Descripción del proyecto
EL MAIZ ES UNO DE LOS CULTIVOS MAS IMPORTANTES DEL MUNDO. ESTA PROPUESTA TIENE COMO OBJETIVO MEJORAR NUESTRA COMPRENSION BASICA SOBRE LA ANTRACNOSIS DEL MAIZ, CAUSADA POR EL HONGO COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, UN PATOGENO ECONOMICAMENTE IMPORTANTE QUE CAUSA GRAVES PERDIDAS EN LA PRODUCCION DEL MAIZ EN MUCHAS PARTES DEL MUNDO. NUESTRO GRUPO ESTUDIA DIVERSOS ASPECTOS DE LA BIOLOGIA DE C. GRAMINICOLA, CON EL OBJETIVO DE MEJORAR NUESTRA COMPRENSION BASICA DE COMO LOS PATOGENOS INTERACTUAN CON SUS HUESPEDES. ESTE PROYECTO SE CENTRA EN LA EVOLUCION DEL GENOMA Y LA EVOLUCION DE LOS EFECTORES, PROTEINAS QUE PUEDEN MODULAR EL SISTEMA INMUNE DE LA PLANTA. ESTUDIAREMOS LOS EFECTORES QUE TIENEN SECUENCIAS REPETITIVAS, YA QUE TRABAJOS PREVIOS NUESTROS Y DE OTROS INVESTIGADORES HAN DEMOSTRADO QUE LA SECUENCIAS PROTEINAS QUE CONTIENEN ESTRUCTURAS DE REPETICION SON COMPONENTES IMPORTANTES DEL REPERTORIO DE LOS EFECTORES DE ORGANISMOS FITOPATOGENOS. ESTE PROYECTO SE CENTRA EN 4 OBJETIVOS PRINCIPALES: 1) SECUENCIAR CEPAS ADICIONALES DE C. GRAMINICOLA UTILIZANDO TECNOLOGIA DE SECUENCIACION DE LECTURA LARGA Y UTILIZAR LAS SECUENCIAS PARA IDENTIFICAR PROTEINAS QUE CONTIENEN REPETICIONES. REALIZAREMOS UN ANALISIS COMPARATIVO PARA COMPRENDER COMO EVOLUCIONAN LAS PROTEINAS QUE CONTIENEN ESTRUCTURAS DE REPETICION Y COMO ESTAS CONTRIBUYEN AL REPERTORIO DE EFECTORES. DURANTE NUESTRO TRABAJO CON ESTE TIPO DE EFECTORES, DESCUBRIMOS QUE LAS SECUENCIAS DEL GENOMA PREDICHAS PARA ESTOS GENES SE ENSAMBLARON INCORRECTAMENTE EN MUCHOS CASOS, LO CUAL ES UN PROBLEMA COMUN EN REGIONES REPETITIVAS DEL GENOMA. EL USO DE LA NUEVA TECNOLOGIA DE SECUENCIACION DE LECTURA LARGA CORREGIRA ESTE PROBLEMA. 2) REALIZAR EXPERIMENTOS PARA ESCLARECER LA FUNCION DE LAS REPETICIONES EN TANDEM EN LA PROTEINA CGEP1. 3) CARACTERIZAR CGEP4 INCLUYENDO LA CONSTRUCCION DE MUTANTES NULOS, SU COMPLEMENTACION, SU LOCALIZACION SUBCELULAR, ENSAYOS DE PATOGENICIDAD Y PERFILES TRANSCRIPCIONALES. ESTOS GENES PERTENECEN A UNA FAMILIA DE EFECTORES, UNO DE LOS CUALES CONTIENE REPETICIONES. REALIZAREMOS SU CARACTERIZACION GENETICA Y MOLECULAR PARA DILUCIDAR SUS FUNCION ESPECIFICA. 4) REALIZAR MUESTREOS DE C. GRAMINICOLA DENTRO DE UN CAMPO EN CROACIA Y DENTRO DE UN CAMPO EN ARGENTINA DURANTE UN PERIODO DE DOS AÑOS Y ANALIZAR LA ESTRUCTURA DE LA POBLACION. ESTE OBJETIVO PROPORCIONARA INFORMACION SOBRE LA DIVERSIDAD Y LOS CAMBIOS AÑO A AÑO EN LAS POBLACIONES DE C. GRAMINICOLA. UN CONOCIMIENTO PROFUNDO DE ESTOS PROCESOS ES INDISPENSABLE PARA EL DESARROLLO DE ESTRATEGIAS DE CONTROL EFECTIVAS. ESTE PROYECTO MULTIDISCIPLINARIO VINCULARA, LA GENOMICA COMPARATIVA, LA GENETICA DE POBLACIONES Y LA BIOLOGIA MOLECULAR PARA MEJORAR NUESTRA COMPRENSION DE LAS ENFERMEDADES DE LAS PLANTAS Y ABRIR NUEVAS VIAS PARA EL DESARROLLO DE ESTRATEGIAS DE CONTROL DE ENFERMEDADES. ITOPATOLOGIA\MAIZ\COLLETOTRICHUM\GENETICA DE POBLACIONES\INTERACCIONES PLANTA PATOGENO\GENOMICA