CONSECUENCIAS DE LA MODIFICACION DEL GENOMA CON UBIQUITINA SIMILARES
NUESTRO GENOMA ESTA FORMADO POR VARIAS MOLECULAS DE DNA CUYO ANDAMIAJE SON UNAS ESTRUCTURAS PROTEINICAS CON LAS CUALES, CONJUNTAMENTE, CONFORMAN LA CROMATINA. LA UNIDAD MAS ELEMENTAL DE LA CROMATINA SON LOS NUCLEOSOMAS, SOBRE LOS...
NUESTRO GENOMA ESTA FORMADO POR VARIAS MOLECULAS DE DNA CUYO ANDAMIAJE SON UNAS ESTRUCTURAS PROTEINICAS CON LAS CUALES, CONJUNTAMENTE, CONFORMAN LA CROMATINA. LA UNIDAD MAS ELEMENTAL DE LA CROMATINA SON LOS NUCLEOSOMAS, SOBRE LOS CUALES SE ENROLLAN 146 PARES DE BASES DE DNA Y QUE ESTA FORMADO POR DOS UNIDADES CADA UNA DE HISTONAS H3, H4, H2A Y H2B. OTRO TIPO DE HISTONA, LA HISTONA H1, ESTA PRESENTE EN LAS ZONAS MAS COMPACTAS DE NUESTRO GENOMA. ADEMAS, CADA UNO DE LOS DIFERENTES TIPOS DE HISTONA TIENEN DISTINTAS ISOFORMAS QUE PUEDEN COEXISTIR DENTRO DE UN MISMO NUCLEOSOMA, REPRESENTANDO MARCAS CARACTERISTICAS DE CIERTOS EVENTOS CELULARES Y PROVEYENDO DE HETEROGENICIDAD A LOS NUCLEOSOMAS.PARA MAS COMPLEJIDAD, LAS HISTONAS PUEDEN PRESENTAR MULTIPLES MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES, TALES COMO FOSFORILACIONES, METILACIONES O ACETILACIONES, ETC ESTAS MODIFICACIONES CONFIEREN LA INFORMACION EPIGENETICA QUE REGULA LA EXPRESION DE NUESTROS GENES Y LA ESTRUCTURA DE LA CROMATINA. MIENTRAS QUE ALGUNAS MARCAS TIENEN UNA FUNCION REPRESIVA O ACTIVADORA EN TERMINOS DE TRANSCRIPCION, OTRAS EN DETERMINADAS ISOFORMAS DE HISTONAS PUEDEN SEÑALIZAR DAÑOS EN EL DNA O EN FASES ESPECIFICAS DEL CICLO CELULAR.A DIFERENCIA DE MODIFICACIONES COMO LAS METILACIONES, ACETILACIONES, FOSFORILACIONES, O UBIQUITINACIONES, CUYA FUNCION ESTA RELATIVAMENTE BIEN ESTUDIADA, LA FUNCION DE OTRAS MODIFICACIONES DE HISTONAS COMO CROTONILACIONES O SUMOILACIONES ES POCO CONOCIDA.ESPECIFICAMENTE, EN ESTE PROYECTO, PRETENDO OBTENER MAS INFORMACION SOBRE LA FUNCION DE LA SUMOILACION DE DISTINTOS TIPOS DE HISTONAS E ISOFORMAS.LA SUMOILACION CONSISTE EN LA UNION DE SMALL UBIQUITIN-LIKE MODIFIERS (SUMOS) A LISINAS ACEPTORAS EN PROTEINAS DIANA. DETERMINAR QUE ENZIMAS MODIFICAN A QUE SUSTRATOS ES COMPLICADO, Y NO EXISTEN ANTICUERPOS ESPECIFICOS PARA HISTONAS SUMOILADAS. POR ESTAS Y OTRAS RAZONES, ESTE CAMPO DE INVESTIGACION HA PERMANECIDO RELATIVAMENTE INEXPLORADO.MEDIANTE EL USO DE TRAMPAS DE SUMO ACTIVO (SATTS) Y PROTEOMICA POR ESPECTROMETRIA DE MASAS, HEMOS SIDO CAPACES DE IDENTIFICAR LA SUMO LIGASA ESPECIFICA PARA MAS DE 2000 PROTEINAS, INCLUYENDO TIPOS E ISOFORMAS DE HISTONAS DETERMINADOS. A DIFERENCIA DE LOS MODELOS ACTUALES, NUESTROS DATOS INDICAN QUE LAS SUMO LIGASAS SON MUY ESPECIFICAS A NIVEL DE SUSTRATO. EN EL CASO DE LAS HISTONAS, ESTA ESPECIFICIDAD ALCANZA INCLUSO EL NIVEL DE ISOFORMA. ADEMAS, HEMOS SIDO CAPACES DE IDENTIFICAR LOS SITIOS ESPECIFICOS DE SUMOILACION PARA DETERMINADAS HISTONAS Y SU CROSS-TALK CON UBIQUITINA. FINALMENTE, OBSERVAMOS QUE LA SUMOILACION DE HISTONAS ACTUA DE MANERA DISTINTA EN CELULAS CANCEROSAS Y NO CANCEROSAS.EN ESTE PROYECTO DESARROLLAREMOS UNA SERIE DE HERRAMIENTAS QUE PERMITAN AMPLIAR NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE EL PAPEL DE LA SUMOILACION DE HISTONAS. USARE ESTRATEGIAS BASADAS EN PROTEOMICA POR ESPECTROMETRIA DE MASAS PARA DETERMINAR QUE PROTEINAS SON CAPACES DE LEER ESTAS MARCAS EPIGENETICAS EN LA CROMATINA. ESTAS ESTRATEGIAS SERAN ADEMAS APROVECHADAS PARA DETERMINAR EN QUE REGIONES DEL GENOMA SE PRODUCEN ESTAS MARCAS. CONJUNTAMENTE, DESARROLLARE UNA NUEVA APROXIMACION PROTEO-GENOMICA DE ALTO RENDIMIENTO QUE PODRA SER ADAPTADA A CUALQUIER OTRA PROTEINA ASOCIADA A LA CROMATINA EN EL FUTURO.TANTO LAS MODIFICACIONES DE HISTONAS COMO LA SUMOILACION SE HAYAN DESREGULADAS EN MUCHOS TIPOS DE TUMORES, LO CUAL OTORGA A LOS RESULTADOS DERIVADOS DE ESTE PROYECTO EL POTENCIAL DE TENER UN IMPACTO EN LA SALUD HUMANA. ROMATINA\CANCER\GENOMICA\ESPECTROMETRIA DE MASAS\PROTEOMICA\MODIFICACIONES DE HISTONAS\SUMO\UBIQUITINAver más
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