMICAS CARACTERISTICAS DE ELEMENTOS REGULADORES Y COMUNES A VERTEBRADOS A DROSOPHILA,EN ESTE PROYECTO PRETENDEMOS IDENTIFICAR ELEMENTOS CIS-REGULADORES FUNCIONALMENTE CONSERVADOS Y RESPONSABLES DE ACTIVAR GENES DE DESARROLLO EN DOMINIOS EQUIVALENTES A LO LARGO DE LA EVOLUCION DE DEUTEROSTOMOS, PARA ELLO, COMBINAREMOS ANALISIS DEL EPIGENOMA Y ESTUDIOS DE 4C-SEQ EN EMBRIONES DE DIFERENTES DEUTEROSTOMOS Y ENSAYOS DE ACTIVIDAD ENHANCER EN ZEBRAFISH, NUESTROS ESTUDIOS TAMBIEN PERMITIRAN IDENTIFICAR ELEMENTOS CIS-REGULADORES RESPONSABLES DE INNOVACIONES MORFOLOGICAS QUE HAN APARECIDO DURANTE LA EVOLUCION DE DEUTEROSTOMOS, ADEMAS, DETERMINAREMOS COMO LA INFORMACION REGULADORA SE ORGANIZA EN EL GENOMA Y CUANTO DE ESA ORGANIZACION ESTA CONSERVADA EVOLUTIVAMENTE, ADICIONALMENTE, CONTINUAREMOS CON NUESTROS ANALISIS PARA DETERMINAR COMO VARIA EL EPIGENOMA A LO LARGO DEL DESARROLLO DE VERTEBRADOS Y COMO ESTAS VARIACIONES SE ASOCIAN A TRANSICIONES DURANTE EL DESARROLLO, FINALMENTE, CONTINUAREMOS GENERANDO LINEAS MUTANTES DE ZEBRAFISH CON PAISAJES REGULATORIOS ALTERADOS E IDENTIFICANDO MUTACIONES EN ELEMENTOS CIS-REGULADORES ASOCIADOS A ENFERMEDADES HUMANAS, EPIGENOMA\ ELEMENTOS REGULADORES\ PAISAJES REGULADORES\ DESARROLLO\ VERTEBRADOS\ EVOLUCIÓN