Descripción del proyecto
EL MAYOR DESAFIO QUE ENFRENTA LA AGRICULTURA MODERNA ES EL CONTROL DE LAS ENFERMEDADES DE LAS PLANTAS DE UNA MANERA QUE SEA SEGURA PARA LOS SERES HUMANOS Y EL MEDIO AMBIENTE, LAS PRACTICAS DE CONTROL QUE TENEMOS HOY EN DIA DEPENDEN DE FUNGICIDAS DE AMPLIO ESPECTRO QUE SE APLICAN EN GRANDES CANTIDADES, PROPORCIONANDO UNA FUERTE PRESION SELECTIVA QUE FAVORECE LA EVOLUCION DE LA RESISTENCIA EN LAS POBLACIONES DE PATOGENOS, LOS FUTUROS SISTEMAS AGRICOLAS DEBERAN TENER EN CUENTA LA EVOLUCION DE LOS PATOGENOS EN EL DISEÑO DE ESTRATEGIAS DE CONTROL DE ENFERMEDADES, EN ESTA PROPUESTA A TRAVES DE UN ENFOQUE MULTIDISCIPLINARIO MEJORAREMOS NUESTRO CONOCIMIENTO SOBRE LA EVOLUCION DE LA PATOGENICIDAD DE LOS HONGOS CAUSANTES DE LA ANTRACNOSIS Y DE LA FUNCION DE LOS GENES QUE CONTRIBUYEN A LA VIRULENCIA, LA ANTRACNOSIS ES CAUSADA POR MIEMBROS DEL GENERO DE HONGOS COLLETOTRICHUM, UNO DE LOS GRUPOS MAS COMUNES Y DESTRUCTIVOS DE HONGOS PATOGENOS DE PLANTAS, CAUSANDO DAÑOS EN CASI TODOS LOS CULTIVOS Y LOS ECOSISTEMAS NATURALES, NOS CENTRAREMOS EN EL ESTUDIO DE LOS GENES ESPECIFICOS A ESTIRPES Y CARACTERES QUE CONTRIBUYEN A LA VIRULENCIA, AL HACERLO, ESPERAMOS IDENTIFICAR LAS CARACTERISTICAS DEL GENERO Y/O ESPECIE CONCRETA QUE SE PUEDEN APROVECHAR PARA DESARROLLAR PRACTICAS DE MANEJO MAS SELECTIVAS, EN EL PRIMER OBJETIVO SE ESTUDIARA LA DIVERSIDAD GENETICA Y LA ESTRUCTURA DE LA POBLACION DEL HONGO CAUSANTE DE LA ANTRACNOSIS DE MAIZ, COLLETOTRICHUM GRAMINICOLA, SE UTILIZARA UNA TECNICA LLAMADA RAD-SEQ, QUE UTILIZA LA SECUENCIACION MASIVA PARA MUESTREAR MILES DE LOCI, SE UTILIZARA ESTA TECNICA PARA ESTUDIAR LA DIVERSIDAD GENETICA, LA RECOMBINACION, LA ESTRUCTURA DE LA POBLACION Y EL FLUJO DE GENES ENTRE POBLACIONES, TAMBIEN SE ASOCIARA LA VARIACION GENETICA CON CARACTERES FENOTIPICOS QUE SON IMPORTANTES PARA LA VIRULENCIA, EL CONOCIMIENTO DE LA ESTRUCTURA DE LA POBLACION, SI EXISTE LA MIGRACION ENTRE POBLACIONES Y SI HAY RECOMBINACION ES INDISPENSABLE PARA EL DESARROLLO DE ESTRATEGIAS DE CONTROL DURADERAS, EN EL SEGUNDO OBJETIVO SE UTILIZARA LA GENOMICA COMPARATIVA PARA ESTUDIAR LA EVOLUCION DE LA ESPECIFICIDAD DEL HOSPEDADOR Y LA REPRODUCCION SEXUAL EN UNA COLECCION BIEN CARACTERIZADA DE AISLADOS DEL COMPLEJO DE ESPECIES C, ACUTATUM, ESTOS HONGOS INFECTAN A UNA AMPLIA GAMA DE CULTIVOS DE IMPORTANCIA AGRICOLA, INCLUYENDO FRESA, OLIVOS, ALMENDROS Y OTROS, LOS DOS ULTIMOS OBJETIVOS USARAN TECNICAS DE GENETICA MOLECULARES Y CELULARES PARA CARACTERIZAR DOS EFECTORES PUTATIVOS DE C, GRAMINICOLA, LOS EFECTORES SON PROTEINAS PRODUCIDAS POR EL PATOGENO QUE MODULAN EL SISTEMA INMUNE DEL HUESPED, AMBAS PROTEINAS SON UNICAS A COLLETOTRICHUM Y EL ESTUDIO DE ELLOS PUEDEN DESCUBRIR ASPECTOS DE LA FISIOLOGIA DE HONGOS QUE SON UNICAS A ESTE GRUPO TAXONOMICO DE PATOGENOS, ESTOS COMPONENTES UNICOS DEL GENOMA DE COLLETOTRICHUM PUEDEN SER DIANAS PARA EL DESARROLLO DE NUEVAS ESTRATEGIAS DE CONTROL DE LA ANTRACNOSIS, A LO LARGO DE ESTE PROYECTO SE GENERARAN MATRICES DE DATOS DE GRAN TAMAÑO QUE RELACIONAN GENOTIPOS, POLIMORFISMOS Y LA EXPRESION DE GENES CON LOS GENES Y SUS FENOTIPOS, SE APLICARAN TECNICAS ESTADISTICAS TRADICIONALES Y SE DESARROLLARAN NUEVOS METODOS ANALITICOS PARA EXTRAER LA MAXIMA CANTIDAD DE INFORMACION DE ESTOS DATOS, ESTE ENFOQUE MULTIFACETICO ENLAZARA LA GENOMICA COMPARATIVA, GENETICA MOLECULAR Y ESTADISTICAS PARA MEJORAR NUESTRA CONOCIMIENTO DE LAS ENFERMEDADES DE PLANTAS Y ABRIR NUEVAS VIAS PARA EL DESARROLLO DE ESTRATEGIAS DE CONTROL DE ESTAS ENFERMEDADES, FILOGENÓMICA\GENÓMICA\EVOLUCIÓN\COLLETOTRICHUM\GENÉTICA DE HONGOS FITOPATÓGENOS