Descripción del proyecto
LOS VIRUS DE LA GRIPE TIPO A PERTENECEN A LA FAMILIA ORTHOMYXOVIRIDAE Y CONTIENEN UN GENOMA SEGMENTADO CON 8 MOLECULAS DE RNA DE CADENA SIMPLE Y POLARIDAD POSITIVA, LOS VIRUS DE LA GRIPE PRODUCEN EPIDEMIAS ANUALES Y PANDEMIAS OCASIONALES CON GRAN MORBILIDAD, QUE LLEVAN APAREJADO UN EXCESO DE MORTALIDAD, SU GENOMA ADOPTA LA FORMA DE COMPLEJOS RIBONUCLEOPROTEICOS (RNPS) EN LOS QUE EL RNA VIRAL SE ASOCIA A LA POLIMERASA Y A MONOMEROS DE NUCLEOPROTEINA, LA PROTEINA VIRAL NS1 ES UN FACTOR MULTIFUNCIONAL QUE REGULA LA REPLICACION DEL RNA VIRAL Y LA EXPRESION GENICA CELULAR Y VIRAL, Y ES ESENCIAL PARA EL BLOQUEO DE LA RESPUESTA CELULAR A LA INFECCION, EN ESTA PROPUESTA PLANTEAMOS CONTINUAR NUESTROS ESFUERZOS PARA ENTENDER LA ESTRUCTURA Y FUNCIONAMIENTO DE LA RNP VIRAL Y LA POLIMERASA INCLUIDA EN ELLA, ASI COMO EL PAPEL DE LAS INTERACCIONES VIRUS-CELULA DURANTE LA REPLICACION Y EXPRESION GENICA VIRAL, EN ESTE SENTIDO PROPONEMOS: (I) MEJORAR LA RESOLUCION DE LA ESTRUCTURA DE LA RNP Y DEL COMPLEJO DE LA POLIMERASA, QUE YA HEMOS DESCRITO, MEDIANTE EL USO DE CRIO-MICROSCOPIA ELECTRONICA, RECONSTRUCCION TRIDIMENSIONAL Y DOCKING DE LAS ESTRUCTURAS ATOMICAS DISPONIBLES, CON EL OBJETIVO FINAL DE GENERAR UN MODELO CUASI-ATOMICO DE LA RNP FUNCIONAL, (II) UTILIZAR LA NUEVA INFORMACION ESTRUCTURAL OBTENIDA PARA ANALIZAR LA FUNCIONALIDAD DE LA SEÑAL DE POLIADENILACION EN EL PROCESO DE TRANSCRIPCION, (III) IDENTIFICAR LAS FUNCIONES DE LOS FACTORES CELULARES, PREVIAMENTE IDENTIFICADOS POR PROTEOMICA DE COMPLEJOS DE POLIMERASA INTRACELULARES, MEDIANTE SILENCIAMIENTO DE LOS GENES CELULARES CORRESPONDIENTES, ADEMAS, DETERMINAREMOS EL MECANISMO POR EL QUE NS1 ALTERA LA MAQUINARIA CELULAR DE SPLICING, Y FINALMENTE, (IV) LLEVAR A CABO UN ANALISIS GENETICO PARA ESTUDIAR EL MECANISMO POR EL QUE EL VIRUS BLOQUEA LA RESPUESTA CELULAR MEDIADA POR IFN, MEDIANTE EL ESCRUTINIO DE UNA GENOTECA DE VIRUS MUTANTES EN LA PROTEINA NS1 Y TAMBIEN MEDIANTE INFECCIONES SERIADAS DE CELULAS DEFICIENTES EN LA RESPUESTA DE IFN Y ANALISIS DE LOS VIRUS RESULTANTES POR ULTRASECUENCIACION,