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PID2021-126004NB-I00

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LA INTERACCION ENTRE LA EPIGENOMICA Y LA DIVERGENCIA GENOMICA EN LA EVOLUCION RE...

LA INTERACCION ENTRE LA EPIGENOMICA Y LA DIVERGENCIA GENOMICA EN LA EVOLUCION RECIENTE DE PRIMATES Y MAMIFEROS LA GENOMICA COMPARADA ES LA BASE DE MUCHOS DESCUBRIMIENTOS MOLECULARES DE INNOVACIONES ESPECIFICAS EN EL LINAJE HUMANO. SIN EMBARGO, LA MAYORIA DE LAS COMPARACIONES GENOMICAS A NIVEL EVOLUTIVO SE OBSERVAN EN LUGARES DEL GENOMA DON... ver más

01/01/2021

UPF

278K€

Presupuesto del proyecto: 278K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 321

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT POMPEU FABRA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 321

Presupuesto del proyecto 278K€

Descripción del proyecto LA GENOMICA COMPARADA ES LA BASE DE MUCHOS DESCUBRIMIENTOS MOLECULARES DE INNOVACIONES ESPECIFICAS EN EL LINAJE HUMANO. SIN EMBARGO, LA MAYORIA DE LAS COMPARACIONES GENOMICAS A NIVEL EVOLUTIVO SE OBSERVAN EN LUGARES DEL GENOMA DONDE ES MUY DIFICIL DEFINIR SU PAPEL REGULADOR. LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA DE PRIMATES Y MAMIFEROS ES UN CAMPO DE INVESTIGACION EN CRECIMIENTO QUE TIENE COMO OBJETIVO PRINCIPAL DESCIFRAR COMO LA INFORMACION DE UN SOLO GENOMA PUEDE CODIFICAR LA FUNCIONALIDAD DE CIENTOS DE TIPOS DE CELULAS DISTINTOS Y, EN EXTENSION, EXPLICAR LOS FUNDAMENTOS DE NUESTROS RASGOS UNICOS.EN MI LABORATORIO, HEMOS CONTRIBUIDO A LA COMPRENSION DE ESTA COREOGRAFIA REGULADORA UNICA COMPARANDO HUMANOS Y PRIMATES NO HUMANOS EN DIFERENTES FRENTES. SIN EMBARGO, EL CONOCIMIENTO SOBRE EL CONTROL DE LA EVOLUCION DE RASGOS EN ESPECIES EVOLUTIVAS CERCANAS A LOS HUMANOS TODAVIA SE LIMITA PRINCIPALMENTE A ORGANISMOS MODELO CON POCAS EXCEPCIONES.EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES, POR LO TANTO, LA CREACION DE UN CONJUNTO GLOBAL DE DATOS DE TRANSCRIPCION Y METILACION GLOBAL EN PRIMATES NO HUMANOS Y MAMIFEROS PARA COMPRENDER MEJOR LOS MECANISMOS GLOBALES DE REGULACION GENETICA GLOBAL EN HUMANOS Y EN DIVERSAS ESPECIES CERCANAS A NIVEL EVOLUTIVO, CON QUIEN COMPARTIMOS MUCHAS CARACTERISTICAS.PARA ELLO TRABAJAREMOS EN DOS NIVELES:OBJETIVO 1: ESTUDIAR EL GENOMA Y EL EPIGENOMA DE LOS PRIMATES ES UN ESFUERZO NECESARIO PARA DEFINIR LAS SIMILITUDES ENTRE LOS PRIMATES Y DETECTAR LAS SINGULARIDADES DE LOS HUMANOS. EN ESTA PARTE DEL PROYECTO, PROPONEMOS GENERAR DATOS DE RESECUENCIACION DEL GENOMA PARA UN GRAN PANEL DE PRIMATES Y GENERAR TAMBIEN INFORMACION EPIGENOMICA COINCIDENTE. LA INTEGRACION DE ESTOS DATOS GENOMICOS Y EPIGENOMICOS A TRAVES DE LA FILOGENIA DE PRIMATES NOS PERMITIRA EXPLORAR LA COEVOLUCION DE LA REGULACION EPIGENOMICA DE ELEMENTOS REGULADORES DE GENES CLAVE, COMO PROMOTORES Y POTENCIADORES, PARTICULARMENTE AQUELLOS QUE SON ORTOLOGOS A LOS DESCRITOS PREVIAMENTE EN HUMANOS. AL HACERLO, SE OBTENDRAN CONOCIMIENTOS FUNDAMENTALES SOBRE EL ESTUDIO DE LOS PRIMATES CON MULTIPLES RAMIFICACIONES PARA LA BIOLOGIA HUMANA.OBJETIVO 2: LOS ANALISIS EPIGENOMICOS HAN PERMITIDO LA IDENTIFICACION DE VIAS Y MECANISMOS REGULADORES IMPLICADOS EN EL COMPROMISO DEL DESTINO CELULAR Y TAMBIEN HAN DEMOSTRADO SER VALIOSOS EN LA ANOTACION FUNCIONAL DE VARIANTES REGULADORAS NO CODIFICANTES. HAY DISPONIBLES MAPAS DE ALTA RESOLUCION DE LAS INTERACCIONES DE LA CROMATINA EN TODO EL GENOMA EN UNA AMPLIA GAMA DE TEJIDOS HUMANOS, PERO HAY MUCHOS HUECOS EN LA GENERACION DE DATOS ANALOGOS EN ESPECIES ESTRECHAMENTE RELACIONADAS, CON ALGUNAS EXCEPCIONES PARA ESPECIES MODELO. EN ESTE SEGUNDO OBJETIVO, APROVECHAREMOS UN GRAN PANEL DE DIFERENTES MAMIFEROS DE ORGANISMOS NO MODELO, PARA GENERAR LA CARACTERIZACION MOLECULAR GLOBAL MAS COMPLETA DE ESTOS ANIMALES INCLUYENDO, GENOMA, TRANSCRIPTOMA Y DIFERENTES MARCADORES EPIGENOMICOS UTILIZANDO UNA COMBINACION DE TECNICAS. LA INTEGRACION DE ESTOS GRANDES CONJUNTOS DE DATOS MULTICAPA DE INFORMACION SERA CLAVE PARA ABORDAR LA CUESTION FUNDAMENTAL QUE PERMANECE EN EL CAMPO DE LA BIOLOGIA EVOLUTIVA: EN QUE MEDIDA LOS CAMBIOS GENOMICOS ESTAN VINCULADOS A PROCESOS REGULATORIOS QUE, AL FINAL, CONTRIBUYEN A EXPLICAR FENOTIPOS ESPECIFICOS. ENOMICA\EPIGENETICA Y EVOLUCION\TRANCRIPTOMICA\GENOMICA COMPARATIVA

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