Descripción del proyecto
LOS MECANISMOS REGULATORIOS ORQUESTADOS POR RNAS NO CODIFICANTES SE HAN REVELADO EN LOS ULTIMOS AÑOS COMO UBICUOS EN TODOS LOS ORGANISMOS VIVOS, EL ESTUDIO DE ESTE NUEVO NIVEL DE REGULACION ES ACTUALMENTE TAN ACTIVO QUE CONSTANTEMENTE SE DESCRIBEN NUEVOS PROCESOS REGULADOS POR RNAS NO CODIFICANTES Y MECANISMOS NOVEDOSOS QUE HACEN QUE LO QUE SE SABE DE LA REGULACION MEDIADA POR ESTE TIPO DE MOLECULAS ESTE EN CONSTANTE REVISION, LAS CIANOBACTERIAS CONSTITUYEN UN GRUPO DE MICROORGANISMOS DE UNA GRAN RELEVANCIA ECOLOGICA Y MEDIOAMBIENTAL, DADO QUE SON RESPONSABLES DE UNA PARTE MUY SIGNIFICATIVA DE LA FIJACION DE CO2 Y LA PRODUCCION DE O2 EN NUESTRO PLANETA, LAS CIANOBACTERIAS EXHIBEN UNA ENORME VERSATILIDAD METABOLICA QUE RESULTA EN UNA GRAN CAPACIDAD DE ADAPTACION A CONDICIONES CAMBIANTES DE ILUMINACION, DISPONIBILIDAD DE NUTRIENTES, ETC,, INCLUYENDO EN MUCHOS CASOS LA CAPACIDAD DE FIJAR NITROGENO ATMOSFERICO, LO QUE SUPONE, DE HECHO, LA POSIBILIDAD DE FIJAR CO2 EN AMBIENTES EN LOS QUE EL NITROGENO ES UN NUTRIENTE LIMITANTE, ADEMAS, LAS CIANOBACTERIAS FILAMENTOSAS ESTAN ENTRE LAS POCAS BACTERIAS CAPACES DE LLEVAR A CABO UNA SERIE DE PROCESOS DE DIFERENCIACION CELULAR QUE RESPONDEN A DIVERSAS ESTRATEGIAS ENCAMINADAS A LA ADAPTACION A SITUACIONES DE ESTRES O CARENCIA NUTRICIONAL, ESTOS PROCESOS DE ADAPTACION Y DIFERENCIACION ESTAN BASADOS EN EL ESTABLECIMIENTO DE PATRONES DE EXPRESION GENICA DIFERENCIAL, QUE EN OCASIONES AFECTAN SOLO A DETERMINADAS CELULAS DEL FILAMENTO,LOS OBJETIVOS DE ESTE PROYECTO SON LLEVAR A CABO UNA IDENTIFICACION SISTEMATICA DE RNAS NO CODIFICANTES EN LA CIANOBACTERIA FILAMENTOSA ANABAENA SP, PCC 7120, ESTUDIAR EL PAPEL DE LA PROTEINA HFQ, UNA CHAPERONA DE RNAS, Y PROFUNDIZAR EN EL ANALISIS DE LA FUNCION DE UN RNA PEQUEÑO QUE YA HEMOS IDENTIFICADO (NSIR1), CUYA EXPRESION SE ACTIVA ESPECIFICAMENTE EN CELULAS QUE SE ESTAN DIFERENCIANDO COMO HETEROCISTOS (CELULAS ESPECIALIZADAS FUNCIONAL Y MORFOLOGICAMENTE PARA LA FIJACION DE NITROGENO ATMOSFERICO) Y QUE PODRIA ESTAR IMPLICADO EN LAS ETAPAS INICIALES DE LA SECUENCIA DE ACTIVACION TRANSCRIPCIONAL QUE CONTROLA ESTE PROCESO DE DIFERENCIACION CELULAR, TODOS ESTOS OBJETIVOS SE ENMARCAN EN EL OBJETIVO GLOBAL DE DESENTRAÑAR LOS MECANISMOS REGULATORIOS MEDIADOS POR RNAS NO CODIFICANTES EN CIANOBACTERIAS, CON UN INTERES ESPECIAL EN AQUELLOS IMPLICADOS EN LA REGULACION DE LA DIFERENCIACION CELULAR,LA IDENTIFICACION DE NUEVOS RNAS NO CODIFICANTES SE LLEVARA A CABO MEDIANTE UNA COMBINACION DE ESTRATEGIAS QUE INCLUYEN TANTO SECUENCIACION MASIVA DE RNA TOTAL AISLADO A PARTIR DE CELULAS EXPUESTAS A UN DETERMINADO ESTRES (TRANSCRIPTOMICA COMPARATIVA), COMO PREDICCIONES COMPUTACIONALES SOBRE LAS SECUENCIAS DE VARIOS GENOMAS COMPLETOS DISPONIBLES, LOS RNAS ASI IDENTIFICADOS SE CARACTERIZARAN EN CUANTO A SU EXPRESION EN RESPUESTA A DIVERSOS ESTRESES O MODIFICACIONES EN LAS CONDICIONES DE CULTIVO Y SE DETERMINARAN LAS DIANAS SOBRE LAS QUE PUDIERAN EJERCER UN PAPEL REGULATORIO,