Descripción del proyecto
PRESENTAMOS UNA PROPUESTA DE ESTUDIO DE FORMAS INUSUALES Y TENSIONADAS DE LOS ACIDOS NUCLEICOS, MEDIANTE EL USO DE TECNICAS DE SIMULACION ANALIZAREMOS ASPECTOS DE LOS ACIDOS NUCLEICOS, COMO LA RELACION ENTRE PROPIEDADES FISICAS, MODIFICACIONES EPIGENETICAS DEL DNA, POSICIONAMIENTO DE NUCLEOSOMAS Y REGULACION GENICA, ANALIZAREMOS LA RELACION DE SECUENCIA Y ESTRUCTURAS CON LAS PROPIEDADES CONDUCTIMETRICAS DEL DNA A FIN DE ESTUDIAR COMO LA CELULA RECONOCE DNA LESIONADOS, ESTUDIAREMOS LA ESTABILZACION DE FORMAS INUSUALES, COMO LOS TRIPLEX Y CUADRUPLEX POR BASES MODIFICADAS, ANALIZANDO EL IMPACTO BIOLOGICO DE LAS MISMAS A ESCALA GENOMICA, CREAREMOS UN ATLAS DINAMICO DE MOTIVOS ESTRUCTURALES DE RNA E INTENTAREMOS PREDECIR ESTRUCTURA TERCIARIA DE MOTIVOS DE RNA A PARTIR DE SIMULACION, EXTENDEREMOS NUESTROS ESTUDIOS SOBRE HIBRIDOS DNA¿RNA Y RNASE H A DUPLEXES RNA Y RISC, ANALIZANDO MODIFICACIONES EN LAS BASES Y ESQUELETO DE LOS ONAS QUE PUEDAN CONDUCIR A SIRNAS MAS EFECTIVOS, FINALMENTE Y LIGADO A LA OBTENCION DE TODOS ESTOS OBJETIVOS REALIZAREMOS UNA INTENSA LABOR DE DESARROLLO METODOLOGICO, CENTRADO PRINCIPALMENTE EN LA CREACION DE HERRAMIENTAS PARA EL ANALISIS MASIVO DE DINAMICAS DE MACROMOLECULAS, LOS ESTUDIOS ¿COARSE-GRAINED¿, LOS ANALISIS DE PROPIEDADES ELECTRONICAS EN MACROMOLECULAS, EL DOCKING DE PEQUEÑOS LIGANDOS Y MACROMOLECULAS A ACIDOS NUCLEICOS Y POR ULTIMO, PERFECCIONAREMOS TECNICAS PROPIAS PARA EL ESTUDIO DE PROPIEDADES FISICAS DE LOS ACIDOS NUCLEICOS, NUCLEIC ACIDS\DNA SIMULATION\BIOINFORMATICS\MOLECULAR DYNAMICS\COMPUTATIONAL BIOLOGY\GENOMIC ANALYSIS\DNA REGULATION